seq1 = pF1KB8769.tfa, 699 bp
seq2 = pF1KB8769/gi568815585f_51765379.tfa (gi568815585f:51765379_51966077), 200699 bp

>pF1KB8769 699
>gi568815585f:51765379_51966077 (Chr13)

1-699  (100001-100699)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCCCGCCATTCCGGCTGATAAGGAAGATGTTTTCCTTCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCCCGCCATTCCGGCTGATAAGGAAGATGTTTTCCTTCAAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCAGATGGATGGGGCTTGCCTGCTTCCGGTCCCTGGCGGCATCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCAGATGGATGGGGCTTGCCTGCTTCCGGTCCCTGGCGGCATCCTCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGTATTCGCCAGAAGAAACTAATGCACAAGCTGCAGGAGGAAAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGTATTCGCCAGAAGAAACTAATGCACAAGCTGCAGGAGGAAAAGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTCGCGAAGAGATGAAAATTTTTCGTGAAAAAATAGAGGACTTCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTCGCGAAGAGATGAAAATTTTTCGTGAAAAAATAGAGGACTTCAGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAGATGTGGACTTTCCGAGGCAAGATCCATGCTTTCCGGGGCCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAGATGTGGACTTTCCGAGGCAAGATCCATGCTTTCCGGGGCCAGATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGGTTTTTGGGAAGAGGAGAGACCTTTCTGGGAAGAGGAGAAAACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGGTTTTTGGGAAGAGGAGAGACCTTTCTGGGAAGAGGAGAAAACCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGAAAGAGGAAAAATCCTTCTGGGAAATGGAAAAGTCTTTCAGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGGAAAGAGGAAAAATCCTTCTGGGAAATGGAAAAGTCTTTCAGGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAGAAAACTTTCTGGAAAAAGTACCGCACTTTCTGGAAGGAGGATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAGAAAACTTTCTGGAAAAAGTACCGCACTTTCTGGAAGGAGGATAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTTCTGGAAAGAGGACAATGCCTTATGGGAAAGAGACCGGAACCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTTCTGGAAAGAGGACAATGCCTTATGGGAAAGAGACCGGAACCTTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGGAGGACAAGGCCCTGTGGGAGGAAGAAAAGGCCCTGTGGGTAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGGAGGACAAGGCCCTGTGGGAGGAAGAAAAGGCCCTGTGGGTAGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAGAGCCCTCCTTGAGGGGGAGAAAGCCCTGTGGGAAGATAAAACGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAGAGCCCTCCTTGAGGGGGAGAAAGCCCTGTGGGAAGATAAAACGTCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTGGGAGGAAGAGAATGCCCTCTGGGAGGAAGAGAGGGCCTTCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTGGGAGGAAGAGAATGCCCTCTGGGAGGAAGAGAGGGCCTTCTGGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGAACAATGGCCACATTGCCGGAGAGCAGATGCTCGAAGATGGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGAACAATGGCCACATTGCCGGAGAGCAGATGCTCGAAGATGGGCCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    651 CAACGCCAACAGAGGGCAGCGCTTGCTGGCCTTCTCCCGAGGCAGGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACGCCAACAGAGGGCAGCGCTTGCTGGCCTTCTCCCGAGGCAGGGCG