seq1 = pF1KB8816.tfa, 1137 bp
seq2 = pF1KB8816/gi568815575f_101524980.tfa (gi568815575f:101524980_101726116), 201137 bp

>pF1KB8816 1137
>gi568815575f:101524980_101726116 (ChrX)

1-1137  (100001-101137)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTACGCCAGGAAAGTAGGCTGGGTGACCGCAGGCCTGGTGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTACGCCAGGAAAGTAGGCTGGGTGACCGCAGGCCTGGTGATTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGGCGCCTGCTATTGCATTTATAGACTGACTAGGGGAAGAAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGGCGCCTGCTATTGCATTTATAGACTGACTAGGGGAAGAAAACAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAGGAAAAAATGGCTGAGGGTGGATCTGGGGATGTGGATGATGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAAGGAAAAAATGGCTGAGGGTGGATCTGGGGATGTGGATGATGCTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTGTTCTGGGGCCAGGTATAATGACTGGTCTGATGATGATGATGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTGTTCTGGGGCCAGGTATAATGACTGGTCTGATGATGATGATGACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAATGAGAGCAAGAGTATAGTATGGTACCCACCTTGGGCTCGGATTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAATGAGAGCAAGAGTATAGTATGGTACCCACCTTGGGCTCGGATTGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGAAGCTGGAACCAGAGCTAGGGCCAGGGCAAGGGCCAGGGCTACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGAAGCTGGAACCAGAGCTAGGGCCAGGGCAAGGGCCAGGGCTACCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCACGTCGGGCTGTCCAGAAACGGGCTTCCCCCAATTCAGATGATACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCACGTCGGGCTGTCCAGAAACGGGCTTCCCCCAATTCAGATGATACCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTGTCCCCTCAAGAGCTACAAAAGGTTCTTTGCTTGGTTGAGATGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTGTCCCCTCAAGAGCTACAAAAGGTTCTTTGCTTGGTTGAGATGTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAAGCCTTATATTCTTGAAGCAGCTTTAATTGCTCTGGGTAACAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAAGCCTTATATTCTTGAAGCAGCTTTAATTGCTCTGGGTAACAATGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTTATGCATTTAACAGAGATATTATTCGTGATCTGGGTGGTCTCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTTATGCATTTAACAGAGATATTATTCGTGATCTGGGTGGTCTCCCAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTCGCAAAGATTCTCAATACTCGGGATCCCATAGTTAAGGAAAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGTCGCAAAGATTCTCAATACTCGGGATCCCATAGTTAAGGAAAAGGCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAATTGTCCTGAATAACTTGAGTGTGAATGCTGAAAATCAGCGCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAATTGTCCTGAATAACTTGAGTGTGAATGCTGAAAATCAGCGCAGGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAAGTATACATGAATCAAGTGTGTGATGACACAATCACTTCTCGCTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAGTATACATGAATCAAGTGTGTGATGACACAATCACTTCTCGCTTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCATCTGTGCAGCTTGCTGGACTGAGATTGCTTACAAATATGACTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCATCTGTGCAGCTTGCTGGACTGAGATTGCTTACAAATATGACTGTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTAATGAGTATCAGCACATGCTTGCTAATTCCATTTCTGACTTTTTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTAATGAGTATCAGCACATGCTTGCTAATTCCATTTCTGACTTTTTTCGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTATTTTCAGCGGGAAATGAAGAAACCAAACTTCAGGTTCTGAAACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTATTTTCAGCGGGAAATGAAGAAACCAAACTTCAGGTTCTGAAACTCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTGAATTTGGCTGAAAATCCAGCCATGACTAGGGAACTGCTCAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTGAATTTGGCTGAAAATCCAGCCATGACTAGGGAACTGCTCAGGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAGTACCATCTTCACTGGGCTCCCTCTTTAATAAGAAGGAGAACAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAGTACCATCTTCACTGGGCTCCCTCTTTAATAAGAAGGAGAACAAAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTTATTCTTAAACTTCTGGTCATATTTGAGAACATAAATGATAATTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTTATTCTTAAACTTCTGGTCATATTTGAGAACATAAATGATAATTTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ATGGGAAGAAAATGAACCTACTCAGAATCAATTCGGTGAAGGTTCACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ATGGGAAGAAAATGAACCTACTCAGAATCAATTCGGTGAAGGTTCACTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTTTCTTTTTAAAAGAATTTCAAGTGTGTGCTGATAAGGTTCTGGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTTTCTTTTTAAAAGAATTTCAAGTGTGTGCTGATAAGGTTCTGGGAATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAAAGTCACCATGATTTTTTGGTGAAAGTAAAAGTTGGAAAATTCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAAAGTCACCATGATTTTTTGGTGAAAGTAAAAGTTGGAAAATTCATGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .
   1101 CAAACTTGCTGAACATATGTTCCCAAAGAGCCAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAAACTTGCTGAACATATGTTCCCAAAGAGCCAGGAA