seq1 = pF1KB8844.tfa, 1566 bp
seq2 = pF1KB8844/gi568815596r_80202254.tfa (gi568815596r:80202254_80403819), 201566 bp

>pF1KB8844 1566
>gi568815596r:80202254_80403819 (Chr2)

(complement)

1-1566  (100001-101566)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTTCCTGCTGCTCGGTCTCTGTCTATACTGGCTGCTGAGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTTCCTGCTGCTCGGTCTCTGTCTATACTGGCTGCTGAGGAGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGGGGTGGTCTTGTGTCTGCTGGGGGCCTGCTTTCAGATGCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGGGGTGGTCTTGTGTCTGCTGGGGGCCTGCTTTCAGATGCTGCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGCCCCCAGCGGGTGCCCGCAGCTGTGCCGGTGCGAGGGGCGGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGCCCCCAGCGGGTGCCCGCAGCTGTGCCGGTGCGAGGGGCGGCTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACTGCGAGGCGCTCAACCTCACCGAGGCGCCCCACAACCTGTCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACTGCGAGGCGCTCAACCTCACCGAGGCGCCCCACAACCTGTCCGGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGGCTTGTCCCTGCGCTACAACAGCCTCTCGGAGCTGCGCGCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGGGCTTGTCCCTGCGCTACAACAGCCTCTCGGAGCTGCGCGCCGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTTCACGGGGTTAATGCAGCTCACGTGGCTCTATCTGGATCACAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTTCACGGGGTTAATGCAGCTCACGTGGCTCTATCTGGATCACAATCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCTGCTCCGTGCAGGGGGACGCCTTTCAGAAACTGCGCCGAGTTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCTGCTCCGTGCAGGGGGACGCCTTTCAGAAACTGCGCCGAGTTAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTCACGCTGAGTTCCAACCAGATCACCCAACTGCCCAACACCACCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTCACGCTGAGTTCCAACCAGATCACCCAACTGCCCAACACCACCTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCCCATGCCCAACCTGCGCAGCGTGGACCTCTCGTACAACAAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCCCATGCCCAACCTGCGCAGCGTGGACCTCTCGTACAACAAGCTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCGCTCGCGCCCGACCTCTTCCACGGGCTGCGGAAGCTCACCACGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCGCTCGCGCCCGACCTCTTCCACGGGCTGCGGAAGCTCACCACGCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATGCGGGCCAACGCCATCCAGTTTGTGCCCGTGCGCATCTTCCAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATGCGGGCCAACGCCATCCAGTTTGTGCCCGTGCGCATCTTCCAGGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCGCAGCCTCAAGTTTCTCGACATCGGATACAATCAGCTCAAGAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCGCAGCCTCAAGTTTCTCGACATCGGATACAATCAGCTCAAGAGTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCGCGCAACTCTTTCGCCGGCTTGTTTAAGCTCACCGAGCTGCACCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCGCGCAACTCTTTCGCCGGCTTGTTTAAGCTCACCGAGCTGCACCTCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCACAACGACTTGGTCAAGGTGAACTTCGCCCACTTCCCGCGCCTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCACAACGACTTGGTCAAGGTGAACTTCGCCCACTTCCCGCGCCTCATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCTGCACTCGCTCTGCCTGCGGAGGAACAAGGTGGCCATTGTGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCTGCACTCGCTCTGCCTGCGGAGGAACAAGGTGGCCATTGTGGTCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCGCTGGACTGGGTTTGGAACCTGGAGAAAATGGACTTGTCGGGCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCGCTGGACTGGGTTTGGAACCTGGAGAAAATGGACTTGTCGGGCAACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATCGAGTACATGGAGCCCCATGTGTTCGAGACCGTGCCGCACCTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATCGAGTACATGGAGCCCCATGTGTTCGAGACCGTGCCGCACCTGCAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCTGCAGCTGGACTCCAACCGCCTCACCTACATCGAGCCCCGGATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCTGCAGCTGGACTCCAACCGCCTCACCTACATCGAGCCCCGGATCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACTCTTGGAAGTCCCTGACAAGCATCACCCTGGCCGGGAACCTGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACTCTTGGAAGTCCCTGACAAGCATCACCCTGGCCGGGAACCTGTGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTGCGGGCGCAACGTGTGTGCCCTAGCCTCGTGGCTCAACAACTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TTGCGGGCGCAACGTGTGTGCCCTAGCCTCGTGGCTCAACAACTTCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGCGCTACGATGGCAACTTGCAGTGCGCCAGCCCGGAGTACGCACAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGCGCTACGATGGCAACTTGCAGTGCGCCAGCCCGGAGTACGCACAGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGGACGTCCTGGACGCCGTGTACGCCTTCCACCTGTGCGAGGATGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGGACGTCCTGGACGCCGTGTACGCCTTCCACCTGTGCGAGGATGGGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGAGCCCACCAGCGGCCACCTGCTCTCGGCCGTCACCAACCGCAGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGAGCCCACCAGCGGCCACCTGCTCTCGGCCGTCACCAACCGCAGTGATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGGGCCCCCTGCCAGCTCGGCCACCACGCTCGCGGACGGCGGGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGGGCCCCCTGCCAGCTCGGCCACCACGCTCGCGGACGGCGGGGAGGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CAGCACGACGGCACATTCGAGCCTGCCACCGTGGCTCTTCCAGGCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CAGCACGACGGCACATTCGAGCCTGCCACCGTGGCTCTTCCAGGCGGCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCACGCCGAGAACGCCGTGCAGATCCACAAGGTGGTCACGGGCACCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCACGCCGAGAACGCCGTGCAGATCCACAAGGTGGTCACGGGCACCATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCCTCATCTTCTCCTTCCTCATCGTGGTCCTGGTGCTCTACGTGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCCTCATCTTCTCCTTCCTCATCGTGGTCCTGGTGCTCTACGTGTCCTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGTGTTTCCCAGCCAGCCTCAGGCAGCTCAGACAGTGCTTTGTCACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAGTGTTTCCCAGCCAGCCTCAGGCAGCTCAGACAGTGCTTTGTCACGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GCGCAGGAAGCAAAAGCAGAAACAGACCATGCATCAGATGGCTGCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCGCAGGAAGCAAAAGCAGAAACAGACCATGCATCAGATGGCTGCCATGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CTGCCCAGGAATACTACGTTGATTACAAACCGAACCACATTGAGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CTGCCCAGGAATACTACGTTGATTACAAACCGAACCACATTGAGGGAGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTGGTGATCATCAACGAGTATGGCTCGTGTACCTGCCACCAGCAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTGGTGATCATCAACGAGTATGGCTCGTGTACCTGCCACCAGCAGCCCGC

   1550     .    :    .
   1551 GAGGGAATGCGAGGTG
        ||||||||||||||||
 101551 GAGGGAATGCGAGGTG