seq1 = pF1KB8771.tfa, 702 bp
seq2 = pF1KB8771/gi568815593r_76977177.tfa (gi568815593r:76977177_77177878), 200702 bp

>pF1KB8771 702
>gi568815593r:76977177_77177878 (Chr5)

(complement)

1-702  (100001-100702)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGAGTGGCGAGCCGGCCTGCACCATGGACCAGGCCCGCGGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGAGTGGCGAGCCGGCCTGCACCATGGACCAGGCCCGCGGGCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACGCGGCGGCGCGGGGCGGTCAGTGTCCGGGACTGGGGCCGGCGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACGCGGCGGCGCGGGGCGGTCAGTGTCCGGGACTGGGGCCGGCGCCGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGACGCCTCCCGGCCGCCTGGGGGCGCCATACTCCGAGGCCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGACGCCTCCCGGCCGCCTGGGGGCGCCATACTCCGAGGCCTGGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACTTCCACCTGGCGCCGGGGCGCCCCGGGCATCCGTCGGGCCACTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACTTCCACCTGGCGCCGGGGCGCCCCGGGCATCCGTCGGGCCACTGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCTGCCGTCTGTGCGGGGAGCAGGTGGGCCGCGGCCCGGGCTTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCTGCCGTCTGTGCGGGGAGCAGGTGGGCCGCGGCCCGGGCTTCCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGGGACCTCGGCGTTGTGGAGGCACCTGAGGAGCGCGCACCGGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGGGACCTCGGCGTTGTGGAGGCACCTGAGGAGCGCGCACCGGCGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGAGAGCAGCGGCGCCGGGAGCTCCCCACCTGCCGCGCCCTGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGAGAGCAGCGGCGCCGGGAGCTCCCCACCTGCCGCGCCCTGCCCGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCGCCCGGCCCCGCTGCGGCCCCCGAGGGCGACTGGGCGCGCCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCGCCCGGCCCCGCTGCGGCCCCCGAGGGCGACTGGGCGCGCCTGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACAGATGGGCGCGCTGGCCGTGCGCGGCAGCCGGCGGGAGCGGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACAGATGGGCGCGCTGGCCGTGCGCGGCAGCCGGCGGGAGCGGGAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGCGGCGCGAGCTGGCCGTGGAGCAGGGCGAGCGCGCCCTGGAGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGCGGCGCGAGCTGGCCGTGGAGCAGGGCGAGCGCGCCCTGGAGCGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGGAGGGCGCTGCAGGAGGAAGAGCGCGCCGCGGCCCAGGCGCGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGGAGGGCGCTGCAGGAGGAAGAGCGCGCCGCGGCCCAGGCGCGCCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACTGCAGGCCGAGCGGGAGGCGCTGCAGGCGCGGCTGCGGGATGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AACTGCAGGCCGAGCGGGAGGCGCTGCAGGCGCGGCTGCGGGATGTGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGCCGTGAGGGCGCCCTGGGCTGGGCCCCCGCTGCGCCGCCGCCGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGCCGTGAGGGCGCCCTGGGCTGGGCCCCCGCTGCGCCGCCGCCGCTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGACGACCCCGAGGGTGACAGGGACGGCTGCGTCATCACAAAGGTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGACGACCCCGAGGGTGACAGGGACGGCTGCGTCATCACAAAGGTCCTCC

    700 
    701 TG
        ||
 100701 TG