seq1 = pF1KB8837.tfa, 1389 bp
seq2 = pF1KB8837/gi568815579f_43618559.tfa (gi568815579f:43618559_43819947), 201389 bp

>pF1KB8837 1389
>gi568815579f:43618559_43819947 (Chr19)

1-1389  (100001-101389)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTACTTCAAAGTTGCCCGTGGTGCCTGGGGAGGAGGAAAACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTACTTCAAAGTTGCCCGTGGTGCCTGGGGAGGAGGAAAACACCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTATGGCCAAGGAAAGGCTGGAGGCCCTGCGCACAGCCTTTGAGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTATGGCCAAGGAAAGGCTGGAGGCCCTGCGCACAGCCTTTGAGTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGACCTCCCCCAGGCCGCCTCTCACCTCCAGGAGCTGCTGGCCTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGACCTCCCCCAGGCCGCCTCTCACCTCCAGGAGCTGCTGGCCTCCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAAGCATCCGCCTGGAGGTGGGCGTCACGGGCGAGTCGGGCGCGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAAGCATCCGCCTGGAGGTGGGCGTCACGGGCGAGTCGGGCGCGGGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCCTCCCTCATCAATGCCCTGCGTGGCCTGGAGGCCGAGGACCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCCTCCCTCATCAATGCCCTGCGTGGCCTGGAGGCCGAGGACCCTGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCTCTCACGGGCGTCATGGAGACCACGATGCAACCGTCGCCCTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGCTCTCACGGGCGTCATGGAGACCACGATGCAACCGTCGCCCTATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACCCACAGTTCCCTGACGTGACCCTCTGGGACCTGCCAGGAGCCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CACCCACAGTTCCCTGACGTGACCCTCTGGGACCTGCCAGGAGCCGGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCCAGGCTGCCCGGCTGACAAGTACCTAAAGCAGGTAGACTTCAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCCAGGCTGCCCGGCTGACAAGTACCTAAAGCAGGTAGACTTCAGCCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGACTTCTTCCTGCTGGTCTCCCCCCGCCGCTGCGGGGCCGTCGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGACTTCTTCCTGCTGGTCTCCCCCCGCCGCTGCGGGGCCGTCGAGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCCTGGCCGCTGAGATCCTGTGCCAGGGCAAGAAGTTCTACTTTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCCTGGCCGCTGAGATCCTGTGCCAGGGCAAGAAGTTCTACTTTGTGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACCAAGGTGGACGAGGACCTGGCGGCCACGCGCACCCAGCGGCCGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACCAAGGTGGACGAGGACCTGGCGGCCACGCGCACCCAGCGGCCGTCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTTCAGAGAGGCCGCTGTCCTGCAGGAGATCCGAGACCACTGTGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTTCAGAGAGGCCGCTGTCCTGCAGGAGATCCGAGACCACTGTGCCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGGCTGCGGGAGGCCGGCGTGGCTGACCCTCGCATCTTCCTGGTGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGCTGCGGGAGGCCGGCGTGGCTGACCCTCGCATCTTCCTGGTGTCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCTCGCCGGCCCGCTACGACTTTCCCACGCTGGTGTCCACCTGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTCTCGCCGGCCCGCTACGACTTTCCCACGCTGGTGTCCACCTGGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGACCTGCCCTCCCACCGGCGCCACGCTGGCCTGCTGTCGCTCCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACGACCTGCCCTCCCACCGGCGCCACGCTGGCCTGCTGTCGCTCCCCGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTCGCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGAAGGCCATGCTTCAAGAGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCTCGCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGAAGGCCATGCTTCAAGAGCAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCAAGACCGCCCTGGTGTTGGGCGTCATCCAGGCCCTGCCGGTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCAAGACCGCCCTGGTGTTGGGCGTCATCCAGGCCCTGCCGGTCCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGCTGGCGGCCGCCTACGATGATGCGTTGCTCATCCACTCACTGCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGCTGGCGGCCGCCTACGATGATGCGTTGCTCATCCACTCACTGCGTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TACCACCGCAGCTTTGGTCTGGACGACGACTCGCTGGCCAAGCTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TACCACCGCAGCTTTGGTCTGGACGACGACTCGCTGGCCAAGCTGGCCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAGGTGGGCAAACAGGCAGGTGACCTGCGCTCGGTCATCCGCTCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAGGTGGGCAAACAGGCAGGTGACCTGCGCTCGGTCATCCGCTCCCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGGCCAACGAGGTCTCGCCTGAGACTGTCCTGCGGCTCTATTCCCAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGGCCAACGAGGTCTCGCCTGAGACTGTCCTGCGGCTCTATTCCCAGTCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCCGACGGCGCCATGCGGGTGGCCCGCGCCTTTGAGAGGGGCATCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCCGACGGCGCCATGCGGGTGGCCCGCGCCTTTGAGAGGGGCATCCCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GTTTGGGACGCTGGTGGCTGGCGGCATCAGCTTTGGCGCTGTCTACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GTTTGGGACGCTGGTGGCTGGCGGCATCAGCTTTGGCGCTGTCTACACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGCTCCAGGGCTGCCTCAACGAGATGGCTGAGGACGCCCAGCGTGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGCTCCAGGGCTGCCTCAACGAGATGGCTGAGGACGCCCAGCGTGTCCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATCAAGGCCCTGGAGGATGACGAGCCGCAGCCGGAGGTCAGCTTGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATCAAGGCCCTGGAGGATGACGAGCCGCAGCCGGAGGTCAGCTTGGAAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGCCAGTGACAATGGCGTGGAAAAGGGGGGCTCCGGGGAGGGAGGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGCCAGTGACAATGGCGTGGAAAAGGGGGGCTCCGGGGAGGGAGGTGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGAAGCCCCACTCTCAACCTGCAGGAAGCTCGGCCTCCTTCTTAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGAAGCCCCACTCTCAACCTGCAGGAAGCTCGGCCTCCTTCTTAAGTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1351 ATTCTGGACAGCTGGAAGAAACACGACTCAGAAGAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATTCTGGACAGCTGGAAGAAACACGACTCAGAAGAGAAA