seq1 = pF1KB8764.tfa, 654 bp
seq2 = pF1KB8764/gi568815595r_111493548.tfa (gi568815595r:111493548_111694201), 200654 bp

>pF1KB8764 654
>gi568815595r:111493548_111694201 (Chr3)

(complement)

1-654  (100001-100654)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAGGCGGGAAGACGAGGAAGAGGAGGGAACAATGATGAAGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAGGCGGGAAGACGAGGAAGAGGAGGGAACAATGATGAAGGCAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGGGACTTAGAGATGAAGGAGGAGGAAGAGATTAGTGAGACAGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGGGACTTAGAGATGAAGGAGGAGGAAGAGATTAGTGAGACAGGAGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTTGGCCCTTTTGTGAGTGCTATGCCCACTCCAATGCCCCACAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTTGGCCCTTTTGTGAGTGCTATGCCCACTCCAATGCCCCACAACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCACCCGGTTCTCTGAGGCATGGGAATATTTCCACCTAGCTCCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCACCCGGTTCTCTGAGGCATGGGAATATTTCCACCTAGCTCCTGCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCTGGGCACCATCCCAACCAGTATGCCACCTGCCGCCTGTGTGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCTGGGCACCATCCCAACCAGTATGCCACCTGCCGCCTGTGTGGCAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGTGAGCCGTGGCCCTGGGGTCAACGTGGGCACCACTGCACTGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGTGAGCCGTGGCCCTGGGGTCAACGTGGGCACCACTGCACTGTGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATCTGAAAAGCATGCACAGAGAGGAGCTGGAGAAGAGTGGCCATGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATCTGAAAAGCATGCACAGAGAGGAGCTGGAGAAGAGTGGCCATGGTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCTGGGCAGCGCCAGGATCCAAGGCCCCACGGGCCCCAGCTCCCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCTGGGCAGCGCCAGGATCCAAGGCCCCACGGGCCCCAGCTCCCCACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCATTGAGGGTAACTGGGGTAGGCTCCTGGAGCAGGTGGGCACCATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCATTGAGGGTAACTGGGGTAGGCTCCTGGAGCAGGTGGGCACCATGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGTGGGCCAGCCAAAGGGAAAAGGAGGTGCTTAGGAGGGAAAGGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGTGGGCCAGCCAAAGGGAAAAGGAGGTGCTTAGGAGGGAAAGGGCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAATGGCGGGAGAGGGCTGTGGAAAAAAGGGAGCGAGCCCTGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAATGGCGGGAGAGGGCTGTGGAAAAAAGGGAGCGAGCCCTGGAGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGAAAGGGCCATCCTGGAGATGAAGTGGAAGGTGAGGGCTGAGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGAAAGGGCCATCCTGGAGATGAAGTGGAAGGTGAGGGCTGAGAAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCATGCCAGCGGGAGAAAGAGCTGCCTGCAGCAGTACATCCCTTCCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCATGCCAGCGGGAGAAAGAGCTGCCTGCAGCAGTACATCCCTTCCATTT

    650 
    651 TGTT
        ||||
 100651 TGTT