seq1 = pF1KB8835.tfa, 1377 bp
seq2 = pF1KB8835/gi568815592r_31799929.tfa (gi568815592r:31799929_32001305), 201377 bp

>pF1KB8835 1377
>gi568815592r:31799929_32001305 (Chr6)

(complement)

1-1377  (100001-101377)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCTGGGGTGGAAGTCCTGCGCTTCCAGCTGCCCGGCCACGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCTGGGGTGGAAGTCCTGCGCTTCCAGCTGCCCGGCCACGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCAACGCTACGGAACATGAACCAGCTCCGGGCAGAGGAGCGGTTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCAACGCTACGGAACATGAACCAGCTCCGGGCAGAGGAGCGGTTCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGTGACCATTGTGGCCGACAGCCTCAAGTTTCGAGGCCACAAGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGTGACCATTGTGGCCGACAGCCTCAAGTTTCGAGGCCACAAGGTCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGCCGCCTGCTCACCCTTCCTGCGGGACCAGTTCCTGCTGAACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGCCGCCTGCTCACCCTTCCTGCGGGACCAGTTCCTGCTGAACCCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCGGAGCTGCAGGTCTCCCTGATGCACAGTGCACGCATCGTGGCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCGGAGCTGCAGGTCTCCCTGATGCACAGTGCACGCATCGTGGCCGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTCCTCTCCTGCTACACGGGCGCCTTGGAATTCGCTGTTAGGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTCCTCTCCTGCTACACGGGCGCCTTGGAATTCGCTGTTAGGGACATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCAACTACCTTACAGCCGCCTCCTACCTGCAGATGGAGCACGTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCAACTACCTTACAGCCGCCTCCTACCTGCAGATGGAGCACGTGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAATGCCGGAATGCCCTCAGCCAGTTCATTGAGCCCAAAATAGGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAATGCCGGAATGCCCTCAGCCAGTTCATTGAGCCCAAAATAGGCCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGAGGATGGGGTCAGTGAGGCTAGCCTTGTGAGCAGCATCAGCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGAGGATGGGGTCAGTGAGGCTAGCCTTGTGAGCAGCATCAGCGCCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGTCCCTCCTCCCTCCAGCCAGGACCCCAAAGCCAGCCCCGAAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGTCCCTCCTCCCTCCAGCCAGGACCCCAAAGCCAGCCCCGAAGCCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACCCCCACCTCCTCTACCCCCTCCACTCCTGCGGCCAGTGAAGCTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACCCCCACCTCCTCTACCCCCTCCACTCCTGCGGCCAGTGAAGCTGGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCCACTGGATGAAGACTTGGAGCTGAAAGCCGAGGAAGAGGATGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCCACTGGATGAAGACTTGGAGCTGAAAGCCGAGGAAGAGGATGAGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGATGAGGACGTGTCTGACATCTGCATCGTCAAGGTGGAGTCGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGGATGAGGACGTGTCTGACATCTGCATCGTCAAGGTGGAGTCGGCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGGTGGCACACCGGCTCAAACCCCCTGGAGGCCTGGGAGGGGGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAGGTGGCACACCGGCTCAAACCCCCTGGAGGCCTGGGAGGGGGTCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCATTGGAGGCTCCGTGGGTGGCCACCTTGGGGAGCTGGCCCAGAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCATTGGAGGCTCCGTGGGTGGCCACCTTGGGGAGCTGGCCCAGAGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTCCCCCCAGCACTGTAGCCCCACCGCAGGGTGTGGTGAAGGCCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTTCCCCCCAGCACTGTAGCCCCACCGCAGGGTGTGGTGAAGGCCTGCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAGCCTGTCGGAAGATGCAGAAGGGGAGGGCCTGCTGTTGATTCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAGCCTGTCGGAAGATGCAGAAGGGGAGGGCCTGCTGTTGATTCCCGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCGGGCCAGCGTGGGGGCCACCTCGGGCCTGGTGGAAGCAGCAGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCGGGCCAGCGTGGGGGCCACCTCGGGCCTGGTGGAAGCAGCAGCGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCATGGCTGCCCGGGGGGCGGGGGGCAGCCTGGGGGCGGGGGGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCATGGCTGCCCGGGGGGCGGGGGGCAGCCTGGGGGCGGGGGGCAGCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGGACCCCTGCCTGGGGGCTTCTCAGGTGGAAACCCCTTAAAGAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGGACCCCTGCCTGGGGGCTTCTCAGGTGGAAACCCCTTAAAGAACATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTGCACCAAGTGCCCGGAAGTGTTCCAGGGCGTGGAGAAGCTGGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTGCACCAAGTGCCCGGAAGTGTTCCAGGGCGTGGAGAAGCTGGTCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CACATGCGGGCGCAGCACTTCATCTTCATGTGCCCTCGCTGTGGCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CACATGCGGGCGCAGCACTTCATCTTCATGTGCCCTCGCTGTGGCAAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GTTCAACCACAGCAGCAACCTCAACCGCCACATGAACGTGCATCGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GTTCAACCACAGCAGCAACCTCAACCGCCACATGAACGTGCATCGTGGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TCAAGTCACACTCGTGCGGCATCTGCGGCAAGTGCTTCACACAGAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TCAAGTCACACTCGTGCGGCATCTGCGGCAAGTGCTTCACACAGAAGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACCCTTCACGACCACCTCAACCTGCACTCGGGAGCGCGGCCCTACCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACCCTTCACGACCACCTCAACCTGCACTCGGGAGCGCGGCCCTACCGCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTCCTACTGCGACGTGCGCTTCGCCCACAAGCCTGCCATTAGGCGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTCCTACTGCGACGTGCGCTTCGCCCACAAGCCTGCCATTAGGCGGCACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCAAGGAGCAACACGGCAAGACCACGGCCGAGAACGTGCTGGAGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TCAAGGAGCAACACGGCAAGACCACGGCCGAGAACGTGCTGGAGGCCAGT

   1350     .    :    .    :    .
   1351 GTGGCCGAGATTAACGTCCTCATCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||
 101351 GTGGCCGAGATTAACGTCCTCATCCGC