seq1 = pF1KB8775.tfa, 741 bp
seq2 = pF1KB8775/gi568815592f_13877120.tfa (gi568815592f:13877120_14077860), 200741 bp

>pF1KB8775 741
>gi568815592f:13877120_14077860 (Chr6)

1-741  (100001-100741)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGTCAACCTCCTGAAGACACTGCGGAGTCTCAGGCCTCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGTCAACCTCCTGAAGACACTGCGGAGTCTCAGGCCTCTGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGAGTGCAAAATCTGTTACAATCGATACAATCTGAAACAGAGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGAGTGCAAAATCTGTTACAATCGATACAATCTGAAACAGAGGAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAAGTGCTGGAGTGTTGTCATAGGGTTTGTGCCAAATGCCTCTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAAGTGCTGGAGTGTTGTCATAGGGTTTGTGCCAAATGCCTCTACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCATAGACTTTGGGGACTCCCCACAAGGTGTCATTGTCTGTCCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCATAGACTTTGGGGACTCCCCACAAGGTGTCATTGTCTGTCCTTTCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGTTTGAGACGTGCCTGCCAGATGATGAAGTTAGTAGCCTGCCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGTTTGAGACGTGCCTGCCAGATGATGAAGTTAGTAGCCTGCCCGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAACAACATCCTTGTAAACTTGACTTGTGGAGGCAAAGGGAAGAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAACAACATCCTTGTAAACTTGACTTGTGGAGGCAAAGGGAAGAAGTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCAGAGAACCCTACTGAGCTGCTGCTCACCCCCAAGAGGCTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCCAGAGAACCCTACTGAGCTGCTGCTCACCCCCAAGAGGCTGGCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCTGGTCAGTCCTTCTCACACGTCCTCCAACTGCCTGGTCATAACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCTGGTCAGTCCTTCTCACACGTCCTCCAACTGCCTGGTCATAACCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAGGTGCAGAGAGAGAGCTCCCCGTCCCTGAGCTCCACTCCTGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAGGTGCAGAGAGAGAGCTCCCCGTCCCTGAGCTCCACTCCTGTGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAATTTTATAGGCCTGCGAGTTTCGACTCTGTCACCACTGTGTCACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAATTTTATAGGCCTGCGAGTTTCGACTCTGTCACCACTGTGTCACACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGGACTGTGTGGAACTGCACGTCCCTGCTGTTTCAGACATCCATCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGGACTGTGTGGAACTGCACGTCCCTGCTGTTTCAGACATCCATCCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTTAGTGTGGTTGCTAGGTTTGCTCTACTTCAGCTCCTTACCCTTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTTAGTGTGGTTGCTAGGTTTGCTCTACTTCAGCTCCTTACCCTTAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTACTTACTGGTGTCTAAGAAAGTCACCCTTGGGGTCGTCTTTGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTACTTACTGGTGTCTAAGAAAGTCACCCTTGGGGTCGTCTTTGTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTGGTCCCTTCGAGCCTCGTTATTCTTATGGTGTATGGTTTTTGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTGGTCCCTTCGAGCCTCGTTATTCTTATGGTGTATGGTTTTTGCCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGTTTGTCATGAATTTCTAGACTGTATGGCACCTCCTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGTTTGTCATGAATTTCTAGACTGTATGGCACCTCCTTCT