seq1 = pF1KB8777.tfa, 771 bp
seq2 = pF1KB8777/gi568815577f_44356645.tfa (gi568815577f:44356645_44557415), 200771 bp

>pF1KB8777 771
>gi568815577f:44356645_44557415 (Chr21)

1-771  (100001-100771)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCACCGTGCGCCCACCTCGCCCCTCGCTCCTGCTGGTCTCCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCACCGTGCGCCCACCTCGCCCCTCGCTCCTGCTGGTCTCCACCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGTCTTGTCTCTTCCTCCTCTTCTGCCTGCACCTGGGCGCCGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGTCTTGTCTCTTCCTCCTCTTCTGCCTGCACCTGGGCGCCGCCTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACAGCCCTGCCGGTGCCCTGACCACGCAGGGGCTGTGGCTGTCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACAGCCCTGCCGGTGCCCTGACCACGCAGGGGCTGTGGCTGTCTTCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTTGCGGGGCCTTCAGGAGGTCCCCGAGGACATCCCGGCCAACACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTTGCGGGGCCTTCAGGAGGTCCCCGAGGACATCCCGGCCAACACCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCCTGAAGCTCGATGCCAACAAGATCTCCCACCTCCCGGACGGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCCTGAAGCTCGATGCCAACAAGATCTCCCACCTCCCGGACGGGGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGCACCTGCACCGGCTCAGGGAGCTGGATCTGTCTCACAACGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCAGCACCTGCACCGGCTCAGGGAGCTGGATCTGTCTCACAACGCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGCCATCGGCTCCGCCACCTTCGCGGGCCTGGCCGGGGGCCTGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGCCATCGGCTCCGCCACCTTCGCGGGCCTGGCCGGGGGCCTGCGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGACCTGTCTTACAACCGCATCCAGAGGATCCCCAAGGACGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGACCTGTCTTACAACCGCATCCAGAGGATCCCCAAGGACGCCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAAACTCAGCGCCAAGATACGCCTGTCCCACAACCCCCTGCACTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAAACTCAGCGCCAAGATACGCCTGTCCCACAACCCCCTGCACTGCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCGCCCTGCAGGAGGCCCTGTGGGAGCTGAAGCTGGACCCCGACTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCGCCCTGCAGGAGGCCCTGTGGGAGCTGAAGCTGGACCCCGACTCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGACGAGATCGCCTGCCACACCTCAGTGCAGGAGGAGTTTGTGGGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGACGAGATCGCCTGCCACACCTCAGTGCAGGAGGAGTTTGTGGGGAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCTGGTTCAGGCTCTGGATGCGGGTGCCAGCCTCTGCAGCGTCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCTGGTTCAGGCTCTGGATGCGGGTGCCAGCCTCTGCAGCGTCCCCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGGACCACAGACGTGGCCATGCTGGTCACCATGTTCGGCTGGTTCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGGACCACAGACGTGGCCATGCTGGTCACCATGTTCGGCTGGTTCGCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGATCGCCTACGTCGTGTACTATGTGCGCCACAACCAGGAGGATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGATCGCCTACGTCGTGTACTATGTGCGCCACAACCAGGAGGATGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAGGCACCTGGAGTACCTGAAGTCTCTGCCCAGCGCCCCCGCCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAGGCACCTGGAGTACCTGAAGTCTCTGCCCAGCGCCCCCGCCTCCAAG

    750     .    :    .    :
    751 GACCCCATCGGCCCGGGGCCC
        |||||||||||||||||||||
 100751 GACCCCATCGGCCCGGGGCCC