seq1 = pF1KB8772.tfa, 1674 bp
seq2 = pF1KB8772/gi568815575f_102502142.tfa (gi568815575f:102502142_102703815), 201674 bp

>pF1KB8772 1674
>gi568815575f:102502142_102703815 (ChrX)

1-1674  (100001-101674)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTGACTCTGGGACAGAAGCAAGGGCTAGAGGAAAGGCTGAGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTGACTCTGGGACAGAAGCAAGGGCTAGAGGAAAGGCTGAGGCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCAAGATGGAATCAGTGGTCCTGCCACTGCTAGAGTGAATGGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCAAGATGGAATCAGTGGTCCTGCCACTGCTAGAGTGAATGGTAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGGCCGAGGCAGTGGCTGAGGCAGAACTGAAAACAGAATCAGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGGCCGAGGCAGTGGCTGAGGCAGAACTGAAAACAGAATCAGTGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGCCAAAGCTGGTGATGGAGCAATGACCAGGACACATACAGTGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGCCAAAGCTGGTGATGGAGCAATGACCAGGACACATACAGTGACCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGGAGGCTATGGCTGTGACAAGGGAAGTGATCAAGGTGGAAGATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGGAGGCTATGGCTGTGACAAGGGAAGTGATCAAGGTGGAAGATACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTAAGACTAGAGTCATGGTTGAGACTAAGACAAAACCCCTGGCAGAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTAAGACTAGAGTCATGGTTGAGACTAAGACAAAACCCCTGGCAGAACGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGTATAGTGCCACAAACCAAGTCAAAGGCCATGCCTATGTCTAGGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGTATAGTGCCACAAACCAAGTCAAAGGCCATGCCTATGTCTAGGGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TACTGTAACCAAGTCTGAAGTCAAGGTTGTTGCTGTCATTGAGGCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TACTGTAACCAAGTCTGAAGTCAAGGTTGTTGCTGTCATTGAGGCAAATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTAGGTCCTATGCCAAGTCACATGATAAGGCCAATACTGGGTCCAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTAGGTCCTATGCCAAGTCACATGATAAGGCCAATACTGGGTCCAGACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACAGAAGGGAAGAGACCAGCATTGGGATGAAATCCAGTGATGAGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACAGAAGGGAAGAGACCAGCATTGGGATGAAATCCAGTGATGAGGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAAAATATATGCTCCTGGTTCTGGACTGGAGAAGAGCCTAGTGTAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAAAATATATGCTCCTGGTTCTGGACTGGAGAAGAGCCTAGTGTAGGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTGGTTCTGGCCTGAAGAAGAGACCTCTCTTCAAGTTTATAAGCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTGGTTCTGGCCTGAAGAAGAGACCTCTCTTCAAGTTTATAAGCCCCTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCTAAGATCCAGGAAAAGCCCAAGCCCACACACAAACCCACACTTACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCTAAGATCCAGGAAAAGCCCAAGCCCACACACAAACCCACACTTACTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAAACAAAAGGTAATAGCATGGTCAAGGGCCAGGTATATTGTCCTAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAAACAAAAGGTAATAGCATGGTCAAGGGCCAGGTATATTGTCCTAGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGTTGAAGGAGGGGAGCAATCCTTGCCTCCAGAAGGAAACTGGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGTTGAAGGAGGGGAGCAATCCTTGCCTCCAGAAGGAAACTGGACCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTGAGACCTTGATTGAAACTCCTCTGGGGATTCGACCTTTGACCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTTGAGACCTTGATTGAAACTCCTCTGGGGATTCGACCTTTGACCAAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCACCTTATCATGGGCCTTATTACCAGACCCTAGCTGAGATCAAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100801 CCCACCTTATCATGGGCCTTATTACCAGACCTTAGCTGAGATCAAAAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGATTAGGCAAAGGGAAAAGTATGGGCCTAATCCGAAGGCCTGCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGATTAGGCAAAGGGAAAAGTATGGGCCTAATCCGAAGGCCTGCCACTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAATCACGTGGCTTTAGTTTAGAGCCTAAAGAGTTTGATAAACTTGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAATCACGTGGCTTTAGTTTAGAGCCTAAAGAGTTTGATAAACTTGTTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCTCCTTAAGTTAACTAAGGATCCTTTCATTCATGAAATAGCTACAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCTCCTTAAGTTAACTAAGGATCCTTTCATTCATGAAATAGCTACAATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TAATGGGCATCAGTCCTGCTTATCCATTTACTCAAGATATAATTCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TAATGGGCATCAGTCCTGCTTATCCATTTACTCAAGATATAATTCATGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTAGGTATTACTGTTATGATTGAAAACTTGGTCAATAATCCCAATGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTAGGTATTACTGTTATGATTGAAAACTTGGTCAATAATCCCAATGTTAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AGAACACCCTGGAGCTTTAAGTATGGTGGATGACAGCTCTGAGTCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AGAACACCCTGGAGCTTTAAGTATGGTGGATGACAGCTCTGAGTCTTCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAGAACCAAAATCAGGGGAGTCATATATACATCAAGTTTGTAAAGGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAGAACCAAAATCAGGGGAGTCATATATACATCAAGTTTGTAAAGGCATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATCTCTTGCCCCTTGAACTCCCCTGTGCAGCTGGCTGGACTGAAATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATCTCTTGCCCCTTGAACTCCCCTGTGCAGCTGGCTGGACTGAAATTACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGGGCACTTGAGTATAAAATTTGAAGATCACTATGTGATTACCAGTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGGGCACTTGAGTATAAAATTTGAAGATCACTATGTGATTACCAGTTATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TTCCAGATTTCCTCACCTTGTTAAACAAGGGAAGTGTCAAAACCAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TTCCAGATTTCCTCACCTTGTTAAACAAGGGAAGTGTCAAAACCAAGTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TATGTTTTAAAAGTGTTTTCGTGTTTGTCTAAAAATCACGCCAATACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TATGTTTTAAAAGTGTTTTCGTGTTTGTCTAAAAATCACGCCAATACAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGAATTGATCAGTGCCAAAGTACTGTCATCATTGGTTGCACCCTTTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGAATTGATCAGTGCCAAAGTACTGTCATCATTGGTTGCACCCTTTAACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGAATGAGTCAAAGGCCAATATTCTTAATATTATTGAAATATTTGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGAATGAGTCAAAGGCCAATATTCTTAATATTATTGAAATATTTGAGAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ATAAATTTTCAGTTCAAAACAAAGGCAAAGCTATTTACCAAGGAAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ATAAATTTTCAGTTCAAAACAAAGGCAAAGCTATTTACCAAGGAAAAGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CACTAAATCTGAGCTTATTTCAATATTCCAGGAAGCAAAACAGTTTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CACTAAATCTGAGCTTATTTCAATATTCCAGGAAGCAAAACAGTTTGGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGAAACTCCAAGACTTAGCAGAGCACAGTGATCCCGAAGTGAGAGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGAAACTCCAAGACTTAGCAGAGCACAGTGATCCCGAAGTGAGAGATAAA

   1650     .    :    .    :
   1651 GTCATACGATTAATACTAAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||
 101651 GTCATACGATTAATACTAAAACTC