seq1 = pF1KB8745.tfa, 1206 bp
seq2 = pF1KB8745/gi568815575f_118725245.tfa (gi568815575f:118725245_118926450), 201206 bp

>pF1KB8745 1206
>gi568815575f:118725245_118926450 (ChrX)

1-1206  (100001-101206)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAGCATCATTGCACGTGTCGGTAACAGCCGGCGGCTGAATGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAGCATCATTGCACGTGTCGGTAACAGCCGGCGGCTGAATGCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCCGCCTTGGGCCCATTCCATGCTGAGGTCCCTGGGGAGAAGTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGCCGCCTTGGGCCCATTCCATGCTGAGGTCCCTGGGGAGAAGTCTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCCTATAATGGCCAGCATGGCAGACAGAAACATGAAGTTGTTCTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCCTATAATGGCCAGCATGGCAGACAGAAACATGAAGTTGTTCTCGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGGTGGTGCCAGCCCAAGGGGAAGAAACCTTTGAAAACTGGCTGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGGTGGTGCCAGCCCAAGGGGAAGAAACCTTTGAAAACTGGCTGACCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGTCAATGGCGTCCTGCCAGATTGGAATATGTCTGAGGAGGAAAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGTCAATGGCGTCCTGCCAGATTGGAATATGTCTGAGGAGGAAAAGCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCGCTTGATGAAAACCCTTAGGGGCCCTGCCCGCGAGGTCATGCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCGCTTGATGAAAACCCTTAGGGGCCCTGCCCGCGAGGTCATGCGTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTCAGGCGACCAACCCTAACCTAAGTGTGGCAGATTTCTTGCGAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTCAGGCGACCAACCCTAACCTAAGTGTGGCAGATTTCTTGCGAGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAATTGGTGTTTGGGGAGTCTGAAAGCAGTGTGACTGCCCATGGTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAATTGGTGTTTGGGGAGTCTGAAAGCAGTGTGACTGCCCATGGTAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTTTAACACCCTACAAGCTCAAGGGGAGAAAGCCTCCCTTTATGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTTTAACACCCTACAAGCTCAAGGGGAGAAAGCCTCCCTTTATGTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGTTTAGAGGTGCAGCTCCAGAACGCTATTCAGGCAGGCATTATAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGTTTAGAGGTGCAGCTCCAGAACGCTATTCAGGCAGGCATTATAGCTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAAGATGCAAACCGGACTCGCTTGCAGCAGCTCCTTTTAGGCGGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAAGATGCAAACCGGACTCGCTTGCAGCAGCTCCTTTTAGGCGGTGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAGTAGGGACCTCCGACTCAGACTTAAGGATTTTCTCAGGATGTATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAGTAGGGACCTCCGACTCAGACTTAAGGATTTTCTCAGGATGTATGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATGAGCAGGAGCGGCTTCCCAACTTTCTGGAGTTAATCAGAATGGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATGAGCAGGAGCGGCTTCCCAACTTTCTGGAGTTAATCAGAATGGTAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAGGAAGAGGATTGGGATGATGCTTTTATTAAACGGAAGCGTCCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAGGAAGAGGATTGGGATGATGCTTTTATTAAACGGAAGCGTCCAAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGTCTGAGTCAATGGTGGAGAGGGCAGTCAGCCCTGTGGCATTTCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGTCTGAGTCAATGGTGGAGAGGGCAGTCAGCCCTGTGGCATTTCAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCCCACCGATAGTGATCGGCAGTGCTGACTGCAATGTGATAGAGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCCCACCGATAGTGATCGGCAGTGCTGACTGCAATGTGATAGAGATAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGATACCCTCGACGACTCCGATGAGGATGTGATCCTGGTGGAGTCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGATACCCTCGACGACTCCGATGAGGATGTGATCCTGGTGGAGTCTCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCTCCACTTCCATCCTGGGGTGCCCCTCCCCTCAGAGACAGGGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCTCCACTTCCATCCTGGGGTGCCCCTCCCCTCAGAGACAGGGCCAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCTCAGGATGAAGTGCTGGTCATTGATTCCCCCCACAATTCCAGGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCTCAGGATGAAGTGCTGGTCATTGATTCCCCCCACAATTCCAGGGCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTTTCCTTCCACCAGTGGTGGTTCTGGCTATAAGAATAACGGTCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTTTCCTTCCACCAGTGGTGGTTCTGGCTATAAGAATAACGGTCCTGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGATGCGTAGAGCCAGGAAGCGAAAACACACAATCCGCTGTTCGTATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGATGCGTAGAGCCAGGAAGCGAAAACACACAATCCGCTGTTCGTATTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGTGAGGAAGGCCACTCAAAAGAAACCTGTGACAACGAGAGTGACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGTGAGGAAGGCCACTCAAAAGAAACCTGTGACAACGAGAGTGACAAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCAGGTTTTTGAGAATTTGATCATCACTCTCCAGGAGCTGACCCATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCAGGTTTTTGAGAATTTGATCATCACTCTCCAGGAGCTGACCCATACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGATGGAGAGGTCAAGAGTGGCCCCTGGCGAATACAATGACTTCTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGATGGAGAGGTCAAGAGTGGCCCCTGGCGAATACAATGACTTCTCTGAG

   1200     .
   1201 CCACTG
        ||||||
 101201 CCACTG