seq1 = pF1KB8797.tfa, 999 bp
seq2 = pF1KB8797/gi568815591f_957516.tfa (gi568815591f:957516_1158514), 200999 bp

>pF1KB8797 999
>gi568815591f:957516_1158514 (Chr7)

1-999  (100001-100999)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGAGCTGCAGCTGGTTCAACGGCACAGGGCTGGTGGAGGAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGAGCTGCAGCTGGTTCAACGGCACAGGGCTGGTGGAGGAGCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCTGCCAGGACCTGCAGCTGGGGCTGTCACTGTTGTCGCTGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCTGCCAGGACCTGCAGCTGGGGCTGTCACTGTTGTCGCTGCTGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGGTGGGCGTGCCAGTGGGCCTGTGCTACAACGCCCTGCTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGGTGGGCGTGCCAGTGGGCCTGTGCTACAACGCCCTGCTGGTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAACCTACACAGCAAGGCCAGCATGACCATGCCGGACGTGTACTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAACCTACACAGCAAGGCCAGCATGACCATGCCGGACGTGTACTTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACATGGCAGTGGCAGGCCTGGTGCTCAGCGCCCTGGCCCCTGTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACATGGCAGTGGCAGGCCTGGTGCTCAGCGCCCTGGCCCCTGTGCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTCGGCCCCCCGAGCTCCCGGTGGGCGCTGTGGAGTGTGGGCGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTCGGCCCCCCGAGCTCCCGGTGGGCGCTGTGGAGTGTGGGCGGCGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCCACGTGGCACTGCAGATCCCCTTCAATGTGTCCTCACTGGTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCCACGTGGCACTGCAGATCCCCTTCAATGTGTCCTCACTGGTGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTACTCCACCGCCCTGCTGAGCCTCGACCACTACATCGAGCGTGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTACTCCACCGCCCTGCTGAGCCTCGACCACTACATCGAGCGTGCACTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGCGGACCTACATGGCCAGCGTGTACAACACGCGGCACGTGTGCGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGCGGACCTACATGGCCAGCGTGTACAACACGCGGCACGTGTGCGGCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGTGGGGTGGCGCGCTGCTGACCAGCTTCTCCTCGCTGCTCTTCTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGTGGGGTGGCGCGCTGCTGACCAGCTTCTCCTCGCTGCTCTTCTACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCAGCCATGTGTCCACCCGCGCGCTAGAGTGCGCCAAGATGCAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCAGCCATGTGTCCACCCGCGCGCTAGAGTGCGCCAAGATGCAGAACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGAAGCTGCCGACGCCACGCTGGTGTTCATCGGCTACGTGGTGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGAAGCTGCCGACGCCACGCTGGTGTTCATCGGCTACGTGGTGCCAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGCCACCCTCTACGCGCTGGTGCTACTCTCCCGCGTCCGCAGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGCCACCCTCTACGCGCTGGTGCTACTCTCCCGCGTCCGCAGGGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACGCCCCTGGACCGGGACACGGGCCGGCTGGAGCCCTCGGCACACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACGCCCCTGGACCGGGACACGGGCCGGCTGGAGCCCTCGGCACACAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCTGGTGGCCACCGTGTGCACGCAGTTTGGGCTCTGGACGCCACACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCTGGTGGCCACCGTGTGCACGCAGTTTGGGCTCTGGACGCCACACTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGATCCTGCTGGGGCACACGGTCATCATCTCGCGAGGGAAGCCCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGATCCTGCTGGGGCACACGGTCATCATCTCGCGAGGGAAGCCCGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGCACACTACCTGGGGCTACTGCACTTTGTGAAGGATTTCTCCAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGCACACTACCTGGGGCTACTGCACTTTGTGAAGGATTTCTCCAAACTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGCCTTCTCCAGCAGCTTTGTGACACCACTTCTCTACCGCTACATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGCCTTCTCCAGCAGCTTTGTGACACCACTTCTCTACCGCTACATGAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGAGCTTCCCCAGCAAGCTCCAACGGCTGATGAAAAAGCTGCCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGAGCTTCCCCAGCAAGCTCCAACGGCTGATGAAAAAGCTGCCCTGCGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    951 GGACCGGCACTGCTCCCCGGACCACATGGGGGTGCAGCAGGTGCTGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGACCGGCACTGCTCCCCGGACCACATGGGGGTGCAGCAGGTGCTGGCG