seq1 = pF1KB8740.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KB8740/gi568815575f_38704947.tfa (gi568815575f:38704947_38905495), 200549 bp

>pF1KB8740 549
>gi568815575f:38704947_38905495 (ChrX)

1-549  (100001-100549)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCAAATCTGCGACACCTACAACCAGAAGCACTCGCTCTTTAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCAAATCTGCGACACCTACAACCAGAAGCACTCGCTCTTTAACGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGAATCGCTTCATTGGCGCCGTGAACAACATGGACCAGACGGTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGAATCGCTTCATTGGCGCCGTGAACAACATGGACCAGACGGTGATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCAGCTTGCTGCGCGACGTGCCCCTGGCTGACCCCGGGTTAGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCAGCTTGCTGCGCGACGTGCCCCTGGCTGACCCCGGGTTAGACAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGTTGGCGTGGAGGTAGGCGGCAGTGGCGGCTGCCTGGAGGAGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGTTGGCGTGGAGGTAGGCGGCAGTGGCGGCTGCCTGGAGGAGCGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCCCAGTCCCCGACTCGGGAAGCGCCAATGGCAGCTTTTTCGCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCCCAGTCCCCGACTCGGGAAGCGCCAATGGCAGCTTTTTCGCGCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCGGGACATGTACAGCCACTACGTGCTTCTCAAGTCCATCCGCAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCGGGACATGTACAGCCACTACGTGCTTCTCAAGTCCATCCGCAACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCGAGTGGGGGGTCCTGCACCAGCCGCCTCCACCGGCTGGGAGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCGAGTGGGGGGTCCTGCACCAGCCGCCTCCACCGGCTGGGAGCGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCAGTGCCTGGAAGTCCAAGGACATCCTGGTGGACCTGGGCCACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCAGTGCCTGGAAGTCCAAGGACATCCTGGTGGACCTGGGCCACTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGGTGCGGACGCCGGCGAAGAAGACCTGGAACAGCAGTTCCACTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGGTGCGGACGCCGGCGAAGAAGACCTGGAACAGCAGTTCCACTACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGCGCGGGCTGCACACTGTGCTCTCGAAACTCACGCGCAAAGCCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGCGCGGGCTGCACACTGTGCTCTCGAAACTCACGCGCAAAGCCAACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    501 CCTCACTAACAGATACAAGCAGGAGATCGGCTTCGGCAATTGGGGCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCACTAACAGATACAAGCAGGAGATCGGCTTCGGCAATTGGGGCCAC