seq1 = pF1KB8799.tfa, 1014 bp
seq2 = pF1KB8799/gi568815595f_169983973.tfa (gi568815595f:169983973_170184986), 201014 bp

>pF1KB8799 1014
>gi568815595f:169983973_170184986 (Chr3)

1-1014  (100001-101014)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGCTCTCTCTTCAGAGAACTGCTCTTTTCAGTACCAGTTACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGCTCTCTCTTCAGAGAACTGCTCTTTTCAGTACCAGTTACGTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACAAACCAGCCCCTAGATGTTAACTATCTGCTATTCTTGATCATACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACAAACCAGCCCCTAGATGTTAACTATCTGCTATTCTTGATCATACTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAAAATATTATTAAATATCCTTACACTAGGAATGAGAAGAAAAAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGAAAATATTATTAAATATCCTTACACTAGGAATGAGAAGAAAAAACACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTCAAAATTTTATGGAATATTTTTGCATTTCACTAGCATTCGTTGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTCAAAATTTTATGGAATATTTTTGCATTTCACTAGCATTCGTTGATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTACTTTTGGTAAACATTTCCATTATATTGTATTTCAGGGATTTTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTACTTTTGGTAAACATTTCCATTATATTGTATTTCAGGGATTTTGTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTTAAGCATTAGGTTCACTAAATACCACATCTGCCTATTTACTCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTTAAGCATTAGGTTCACTAAATACCACATCTGCCTATTTACTCAAATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTTCCTTTACTTATGGCTTTTTGCATTATCCAGTTTTCCTGACAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTTCCTTTACTTATGGCTTTTTGCATTATCCAGTTTTCCTGACAGCTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATAGATTATTGCCTGAATTTCTCTAAAACAACCAAGCTTTCATTTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TATAGATTATTGCCTGAATTTCTCTAAAACAACCAAGCTTTCATTTAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTCAAAAATTATTTTATTTCTTTACAGTAATTTTAATTTGGATTTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTCAAAAATTATTTTATTTCTTTACAGTAATTTTAATTTGGATTTCAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTTGCTTATGTTTTGGGAGACCCAGCCATCTACCAAAGCCTGAAGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTTGCTTATGTTTTGGGAGACCCAGCCATCTACCAAAGCCTGAAGGCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATGCTTATTCTCGTCACTGTCCTTTCTATGTCAGCATTCAGAGTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAATGCTTATTCTCGTCACTGTCCTTTCTATGTCAGCATTCAGAGTTACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCTGTCATTTTTCATGGTGATGATTTTATTTGTAGCTTTCATAACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCTGTCATTTTTCATGGTGATGATTTTATTTGTAGCTTTCATAACCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGGAAGAAGTTACTACTTTGGTACAGGCTATCAGGATAACTTCCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGGGAAGAAGTTACTACTTTGGTACAGGCTATCAGGATAACTTCCTATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAATGAAACTATCTTATATTTTCCTTTTTCATCCCACTCCAGTTATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAATGAAACTATCTTATATTTTCCTTTTTCATCCCACTCCAGTTATACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAGATCTAAAAAAATATTCTTATCCAAGCTCATTGTCTGTTTTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAGATCTAAAAAAATATTCTTATCCAAGCTCATTGTCTGTTTTCTCAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACCTGGTTACCATTTGTACTACTTCAGGTAATCATTGTTTTACTTAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACCTGGTTACCATTTGTACTACTTCAGGTAATCATTGTTTTACTTAAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCAGATTCCAGCATATATTGAGATGAATATTCCCTGGTTATACTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCAGATTCCAGCATATATTGAGATGAATATTCCCTGGTTATACTTTGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATAGTTTTCTCATTGCTACAGTGTATTGGTTTAATTGTCACAAGCTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATAGTTTTCTCATTGCTACAGTGTATTGGTTTAATTGTCACAAGCTTAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTAAAAGACATTGGATTACCTTTGGATCCATTTGTCAACTGGAAGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTAAAAGACATTGGATTACCTTTGGATCCATTTGTCAACTGGAAGTGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTCATTCCACTTACAATTCCTAATCTTGAGCAAATTGAAAAGCCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTCATTCCACTTACAATTCCTAATCTTGAGCAAATTGAAAAGCCTATAT

   1000     .    :
   1001 CAATAATGATTTGT
        ||||||||||||||
 101001 CAATAATGATTTGT