seq1 = pF1KB8746.tfa, 531 bp
seq2 = pF1KB8746/gi568815595f_128961740.tfa (gi568815595f:128961740_129162270), 200531 bp

>pF1KB8746 531
>gi568815595f:128961740_129162270 (Chr3)

1-531  (100001-100531)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGCCTGGGGAGCCCTGTTCCTGCTCTGGGCCACAGCAGAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGCCTGGGGAGCCCTGTTCCTGCTCTGGGCCACAGCAGAGGCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGGACTGCCCCAGCCCATGTACCTGCCGCGCCCTGGAAACCATGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGACTGCCCCAGCCCATGTACCTGCCGCGCCCTGGAAACCATGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGGGTGGACTGCAGGGGCCACGGACTCACGGCCCTGCCTGCCCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTGGGTGGACTGCAGGGGCCACGGACTCACGGCCCTGCCTGCCCTGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCGCACCCGCCACCTTCTGCTGGCCAACAACAGCCTTCAGTCCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCCGCACCCGCCACCTTCTGCTGGCCAACAACAGCCTTCAGTCCGTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGGGAGCCTTTGACCACCTGCCCCAGCTGCAGACCCTCGATGTGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGGGAGCCTTTGACCACCTGCCCCAGCTGCAGACCCTCGATGTGACGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAACCCCTGGCACTGTGACTGCAGCCTCACCTATCTGCGCCTCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAACCCCTGGCACTGTGACTGCAGCCTCACCTATCTGCGCCTCTGGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGACCGCACGCCCGAGGCCCTGCTGCAGGTCCGCTGTGCCAGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGACCGCACGCCCGAGGCCCTGCTGCAGGTCCGCTGTGCCAGCCCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCGCTGCCCATGGCCCGCTGGGCCGGCTGACAGGCTACCAGCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTCGCTGCCCATGGCCCGCTGGGCCGGCTGACAGGCTACCAGCTGGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTGTGGCTGGCAGCTGCAGGCGTCCTGGGTGCGCCCGGGGGTCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTGTGGCTGGCAGCTGCAGGCGTCCTGGGTGCGCCCGGGGGTCTTGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACGTGGCGCTGGTCGCCGTGGCCGCGCTGGGCCTGGCTCTTCTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACGTGGCGCTGGTCGCCGTGGCCGCGCTGGGCCTGGCTCTTCTGGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :
    501 CCTGCTGTGTGCCACCACAGAGGCCCTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGCTGTGTGCCACCACAGAGGCCCTGGAT