seq1 = pF1KB8818.tfa, 1143 bp
seq2 = pF1KB8818/gi568815575f_41595634.tfa (gi568815575f:41595634_41796776), 201143 bp

>pF1KB8818 1143
>gi568815575f:41595634_41796776 (ChrX)

1-1143  (100001-101143)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAAGTCATACCATAACAATGACGACAACTTCAGTCAGCAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAAGTCATACCATAACAATGACGACAACTTCAGTCAGCAGCTGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACTCCTCCCACAGAATGCGCTTTATAACCAATCATAGCGACCAACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTACTCCTCCCACAGAATGCGCTTTATAACCAATCATAGCGACCAACCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACAAAACTTCTCAGCAACACCAAATGTTACTACCTGTCCCATGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACAAAACTTCTCAGCAACACCAAATGTTACTACCTGTCCCATGGATGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAATTGCTATCTACTGTGTTAACCACATCCTACTCTGTTATTTTCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAATTGCTATCTACTGTGTTAACCACATCCTACTCTGTTATTTTCATCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGACTGGTTGGGAACATAATCGCCCTCTATGTATTTCTGGGTATTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGACTGGTTGGGAACATAATCGCCCTCTATGTATTTCTGGGTATTCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTAAAAGAAATTCCATTCAAATTTATCTACTTAACGTAGCCATTGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTAAAAGAAATTCCATTCAAATTTATCTACTTAACGTAGCCATTGCAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCCTACTCATCTTCTGCCTCCCTTTCCGAATAATGTATCATATTAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCCTACTCATCTTCTGCCTCCCTTTCCGAATAATGTATCATATTAACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAACAAGTGGACACTAGGTGTGATTCTGTGCAAGGTTGTGGGAACACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAACAAGTGGACACTAGGTGTGATTCTGTGCAAGGTTGTGGGAACACTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTATATGAACATGTACATTAGCATTATTTTGCTTGGATTCATCAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTATATGAACATGTACATTAGCATTATTTTGCTTGGATTCATCAGTTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATCGCTATATAAAAATTAATCGGTCTATACAGCAACGGAAGGCAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GATCGCTATATAAAAATTAATCGGTCTATACAGCAACGGAAGGCAATAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AACCAAACAAAGTATTTATGTCTGTTGTATAGTATGGATGCTTGCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AACCAAACAAAGTATTTATGTCTGTTGTATAGTATGGATGCTTGCTCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGGATTCCTAACTATGATTATTTTAACACTTAAGAAAGGAGGGCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGGATTCCTAACTATGATTATTTTAACACTTAAGAAAGGAGGGCATAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCACAATGTGTTTCCATTACAGAGATAAGCATAACGCAAAAGGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCACAATGTGTTTCCATTACAGAGATAAGCATAACGCAAAAGGAGAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATTTTTAACTTCATTCTTGTGGTAATGTTCTGGCTAATTTTCTTACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATTTTTAACTTCATTCTTGTGGTAATGTTCTGGCTAATTTTCTTACTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TAATCCTTTCATATATTAAGATTGGGAAGAATCTATTGAGGATTTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TAATCCTTTCATATATTAAGATTGGGAAGAATCTATTGAGGATTTCTAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGGAGGTCAAAATTTCCTAATTCTGGTAAATATGCCACTACAGCTCGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGGAGGTCAAAATTTCCTAATTCTGGTAAATATGCCACTACAGCTCGTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCCTTTATTGTACTTATCATTTTTACTATATGTTTTGTTCCCTATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCCTTTATTGTACTTATCATTTTTACTATATGTTTTGTTCCCTATCATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTTCGATTCATCTACATTTCTTCACAGCTAAATGTATCATCTTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTTCGATTCATCTACATTTCTTCACAGCTAAATGTATCATCTTGCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGGAAAGAAATTGTTCACAAAACCAATGAGATCATGCTGGTTCTCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGGAAAGAAATTGTTCACAAAACCAATGAGATCATGCTGGTTCTCTCATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTTCAATAGTTGCTTAGATCCAGTCATGTATTTCCTGATGTCCAGTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TTTCAATAGTTGCTTAGATCCAGTCATGTATTTCCTGATGTCCAGTAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTCGCAAAATAATGTGCCAACTTCTTTTTAGACGATTTCAAGGTGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTCGCAAAATAATGTGCCAACTTCTTTTTAGACGATTTCAAGGTGAACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGTAGGAGTGAAAGCACTTCAGAATTTAAACCAGGATACTCCCTGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGTAGGAGTGAAAGCACTTCAGAATTTAAACCAGGATACTCCCTGCATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TACATCTGTGGCAGTGAAAATACAGTCTAGTTCTAAAAGTACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TACATCTGTGGCAGTGAAAATACAGTCTAGTTCTAAAAGTACT