seq1 = pF1KB8826.tfa, 1245 bp
seq2 = pF1KB8826/gi568815586r_12561204.tfa (gi568815586r:12561204_12762448), 201245 bp

>pF1KB8826 1245
>gi568815586r:12561204_12762448 (Chr12)

(complement)

1-1245  (100001-101245)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTTTTGCTCACAGAATGGATAACAGCAAGCCACATTTGATTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTTTTGCTCACAGAATGGATAACAGCAAGCCACATTTGATTATTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACACTTCTGGTGCCCCTCCAAAACCGCAGCTGCACTGAAACAGCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACACTTCTGGTGCCCCTCCAAAACCGCAGCTGCACTGAAACAGCCACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCTGCCAAGCCAATACCTGATGGAATTAAGTGAGGAGCACAGTTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCTGCCAAGCCAATACCTGATGGAATTAAGTGAGGAGCACAGTTGGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCAACCAAACAGACCTTCACTATGTGCTGAAACCCGGGGAAGTGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCAACCAAACAGACCTTCACTATGTGCTGAAACCCGGGGAAGTGGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCCAGCATCTTCTTTGGGATTCTGTGGTTGTTTTCTATCTTCGGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCCAGCATCTTCTTTGGGATTCTGTGGTTGTTTTCTATCTTCGGCAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCTGGTTTGTTTGGTCATCCATAGGAGTAGGAGGACTCAGTCTACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCTGGTTTGTTTGGTCATCCATAGGAGTAGGAGGACTCAGTCTACCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACTACTTTGTGGTCTCCATGGCATGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACTACTTTGTGGTCTCCATGGCATGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCACGCCTTTCGTCCTGCTCCAGTTCACCACTGGAAGGTGGACGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCACGCCTTTCGTCCTGCTCCAGTTCACCACTGGAAGGTGGACGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTAGTGCAACGTGCAAGGTTGTGCGATATTTTCAATATCTCACTCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTAGTGCAACGTGCAAGGTTGTGCGATATTTTCAATATCTCACTCCAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCCAGATCTACGTTCTCCTCTCCATCTGCATAGACCGGTTCTACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCCAGATCTACGTTCTCCTCTCCATCTGCATAGACCGGTTCTACACCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGTCTATCCTCTGAGCTTCAAGGTGTCCAGAGAAAAAGCCAAGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGTCTATCCTCTGAGCTTCAAGGTGTCCAGAGAAAAAGCCAAGAAAATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGCGGCATCGTGGATCTTTGATGCAGGCTTTGTGACCCCTGTGCTCTTT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGCGGCATCGTGGGTCTTTGATGCAGGCTTTGTGACCCCTGTGCTCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCTATGGCTCCAACTGGGACAGTCATTGTAACTATTTCCTCCCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCTATGGCTCCAACTGGGACAGTCATTGTAACTATTTCCTCCCCTCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTGGGAAGGCACTGCCTACACTGTCATCCACTTCTTGGTGGGCTTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTGGGAAGGCACTGCCTACACTGTCATCCACTTCTTGGTGGGCTTTGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCCATCTGTCCTCATAATTTTATTTTACCAAAAGGTCATAAAATATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTCCATCTGTCCTCATAATTTTATTTTACCAAAAGGTCATAAAATATATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGGAGAATAGGCACAGATGGCCGAACGGTGAGGAGGACAATGAACATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGGAGAATAGGCACAGATGGCCGAACGGTGAGGAGGACAATGAACATTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCTCGGACAAAAGTGAAAACTATCAAGATGTTCCTCATCTTAAATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100801 CCCTCGGACAAAAGTGAAAACTATCAAGATGTTCCTCATTTTAAATCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTTTTGCTCTCCTGGCTGCCTTTTCATGTAGCTCAGCTATGGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTTTTTGCTCTCCTGGCTGCCTTTTCATGTAGCTCAGCTATGGCACCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CATGAACAAGACTATAAGAAAAGTTCCCTTGTTTTCACAGCTATCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CATGAACAAGACTATAAGAAAAGTTCCCTTGTTTTCACAGCTATCACATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GATATCCTTTAGTTCTTCAGCCTCTAAACCTACTCTGTATTCAATTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATATCCTTTAGTTCTTCAGCCTCTAAACCTACTCTGTATTCAATTTATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAGACTTTTTGCATGTCCTCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAGACTTTTTGCATGTCCTCTATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AAATGTTACCGAAGCAATGCCTATACTATCACAACAAGTTCAAGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AAATGTTACCGAAGCAATGCCTATACTATCACAACAAGTTCAAGGATGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAAAAAAAACTACGTTGGCATTTCAGAAATCCCTTCCATGGCCAAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAAAAAAAACTACGTTGGCATTTCAGAAATCCCTTCCATGGCCAAAACTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTACCAAAGACTCGATCTATGACTCATTTGACAGAGAAGCCAAGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTACCAAAGACTCGATCTATGACTCATTTGACAGAGAAGCCAAGGAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1201 AAGCTTGCTTGGCCCATTAACTCAAATCCACCAAATACTTTTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGCTTGCTTGGCCCATTAACTCAAATCCACCAAATACTTTTGTC