seq1 = pF1KB8765.tfa, 669 bp
seq2 = pF1KB8765/gi568815594r_15862461.tfa (gi568815594r:15862461_16063129), 200669 bp

>pF1KB8765 669
>gi568815594r:15862461_16063129 (Chr4)

(complement)

1-669  (100001-100669)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTTCGTCCCCTGCCTCCTGCTGGTGACCTTGTCCTGCCTGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTTCGTCCCCTGCCTCCTGCTGGTGACCTTGTCCTGCCTGGGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGGGTCAGGCCCCGAGGCAAAAGCAAGGAAGCACTGGGGAGGAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGGGTCAGGCCCCGAGGCAAAAGCAAGGAAGCACTGGGGAGGAATTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTTCCAGACTGGAGGGAGAGATTCCTGCACTATGCGTCCCAGCAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATTTCCAGACTGGAGGGAGAGATTCCTGCACTATGCGTCCCAGCAGCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCAAGGTGCTGGAGAAGTCTGGCTTCGCGTCGACTGCCGCAACACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100151 GGGCAAGGTGCTGGAGAAGTCTGGCTTCGTGTCGACTGCCGCAACACAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGACCTACTGGTGTGAGTACAGGGGGCAGCCCAGCATGTGCCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGACCTACTGGTGTGAGTACAGGGGGCAGCCCAGCATGTGCCAGGCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGCTGCTGACCCCAAATCTTACTGGAATCAAGCCCTGCAGGAGCTGAGG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGCTGCTGACCCCAAACCTTACTGGAATCAAGCCCTGCAGGAGCTGAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCCTTCACCATGCGTGCCAGGGGGCCCCGGTGCTTAGGCCATCCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCCTTCACCATGCGTGCCAGGGGGCCCCGGTGCTTAGGCCATCCGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGGGAGGCTGGACCCCAGGCCCATATGCAGCAGGTGACTTCCAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGGGAGGCTGGACCCCAGGCCCATATGCAGCAGGTGACTTCCAGCCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGGCAGCCCAGAGCCCAACCAGCAGCCTGAGGCTGGGACGCCATCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGGCAGCCCAGAGCCCAACCAGCAGCCTGAGGCTGGGACGCCATCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGCCCAAGGCCACAGTGAAACTCACAGAAGCAACACAGCTGGGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGCCCAAGGCCACAGTGAAACTCACAGAAGCAACACAGCTGGGAAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCGATGGAAGAGCTGGGAAAAGCCAAACCCACCACCCGACCCACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCGATGGAAGAGCTGGGAAAAGCCAAACCCACCACCCGACCCACAGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACCTACCCAGCCTGGACCCAGGCCCGGAGGGAATGAGGAAGCAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AACCTACCCAGCCTGGACCCAGGCCCGGAGGGAATGAGGAAGCAAAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGGCCTGGGAACATTGTTGGAAACCCTTCCAGGCCCTGTGCGCCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGGCCTGGGAACATTGTTGGAAACCCTTCCAGGCCCTGTGCGCCTTTCT

    650     .    :    .
    651 CATCAGCTTCTTCCGAGGG
        |||||||||||||||||||
 100651 CATCAGCTTCTTCCGAGGG