seq1 = pF1KB8829.tfa, 1311 bp
seq2 = pF1KB8829/gi568815579f_11705954.tfa (gi568815579f:11705954_11907264), 201311 bp

>pF1KB8829 1311
>gi568815579f:11705954_11907264 (Chr19)

1-1311  (100001-101311)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGAGAGACTCTTTGAGAGTGCAGAAGGTAGTCAGTGTGGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGAGAGACTCTTTGAGAGTGCAGAAGGTAGTCAGTGTGGAGAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCACCCAGGTTCCGGAAGACATGCTGAACAAGAAAACTCTTCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCACCCAGGTTCCGGAAGACATGCTGAACAAGAAAACTCTTCCTGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAAAATCATGTGAAAGTGGTACATGTGGAGAAATCTTCATGGGATATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAAAATCATGTGAAAGTGGTACATGTGGAGAAATCTTCATGGGATATTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTTTAATAGGAACATCAGAACTGACACTGGACACCAACCACATAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTTTAATAGGAACATCAGAACTGACACTGGACACCAACCACATAAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAGAAATTTTTAGAGAAGCCATATAAACATAAACAACGTAGGAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCAGAAATTTTTAGAGAAGCCATATAAACATAAACAACGTAGGAAAGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAGCCATAGCCACTGCTTTCGAACACATGAAAGGCCTCACACTAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAGCCATAGCCACTGCTTTCGAACACATGAAAGGCCTCACACTAGAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAACCTTTTGATTGTAAGGAATGTGAAAAATCTTTCATTTCTCCTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAACCTTTTGATTGTAAGGAATGTGAAAAATCTTTCATTTCTCCTGCAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATTCGAAGATATATGGTAACGCACAGTGGAGATGGACCTTATAAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATTCGAAGATATATGGTAACGCACAGTGGAGATGGACCTTATAAATGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTTTTGTGGGAAAGCCTTGGATTGTCTCAGTTTATACCTTACCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTTTTGTGGGAAAGCCTTGGATTGTCTCAGTTTATACCTTACCCATGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGAACTCACACTGGAGAGAAACGATATGAATGTAAACAATGTGGTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGAACTCACACTGGAGAGAAACGATATGAATGTAAACAATGTGGTAAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCAGTTGGCACAGTTCTGTTCGAATCCATGAAAGAACTCACACTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCAGTTGGCACAGTTCTGTTCGAATCCATGAAAGAACTCACACTGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGAAGCCATATGAATGTAAGGAGTGTGGGAAATCATTCAATTTTTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGAAGCCATATGAATGTAAGGAGTGTGGGAAATCATTCAATTTTTCCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCTTTCGCAGACATGAAAGGACACACACAGGAGAGAAGCCGTACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCTTTCGCAGACATGAAAGGACACACACAGGAGAGAAGCCGTACAAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAATTGTCCCAGTTCTTTTCACAGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAATTGTCCCAGTTCTTTTCACAGGCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAAGGACTCACACAGGAGAAAAACCCTATGAATGTAAACTATATGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAAGGACTCACACAGGAGAAAAACCCTATGAATGTAAACTATATGGGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCATTATCTCGCCTTATAAGCTTTCGAAGACACATGAGAATGCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCATTATCTCGCCTTATAAGCTTTCGAAGACACATGAGAATGCACACTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAGAGGCCTCATAAATGTAAGATATGTGGGAAAGCCTTTTACTCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAGAGGCCTCATAAATGTAAGATATGTGGGAAAGCCTTTTACTCTCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTTCATTTCAAAGGCATGAAAGAAGTCACACTGGAGAGAAACCCTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTTCATTTCAAAGGCATGAAAGAAGTCACACTGGAGAGAAACCCTACAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGCAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCACTTGTTCCACTTCGTTTCAATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGCAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCACTTGTTCCACTTCGTTTCAATATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCGATGGGTGTAAGCAATGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCGATGGGTGTAAGCAATGTGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGCCTTCAGATCTGCCAAGTACATTCGAATACATGGAAGGACTCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGCCTTCAGATCTGCCAAGTACATTCGAATACATGGAAGGACTCACACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGCAATGTGGGAAAGCATTTCATTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGCAATGTGGGAAAGCATTTCATTGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAGCTCCTTTCATAGACATGAAAGGACTCACGCTGGAGAAAAACCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAGCTCCTTTCATAGACATGAAAGGACTCACGCTGGAGAAAAACCTTATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AATGTAAGCATTGTGGGAAAGCCTTCACTTGTTCCATATATATTAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AATGTAAGCATTGTGGGAAAGCCTTCACTTGTTCCATATATATTAGAATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCTTACCAATGTAAGGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCTTACCAATGTAAGGAATGTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GAAAGCCTTCATTCGTTCCAGTTACTGTCGAAAACATGAAAGAACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GAAAGCCTTCATTCGTTCCAGTTACTGTCGAAAACATGAAAGAACTCACA

   1300     .    :
   1301 CTATTAATATA
        |||||||||||
 101301 CTATTAATATA