seq1 = pF1KB8830.tfa, 1320 bp
seq2 = pF1KB8830/gi568815584f_54943042.tfa (gi568815584f:54943042_55144361), 201320 bp

>pF1KB8830 1320
>gi568815584f:54943042_55144361 (Chr14)

1-1320  (100001-101320)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAAAATAATGAAAATATTAGTAAAAATGTAGATGTAAGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAAAATAATGAAAATATTAGTAAAAATGTAGATGTAAGGCCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACTAGTCGGAGCAGAAGTGCCGACAGAAAAGACGGTTATGTGTGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACTAGTCGGAGCAGAAGTGCCGACAGAAAAGACGGTTATGTGTGGAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAAGAAGTTATCTTGGTCAAAAAAGAGTGAGAGTTATTCAGATGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAAGAAGTTATCTTGGTCAAAAAAGAGTGAGAGTTATTCAGATGCTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACAGTGAATGGTATAGAGAAAACCGAAGTGTCTTTAAGGAACCAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACAGTGAATGGTATAGAGAAAACCGAAGTGTCTTTAAGGAACCAAGAAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGCACAGCTGTTCATCCATTGAGTTGGACTTAGATCATTCCTGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGCACAGCTGTTCATCCATTGAGTTGGACTTAGATCATTCCTGTGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCGATTTTTAGGCCGATCTCTTAAACAGAAACTGCAAGATGCCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCGATTTTTAGGCCGATCTCTTAAACAGAAACTGCAAGATGCCGTGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGTGTTTTCCAATAAAGAATTGTAGTAGTCGGCACTCTTCAGGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGTGTTTTCCAATAAAGAATTGTAGTAGTCGGCACTCTTCAGGGCTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCTAAAAGGAAAATTCATATCAGTGAACTCATGTTAGATAAGTGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCTAAAAGGAAAATTCATATCAGTGAACTCATGTTAGATAAGTGTCCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCCACCTCGATCAGATTTAGCCTTTAGGTGGCATTTTATTAAACGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCCACCTCGATCAGATTTAGCCTTTAGGTGGCATTTTATTAAACGACAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTGCTCCTATAAATTCCAAATCAGATGAATGGGTAAGCACAGACTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTGCTCCTATAAATTCCAAATCAGATGAATGGGTAAGCACAGACTTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCAGACTGAATTGAGGGATGGTCAGCTAAAACGAAGAAATATGGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCAGACTGAATTGAGGGATGGTCAGCTAAAACGAAGAAATATGGAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATATAAACTGTTTCTCACATACCAATGTTCAGCCCTGTGTCATAACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATATAAACTGTTTCTCACATACCAATGTTCAGCCCTGTGTCATAACCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACAATGCTTTGTGTAGAGAAGGTCCTATGACTGGCTCTGTGATGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACAATGCTTTGTGTAGAGAAGGTCCTATGACTGGCTCTGTGATGAACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTTTCAAATAACAGTATAGAAGATAGTGATATGGATTCCGATGATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTTTCAAATAACAGTATAGAAGATAGTGATATGGATTCCGATGATGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCTAACACTTTGCACAAGTTCCAGAAAAAGAAACAAACCCAAATGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTCTAACACTTTGCACAAGTTCCAGAAAAAGAAACAAACCCAAATGGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTGGATGATGAAATCCTGCAGTTGGAAACACCTCCTAAATACCACACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTGGATGATGAAATCCTGCAGTTGGAAACACCTCCTAAATACCACACGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATTGATTATGTCCACTGTCTTGTACCAGACCTCCTTCAGATCAATAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATTGATTATGTCCACTGTCTTGTACCAGACCTCCTTCAGATCAATAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCATGTTACTGGGGAGTGATGGATAAATACGCAGCCGAAGCACTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCATGTTACTGGGGAGTGATGGATAAATACGCAGCCGAAGCACTACTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAAGGAAAACCAGAGGGTACCTTTTTACTTCGAGACTCAGCACAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAAGGAAAACCAGAGGGTACCTTTTTACTTCGAGACTCAGCACAGGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTATTTATTCTCTGTTAGTTTTAGACGCTATAGTCGTTCTCTTCATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTATTTATTCTCTGTTAGTTTTAGACGCTATAGTCGTTCTCTTCATGCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GAATTGAACAGTGGAATCACAACTTTAGCTTTGATGCACATGACCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GAATTGAACAGTGGAATCACAACTTTAGCTTTGATGCACATGACCCCTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTCTTCCATTCTCCTGACATTACTGGGCTCCTAGAACATTATAAGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTCTTCCATTCTCCTGACATTACTGGGCTCCTAGAACATTATAAGGACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AAGCGCCTGTATGTTCTTTGAACCACTTCTATCCACTCCCTTAATTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AAGCGCCTGTATGTTCTTTGAACCACTTCTATCCACTCCCTTAATTCGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTTTCCCTTTTTCCCTGCAGCATATATGCAGAACAGTTATTTGTAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTTTCCCTTTTTCCCTGCAGCATATATGCAGAACAGTTATTTGTAACTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACAACTTATGATGGCATCGATGCCCTTCCAATTCCTTCTTCTATGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACAACTTATGATGGCATCGATGCCCTTCCAATTCCTTCTTCTATGAAATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ATATCTGAAGGAATATCATTATAAATCAAAAGTTAGAGTACTCAGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ATATCTGAAGGAATATCATTATAAATCAAAAGTTAGAGTACTCAGGATTG

   1300     .    :    .    :
   1301 ATGCACCAGAACAGCAATGC
        ||||||||||||||||||||
 101301 ATGCACCAGAACAGCAATGC