seq1 = pF1KB8751.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KB8751/gi568815594r_112177865.tfa (gi568815594r:112177865_112378416), 200552 bp

>pF1KB8751 552
>gi568815594r:112177865_112378416 (Chr4)

(complement)

1-552  (100001-100552)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCAGTTTTGAAGATGCTGACACAGAAGAGACAGTAACTTGTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCAGTTTTGAAGATGCTGACACAGAAGAGACAGTAACTTGTCTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGACGGTTTACCATCCTGGCCAGTTGCAGTGTGGAATATTTCAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGACGGTTTACCATCCTGGCCAGTTGCAGTGTGGAATATTTCAGTCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAAGTTTTAACAGAGAGAAACTCCCTTCCAGCGAAGTGGTGAAATTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAAGTTTTAACAGAGAGAAACTCCCTTCCAGCGAAGTGGTGAAATTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGAAATTCCAACATCTGTCATTATACTTTTCAGGACAAACAGGTTTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGAAATTCCAACATCTGTCATTATACTTTTCAGGACAAACAGGTTTCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTTCAGTTTTCTCTGCAGCTGTTTAAAAAATTCAACAGCTCAGTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTTCAGTTTTCTCTGCAGCTGTTTAAAAAATTCAACAGCTCAGTTCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTTTGAAATAAAAAATATGAGTAAAAAGACCAATCTGATCGTGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTTTGAAATAAAAAATATGAGTAAAAAGACCAATCTGATCGTGGACAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGAGAGCTGGGCTACCTAAATAAAATGGACCTGCCATACAGGTGCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGAGAGCTGGGCTACCTAAATAAAATGGACCTGCCATACAGGTGCATGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGATTCGGAGAGTATCAGTTTCTGATGGAGAAGGAAGATGGCGAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGATTCGGAGAGTATCAGTTTCTGATGGAGAAGGAAGATGGCGAGTCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAATTTTTTGAGACTCAATTTATTTTATCTCCAAGATCACTCTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAATTTTTTGAGACTCAATTTATTTTATCTCCAAGATCACTCTTGCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAAAACAACTGGCCACCACACAGGCCCATACCGGAGTATGGCACTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAAAACAACTGGCCACCACACAGGCCCATACCGGAGTATGGCACTTATTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTCTGCTCCTCCCAAAGCAGTTCTCCGACAGAAATGGATGAAAATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTCTGCTCCTCCCAAAGCAGTTCTCCGACAGAAATGGATGAAAATGAGT

    550 
    551 CA
        ||
 100551 CA