seq1 = pF1KB8738.tfa, 333 bp
seq2 = pF1KB8738/gi568815575f_103277492.tfa (gi568815575f:103277492_103477824), 200333 bp

>pF1KB8738 333
>gi568815575f:103277492_103477824 (ChrX)

1-333  (100001-100333)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAATATTCACCAGGAAAACGAAGAGATGGAGCAGCCTATGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAATATTCACCAGGAAAACGAAGAGATGGAGCAGCCTATGCAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGAGGAAGACCGCCCTTTGGGAGGAGGTGAAGGCCACCAGCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGAGGAAGACCGCCCTTTGGGAGGAGGTGAAGGCCACCAGCCTGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAATCGACGGGGACAGGCTCGCCGACTTGCCCCTAATTTTCGATGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAATCGACGGGGACAGGCTCGCCGACTTGCCCCTAATTTTCGATGGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATACCCAATAGGCAGATCAATGATGGGATGGGTGGAGATGGAGATGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATACCCAATAGGCAGATCAATGATGGGATGGGTGGAGATGGAGATGATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAATATTCATGGAGGAGATGAGAGAAATCAGAAGAAAACTTAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAATATTCATGGAGGAGATGAGAGAAATCAGAAGAAAACTTAGGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGTTGAGGAATTGTCTGCGTATCCTTATGGGGGAGCTCTCTAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGTTGAGGAATTGTCTGCGTATCCTTATGGGGGAGCTCTCTAATCAC

    300     .    :    .    :    .    :
    301 CATGACCATCATGATGAATTTTGCCTTATGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATGACCATCATGATGAATTTTGCCTTATGCCT