seq1 = pF1KB8741.tfa, 417 bp
seq2 = pF1KB8741/gi568815597f_23861458.tfa (gi568815597f:23861458_24061874), 200417 bp

>pF1KB8741 417
>gi568815597f:23861458_24061874 (Chr1)

1-417  (100001-100417)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGGTGGAGAGAGGTATAACATTCCAGCCCCTCAATCTAGAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTGGTGGAGAGAGGTATAACATTCCAGCCCCTCAATCTAGAAATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAGTAAGAACCAACAACAGCTTAACAGACAGAAGACCAAGGAACAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAGTAAGAACCAACAACAGCTTAACAGACAGAAGACCAAGGAACAGAATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGATGAAGATTGTTCATAAGAAAAAAGAAAGAGGACATGGTTATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGATGAAGATTGTTCATAAGAAAAAAGAAAGAGGACATGGTTATAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCATCAGCAGCTGCCTGGCAGGCCATGCAAAATGGGGGGAAGAACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCATCAGCAGCTGCCTGGCAGGCCATGCAAAATGGGGGGAAGAACAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTCCAAATAATCAAAGTTGGAATTCTAGCTTATCAGGTCCCAGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTCCAAATAATCAAAGTTGGAATTCTAGCTTATCAGGTCCCAGGTTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTTTAAATCTCAAGCTAATCAGAACTATGCTGGTGCCAAATTTAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTTTAAATCTCAAGCTAATCAGAACTATGCTGGTGCCAAATTTAGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGCCATCACCAAGTGTTCTTCCCAAACCACCAAGCCACTGGGTCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGCCATCACCAAGTGTTCTTCCCAAACCACCAAGCCACTGGGTCCCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTCCTTTAATCCTTCAGATAAGGAAATAATGACATTTCAACTTAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTCCTTTAATCCTTCAGATAAGGAAATAATGACATTTCAACTTAAAACCT

    400     .    :    .
    401 TACTTAAAGTACAGGTA
        |||||||||||||||||
 100401 TACTTAAAGTACAGGTA