seq1 = pF1KB8838.tfa, 1389 bp
seq2 = pF1KB8838/gi568815575r_126451220.tfa (gi568815575r:126451220_126652608), 201389 bp

>pF1KB8838 1389
>gi568815575r:126451220_126652608 (ChrX)

(complement)

1-1389  (100001-101389)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGCAGCAAACAGGTAGCAGGAAACGGAAAGCGCCCGCGGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAGCAGCAAACAGGTAGCAGGAAACGGAAAGCGCCCGCGGTCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGGCGCCGAGAGCTCGCCGTCGCAGGGCTTGGCGGCAGCGGACGGTG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGACGCCGAGAGCTCGCCGTCGCAGGGCTTGGCGGCAGCGGACGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGGCCGCTGCTACTCAAGAGGCAGAGGCGGCCGGCGACGTATCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGGCCGCTGCTACTCAAGAGGCAGAGGCGGCCGGCGACGTATCGCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGCGCACTATCTGAAGGTTCGGGAGGTAGGCGGGTGGGGCCCCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGCGCACTATCTGAAGGTTCGGGAGGTAGGCGGGTGGGGCCCCGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCCAGGGCTTCGATGGCGAGCTGCGGGGCTACGCGGTACAGAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCCAGGGCTTCGATGGCGAGCTGCGGGGCTACGCGGTACAGAGGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGAGCTGCTGACGGAGCGCCAACTGGAGCTGGGCACGGTCAACAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGAGCTGCTGACGGAGCGCCAACTGGAGCTGGGCACGGTCAACAAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCGCGTCACAGTGGCTGAACTCCAGGCAGGTGGTGTGCGGCACCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCGCGTCACAGTGGCTGAACTCCAGGCAGGTGGTGTGCGGCACCAAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAACACGCTTTTCGTGGTGGACGTGGAGTCAGGCCACATCGCGCGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAACACGCTTTTCGTGGTGGACGTGGAGTCAGGCCACATCGCGCGCATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCTCTTGCGGGACAGTGAGGCCAGGCTGGCCCAGGACCAACAGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCTCTTGCGGGACAGTGAGGCCAGGCTGGCCCAGGACCAACAGGGCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCATCCATGCCATCGAGCTGAATCCCTCCAAGACGCTTCTGGCCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCATCCATGCCATCGAGCTGAATCCCTCCAAGACGCTTCTGGCCACCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGGCGAAAACCCCAACAGCCTGGCCATCTACCAGCTGCCCTCCCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGGCGAAAACCCCAACAGCCTGGCCATCTACCAGCTGCCCTCCCTGGATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTGTGCCTGGGCGACCGCCATGGCCACAAGGACTGGATCTTCGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTGTGCCTGGGCGACCGCCATGGCCACAAGGACTGGATCTTCGCCGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCTGGCTGAGTGACACCGTAGCCGTGAGCGGCTCCCGCGACGGCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCTGGCTGAGTGACACCGTAGCCGTGAGCGGCTCCCGCGACGGCACTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCGCTGTGGCGGATGGACCCGGACAAGTTCGATGACACTGTTGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCGCTGTGGCGGATGGACCCGGACAAGTTCGATGACACTGTTGCCTGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATAGCGAGGTGGGTCTCCCCGTATATGCCCACATCCGTCCGAGGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATAGCGAGGTGGGTCTCCCCGTATATGCCCACATCCGTCCGAGGGATGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGGCCATCCCCAGGGCCATCATCAACCCCAGTAACCGCAAGGTGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGGCCATCCCCAGGGCCATCATCAACCCCAGTAACCGCAAGGTGCGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTGGCCTGCGGCGGCAAGAACCAGGAACTGGGAGCGGTGTCCTTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTGGCCTGCGGCGGCAAGAACCAGGAACTGGGAGCGGTGTCCTTGGACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTACTTCCACCTGTGGAAAGCCGGGAGCGCACTATCCAGGCTGCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCTACTTCCACCTGTGGAAAGCCGGGAGCGCACTATCCAGGCTGCTGTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCAGGCTGCCCTACTTCCGGGATAATGTGTGCCTGACCTACTGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCAGGCTGCCCTACTTCCGGGATAATGTGTGCCTGACCTACTGTGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TATGTCTGTGTACGCCGTGGGCTCCCATTCCCACGTCTCTTTCCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TATGTCTGTGTACGCCGTGGGCTCCCATTCCCACGTCTCTTTCCTGGATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCGCCAGGACCAGCAGAACATCCGGCCCCTGTGTTCTCGAGAGGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCGCCAGGACCAGCAGAACATCCGGCCCCTGTGTTCTCGAGAGGGTGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ACAGGCGTGCGGTCGCTGAGCTTCTACCGCCACATCATCACTGTGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ACAGGCGTGCGGTCGCTGAGCTTCTACCGCCACATCATCACTGTGGGCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGGTCAGGGCTCCCTGCTCTTCTATGACGTCCGGGCCCAGAAATTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGGTCAGGGCTCCCTGCTCTTCTATGACGTCCGGGCCCAGAAATTCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGGAAAGAGCCTCCGCCACCCTGGAGTCCTCTTCGGGACCTGCAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGGAAAGAGCCTCCGCCACCCTGGAGTCCTCTTCGGGACCTGCAAGGAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGCTCAGGCTTGCCTGTGGCAGAGGCTGGCTCAACCACAATGATTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGCTCAGGCTTGCCTGTGGCAGAGGCTGGCTCAACCACAATGATTTCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGTGAATTACTTTGGTGGCATGGAAGTGTTTCCCAATGCGCTCTACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGTGAATTACTTTGGTGGCATGGAAGTGTTTCCCAATGCGCTCTACACCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACTGCTACAACTGGCCTGAGATGAAGCTCTTTGTGGCTGGGGGGCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACTGCTACAACTGGCCTGAGATGAAGCTCTTTGTGGCTGGGGGGCCTCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1351 CCTGCAGGCCTCCATGGGAACTATGCAGGCCTCTGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCTGCAGGCCTCCATGGGAACTATGCAGGCCTCTGGAGC