seq1 = pF1KB8836.tfa, 1383 bp
seq2 = pF1KB8836/gi568815593f_178831314.tfa (gi568815593f:178831314_179032696), 201383 bp

>pF1KB8836 1383
>gi568815593f:178831314_179032696 (Chr5)

1-1383  (100001-101383)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAGGGAAGGTATCTGGCATTCTACTCTAGGGGAAACCTGGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAGGGAAGGTATCTGGCATTCTACTCTAGGGGAAACCTGGGAACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAATAATTGGTTAGAGGGACAACAGGATAGTCATCTGAGCCAAGTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAATAATTGGTTAGAGGGACAACAGGATAGTCATCTGAGCCAAGTGGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTACCCATAAGGAAACCTTCACTGAGATGAGAGTATGTGGAGGTAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTACCCATAAGGAAACCTTCACTGAGATGAGAGTATGTGGAGGTAATGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGAAAGATGTTCCAGTCAGGATTCAATCCTTGATACACAGCAAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGAAAGATGTTCCAGTCAGGATTCAATCCTTGATACACAGCAAAGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCTATGGTAAAAAGGCCCCATAACTGTAATTCACATGGAGAAGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCTATGGTAAAAAGGCCCCATAACTGTAATTCACATGGAGAAGATGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CACAAAATTCTGAGTTAATTAAAACTCAAAGAATGTTTGTAGGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CACAAAATTCTGAGTTAATTAAAACTCAAAGAATGTTTGTAGGAAAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCTATGAATGTAATCAGTGCAGCAAAACCTTCAGTCAGAGCTCATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCTATGAATGTAATCAGTGCAGCAAAACCTTCAGTCAGAGCTCATCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCTTAAGCACCAGAGGATTCATACTGGGGAGAAACCCTATAAGTGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCTTAAGCACCAGAGGATTCATACTGGGGAGAAACCCTATAAGTGTAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TATGTGGGAAACACTTCATTGAACGATCCTCCCTTACTGTACATCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TATGTGGGAAACACTTCATTGAACGATCCTCCCTTACTGTACATCAAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAGTCAGAGCATGAATCTTACTGTCCATCAACGAACTCACACTGGAGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100501 TAGTCAGAGCATGAATCTTACTGTCCATCAACGAACTCACACCGGAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACCCTATCAGTGTAAAGAGTGTGGCAAAGCCTTCCATAAGAATTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AACCCTATCAGTGTAAAGAGTGTGGCAAAGCCTTCCATAAGAATTCATCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTATTCAGCATGAAAGGATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTTATTCAGCATGAAAGGATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAATGTGGTAAAGCTTTTACCCAAAGCATGAATTTGACAGTTCATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGAATGTGGTAAAGCTTTTACCCAAAGCATGAATTTGACAGTTCATCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAACTCATACAGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAACTCATACAGGAGAAAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGAAAAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCAGTCAAAGCATGCATCTTATTGTACATCAGAGAAGCCATACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCAGTCAAAGCATGCATCTTATTGTACATCAGAGAAGCCATACTGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAAACCCTATGAGTGTAGTCAATGTGGAAAAGCCTTTAGTAAGAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAAACCCTATGAGTGTAGTCAATGTGGAAAAGCCTTTAGTAAGAGCTCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTCTTACCCTACATCAGCGAAATCACACTGGAGAAAAACCTTACAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTCTTACCCTACATCAGCGAAATCACACTGGAGAAAAACCTTACAAATGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACAAATGCGGGAAATCCTTTAGCCAAAGTACATATCTTATAGAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACAAATGCGGGAAATCCTTTAGCCAAAGTACATATCTTATAGAACATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAGACTTCATTCTGGAGTAAAACCTTTTGAATGTAACGAGTGTGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAGACTTCATTCTGGAGTAAAACCTTTTGAATGTAACGAGTGTGGAAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CTTTCAGTAAGAATTCATCTCTAACTCAACATCGGAGAATTCACACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CTTTCAGTAAGAATTCATCTCTAACTCAACATCGGAGAATTCACACTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGAAACCTTATGAGTGTATGGTGTGTGGAAAACATTTCACTGGACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGAAACCTTATGAGTGTATGGTGTGTGGAAAACATTTCACTGGACGATC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ATCCCTTACCGTGCATCAGGTCATTCACACTGGAGAGAAACCTTATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ATCCCTTACCGTGCATCAGGTCATTCACACTGGAGAGAAACCTTATGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCAATGAATGTGGAAAGGCATTCAGCCAGAGTGCTTACCTTATTGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCAATGAATGTGGAAAGGCATTCAGCCAGAGTGCTTACCTTATTGAACAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CAAAGAATTCATACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTGATCAGTGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CAAAGAATTCATACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTGATCAGTGTGGAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGCCTTCATTAAGAATTCATCCCTTACAGTGCATCAGAGAACTCATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGCCTTCATTAAGAATTCATCCCTTACAGTGCATCAGAGAACTCATACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GAGAGAAACCCTATCAGTGTAATGAATGCGGAAAAGCCTTCAGCCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GAGAGAAACCCTATCAGTGTAATGAATGCGGAAAAGCCTTCAGCCGGAGT

   1350     .    :    .    :    .    :
   1351 ACAAACCTTACACGACATCAAAGAACTCATACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ACAAACCTTACACGACATCAAAGAACTCATACG