seq1 = pF1KB8841.tfa, 1425 bp
seq2 = pF1KB8841/gi568815575r_78556996.tfa (gi568815575r:78556996_78758420), 201425 bp

>pF1KB8841 1425
>gi568815575r:78556996_78758420 (ChrX)

(complement)

1-1425  (100001-101425)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGAGGACTTAGCAGCCTCCTATATTGTTCTGAAATTGGAGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGAGGACTTAGCAGCCTCCTATATTGTTCTGAAATTGGAGAATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATTCGGCAGGCTCAAGTGCAGTGGCTGATGGAAGAAAATGCTGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATTCGGCAGGCTCAAGTGCAGTGGCTGATGGAAGAAAATGCTGCTCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCCAGATCCCAGAGCTTCAGAAGTCCCAAGCAGCCAAGGAGTATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCCAGATCCCAGAGCTTCAGAAGTCCCAAGCAGCCAAGGAGTATGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTACTCCGAAAGTCCTCAGAGGCCAAGGAGCCCCAGAAGCTCCCAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTACTCCGAAAGTCCTCAGAGGCCAAGGAGCCCCAGAAGCTCCCAGAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGAATCCCCCAGCAGCCTGGGAGGCCCAAAAGACCCCAGAGTTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGAATCCCCCAGCAGCCTGGGAGGCCCAAAAGACCCCAGAGTTCAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AACCCCAGAAGCCACCAGAGCCACAGGATCTTCTACCCTGGGAACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AACCCCAGAAGCCACCAGAGCCACAGGATCTTCTACCCTGGGAACCCCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAGCCTGGGAACTCCAGGAGGCCCCAGCAGCCCCAGAGTCCCTGGCGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100301 GCAGCCTGGGAACTCCAGGAGGCCCCAGCAGCCCCAGAGTCCCTGGCGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCCAGCAACCCGGGAGTCCCAGAAACCTCCAATGGCCCATGAGATCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCCAGCAACCCGGGAGTCCCAGAAACCTCCAATGGCCCATGAGATCCCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGTCTTGGAGGGCCAGGGGCCTGCAAACACCCAGGATGCCACAATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGTCTTGGAGGGCCAGGGGCCTGCAAACACCCAGGATGCCACAATAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAAGAGCCCAAGAATTCAGAACCCCAGGATCCCCCAAATATTGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAAGAGCCCAAGAATTCAGAACCCCAGGATCCCCCAAATATTGAGAAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGGAGGCACCAGAATACCAGGAAACTGCAGCACAGCTAGAGTTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCAGGAGGCACCAGAATACCAGGAAACTGCAGCACAGCTAGAGTTCCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCTTCCACCTCCCCAGGAGCCTCTGGAGCCTTCAAATGCCCAGGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCTTCCACCTCCCCAGGAGCCTCTGGAGCCTTCAAATGCCCAGGAATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTAGAACTCTCAGCAGCCCAGGAGTCCCTGGAGGGTCTAATAGTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTAGAACTCTCAGCAGCCCAGGAGTCCCTGGAGGGTCTAATAGTTGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GACATCAGCAGCTTCAGAGTTTCCACAGGCCCCTATTGGGTTAGAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GACATCAGCAGCTTCAGAGTTTCCACAGGCCCCTATTGGGTTAGAGGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGATTTCCCCCTGCAATACACTTTAACCTTCAGTGGAGATTCCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGATTTCCCCCTGCAATACACTTTAACCTTCAGTGGAGATTCCCAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTCCTGAGTTCCTGGTTCAGCTGTATAGTTACATGAGAGTCAGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTCCTGAGTTCCTGGTTCAGCTGTATAGTTACATGAGAGTCAGAGGGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTGTATCCCACTGAAGCAGCCCTGGTGAGCTTTGTTGGCAATTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTGTATCCCACTGAAGCAGCCCTGGTGAGCTTTGTTGGCAATTGCTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CAGGTAGGGCAGGATGGTGGTTCCAGCTCTTACTGGATATCCAAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CAGGTAGGGCAGGATGGTGGTTCCAGCTCTTACTGGATATCCAAAGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTACTGGAGCAATGTGAAAGTTTCATACCTGTGCTCCAGGATACTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTACTGGAGCAATGTGAAAGTTTCATACCTGTGCTCCAGGATACTTTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TAATCCAGAAAACATGAAAGATGCCAACCAGTGCATCCATCAACTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TAATCCAGAAAACATGAAAGATGCCAACCAGTGCATCCATCAACTCTGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGGGGAGGGTCATGTAGCAACCCACTTCCACCTCATTGCTCAAGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGGGGAGGGTCATGTAGCAACCCACTTCCACCTCATTGCTCAAGAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AACTGGGATGAAAGCACTCTCTGGATCCAATTTCAAGAAGGTCTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AACTGGGATGAAAGCACTCTCTGGATCCAATTTCAAGAAGGTCTTGCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TTCTATACAAGATGAACTGTCTCACACAAGCCCAGCCACCAACCTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TTCTATACAAGATGAACTGTCTCACACAAGCCCAGCCACCAACCTATCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ATCTCATCACTCAGTGCATCAGCCTGGAAGAGAAGCCTGATCCCAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ATCTCATCACTCAGTGCATCAGCCTGGAAGAGAAGCCTGATCCCAATCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTAGGGAAAAGTTCCTCTGCAGAGGGAGATGGACCCGAGAGTCCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTAGGGAAAAGTTCCTCTGCAGAGGGAGATGGACCCGAGAGTCCACCAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGAAAACCAACCTATGCAGGCTGCAATCAACTGCCCACACATCAGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGAAAACCAACCTATGCAGGCTGCAATCAACTGCCCACACATCAGTGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTGAATGGGTCCGTTGGCACAAAGGCCGCTTATGCCTCTACTGTGGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTGAATGGGTCCGTTGGCACAAAGGCCGCTTATGCCTCTACTGTGGTTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCTGGTCATTTTGCCAGAGATTGCCCTGTCAAGCCTCATCAGGCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCTGGTCATTTTGCCAGAGATTGCCCTGTCAAGCCTCATCAGGCCCTGCA

   1400     .    :    .    :    .
   1401 GGCGGGAAACATCCAGGCCTGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||
 101401 GGCGGGAAACATCCAGGCCTGCCAG