seq1 = pF1KB8802.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KB8802/gi568815586r_122629302.tfa (gi568815586r:122629302_122830339), 201038 bp

>pF1KB8802 1038
>gi568815586r:122629302_122830339 (Chr12)

(complement)

1-1038  (100001-101038)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACAACGGGTCGTGCTGCCGCATCGAGGGGGACACCATCTCCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACAACGGGTCGTGCTGCCGCATCGAGGGGGACACCATCTCCCAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGCCGCCGCTGCTCATTGTGGCCTTTGTGCTGGGCGCACTAGGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGCCGCCGCTGCTCATTGTGGCCTTTGTGCTGGGCGCACTAGGCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTCGCCCTGTGTGGTTTCTGCTTCCACATGAAGACCTGGAAGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTCGCCCTGTGTGGTTTCTGCTTCCACATGAAGACCTGGAAGCCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTGTTTACCTTTTCAATTTGGCCGTGGCTGATTTCCTCCTTATGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTGTTTACCTTTTCAATTTGGCCGTGGCTGATTTCCTCCTTATGATCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGCCTTTTCGGACAGACTATTACCTCAGACGTAGACACTGGGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGCCTTTTCGGACAGACTATTACCTCAGACGTAGACACTGGGCTTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGACATTCCCTGCCGAGTGGGGCTCTTCACGTTGGCCATGAACAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGACATTCCCTGCCGAGTGGGGCTCTTCACGTTGGCCATGAACAGGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGAGCATCGTGTTCCTTACGGTGGTGGCTGCGGACAGGTATTTCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGAGCATCGTGTTCCTTACGGTGGTGGCTGCGGACAGGTATTTCAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTCCACCCCCACCACGCGGTGAACACTATCTCCACCCGGGTGGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTCCACCCCCACCACGCGGTGAACACTATCTCCACCCGGGTGGCGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCATCGTCTGCACCCTGTGGGCCCTGGTCATCCTGGGAACAGTGTATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCATCGTCTGCACCCTGTGGGCCCTGGTCATCCTGGGAACAGTGTATCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGCTGGAGAACCATCTCTGCGTGCAAGAGACGGCCGTCTCCTGTGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGCTGGAGAACCATCTCTGCGTGCAAGAGACGGCCGTCTCCTGTGAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCATCATGGAGTCGGCCAATGGCTGGCATGACATCATGTTCCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCATCATGGAGTCGGCCAATGGCTGGCATGACATCATGTTCCAGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTTCTTTATGCCCCTCGGCATCATCTTATTTTGCTCCTTCAAGATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTTCTTTATGCCCCTCGGCATCATCTTATTTTGCTCCTTCAAGATTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGAGCCTGAGGCGGAGGCAGCAGCTGGCCAGACAGGCTCGGATGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGGAGCCTGAGGCGGAGGCAGCAGCTGGCCAGACAGGCTCGGATGAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCGACCCGGTTCATCATGGTGGTGGCAATTGTGTTCATCACATGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCGACCCGGTTCATCATGGTGGTGGCAATTGTGTTCATCACATGCTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCCCAGCGTGTCTGCTAGACTCTATTTCCTCTGGACGGTGCCCTCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCCCAGCGTGTCTGCTAGACTCTATTTCCTCTGGACGGTGCCCTCGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCTGCGATCCCTCTGTCCATGGGGCCCTGCACATAACCCTCAGCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCTGCGATCCCTCTGTCCATGGGGCCCTGCACATAACCCTCAGCTTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTACATGAACAGCATGCTGGATCCCCTGGTGTATTATTTTTCAAGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTACATGAACAGCATGCTGGATCCCCTGGTGTATTATTTTTCAAGCCCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTTCCCAAATTCTACAACAAGCTCAAAATCTGCAGTCTGAAACCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTTCCCAAATTCTACAACAAGCTCAAAATCTGCAGTCTGAAACCCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGCCAGGACACTCAAAAACACAAAGGCCGGAAGAGATGCCAATTTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGCCAGGACACTCAAAAACACAAAGGCCGGAAGAGATGCCAATTTCGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCTCGGTCGCAGGAGTTGCATCAGTGTGGCAAATAGTTTCCAAAGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCTCGGTCGCAGGAGTTGCATCAGTGTGGCAAATAGTTTCCAAAGCCAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 CTGATGGGCAATGGGATCCCCACATTGTTGAGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CTGATGGGCAATGGGATCCCCACATTGTTGAGTGGCAC