seq1 = pF1KB8756.tfa, 600 bp
seq2 = pF1KB8756/gi568815592f_150834968.tfa (gi568815592f:150834968_151035563), 200596 bp

>pF1KB8756 600
>gi568815592f:150834968_151035563 (Chr6)

1-600  (100001-100596)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAATGGGCTGTCAGACCAGACTTCTATCCTGTCCAACCTGCCTTC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAATGGGCTATCAGACCAGACTTCTATCCTGTCCAACCTGCCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTTCAGTCTTTCCACATTGTTATTCTGGGTTTGGACTGTGCGGGAAAGA
        |||-||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100051 ATT CAGTCCTTCCACATTGTTATTCTGGGTTTGGACTGTGCTGGAAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAACTGTCTTATACAGGCTGCAGTTCAATGAATTTGTAAATACCGTACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100100 CAACTGTCTTATACAGGCTGCAGTTCAATGAATTTGTAAATACCATACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCAAAGGATTTAACACTGAGAAAATTAAGGTAACCTTGGGAAATTCTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100150 ACCAAAGGATTTAACACTGAGAAAATTAAGGTAAGCTTGGGAAATTCTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACAGTCACTTTTCACTTCTGGGATGTAGGTGGTCAGGAGAAATTAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100200 AACAGTCACTTTTCACTTCTGGGATGTAGGTGGTCAGGAGAAATTAAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CACTGTGGAAGTCATATACCAGATGCACAGATGGCATTGTATTTGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100250 CACTGTGGAAGTCATATACCAGATGCACAGATGGCATTGTATTTGTTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACTCTGTTGATGTCGAAAGGATGGAAGAAGCCAAAACTGAACTTCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100300 GACTCTGTTGATGTCGAAAGGATGGAAGAAGCCAAAACTGAACTTCACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATAACTAGGATATCAGAAAATCAGGGAGTCCCTGTACTTATAGTTGCTA
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100350 AATAACTAGGATATCAGAAAATCAAGGAGTCCCTGTACTTATAGTTGCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACAAACAAGATTTGAGGAACTCATTGTCACTTTCAGAAATTGAGAAATTG
        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100400 ACAAACAAGACTTGAGGAACTCATTGTCTCTTTCAGAAATTGAGAAATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTAGCAATGGGTGAACTGAGCTCATCAACTCCCTGGCATTTGCAGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||
 100450 TTAGCAATGGGTGAACTGAGCTCATCAGCTCCTTGGCATTTGTAGCCTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTGCAATCATAGGAGATGGCCTAAAGGAAGGACTTGAGAAACTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100500 CTGTGCAATCATAGGAGATGGCCTAAAGGAAGGACTTGAGAAACTACATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATATGATCATTAAAAGAAGAAAAATGTTGCGGCAACAGAAAAAGAAAAGA
        ||||||||||||||||||-||| -|-||||||||||||||||||||||||
 100550 ATATGATCATTAAAAGAA AAAT T TTGCGGCAACAGAAAAAGAAAAGA