seq1 = pF1KB8788.tfa, 900 bp
seq2 = pF1KB8788/gi568815591f_150419975.tfa (gi568815591f:150419975_150620874), 200900 bp

>pF1KB8788 900
>gi568815591f:150419975_150620874 (Chr7)

1-900  (100001-100900)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGAGTGAGGACCGCTCCCTGAGGATCGTTCTGGTAGGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGAGTGAGGACCGCTCCCTGAGGATCGTTCTGGTAGGGAAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAAGTGGGAAAAGTGCAACAGCGAACACCATCCTTGGAGAGGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAAGTGGGAAAAGTGCAACAGCGAACACCATCCTTGGAGAGGAAATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGATTCTAGAATTGCTGCCCAAGCTGTTACCAAGAACTGTCAAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGATTCTAGAATTGCTGCCCAAGCTGTTACCAAGAACTGTCAAAAAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCGGGAATGGCAGGGGAGAGACCTTCTTGTTGTGGACACTCCAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100151 TCCCGGGAATGGCAGGGGAGAGACCTTCTTGTTGTAGACACTCCAGGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTGACACCAAGGAGAGCCTGGACACCACCTGCAAGGAAATCAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTGACACCAAGGAGAGCCTGGACACCACCTGCAAGGAAATCAGCCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCATCATCTCCTCCTGCCCAGGGCCCCATGCTATTGTCCTAGTTCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCATCATCTCCTCCTGCCCAGGGCCCCATGCTATTGTCCTAGTTCTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGGCCGCTACACAGAGGAGGAGCAGAAAACCGTTGCATTGATCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGGCCGCTACACAGAGGAGGAGCAGAAAACCGTTGCATTGATCAAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTCTTTGGGAAGTCAGCCATGAAGCACATGGTCATCTTGTTCACTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTCTTTGGGAAGTCAGCCATGAAGCACATGGTCATCTTGTTCACTCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGAAGAGTTGGAGGGCCAGAGCTTCCATGACTTCATAGCAGATGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGAAGAGTTGGAGGGCCAGAGCTTCCATGACTTCATAGCAGATGCGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGGCCTAAAAAGCATCGTCAAGGAGTGCGGGAACCGCTGCTGTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGGCCTAAAAAGCATCGTCAAGGAGTGCGGGAACCGCTGCTGTGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAGCAACAGCAAGAAAACCAGTAAGGCAGAGAAGGAAAGTCAAGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAGCAACAGCAAGAAAACCAGTAAGGCAGAGAAGGAAAGTCAAGTGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTTGGTGGAGCTGATAGAGAAAATGGTGCAGTGCAACGAAGGGGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTTGGTGGAGCTGATAGAGAAAATGGTGCAGTGCAACGAAGGGGCTTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTTCTGATGACATATACAAGGACACAGAGGAAAGGCTGAAACAACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTTCTGATGACATATACAAGGACACAGAGGAAAGGCTGAAACAACGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAGGTTTTGAGGAAAATCTACACTGACCAATTAAATGAAGAAATTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAGGTTTTGAGGAAAATCTACACTGACCAATTAAATGAAGAAATTAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TAGTAGAAGAGGATAAGCATAAATCAGAGGAAGAAAAGGAGAAAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TAGTAGAAGAGGATAAGCATAAATCAGAGGAAGAAAAGGAGAAAGAAATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAATTACTAAAATTAAAATATGATGAAAAAATAAAAAATATAAGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAATTACTAAAATTAAAATATGATGAAAAAATAAAAAATATAAGGGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGCTGAGAGAAATATATTTAAAGATGTTTTTAATAGGATTTGGAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGCTGAGAGAAATATATTTAAAGATGTTTTTAATAGGATTTGGAAGATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTTCAGAAATATGGCATAGGTTTTTGTCGAAATGTAAGTTTTATTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTTCAGAAATATGGCATAGGTTTTTGTCGAAATGTAAGTTTTATTCTTCC