seq1 = pF1KB8732.tfa, 1728 bp
seq2 = pF1KB8732/gi568815582r_52339228.tfa (gi568815582r:52339228_52646723), 307496 bp

>pF1KB8732 1728
>gi568815582r:52339228_52646723 (Chr16)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-153  (178150-178215)   100% ->
154-408  (182536-182790)   100% ->
409-678  (196178-196447)   100% ->
679-906  (200503-200730)   100% ->
907-987  (202368-202448)   100% ->
988-1728  (206756-207496)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGTGAGGTTCTACCCCGCGGCGGCCGGGGACCCTGCCAGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGTGAGGTTCTACCCCGCGGCGGCCGGGGACCCTGCCAGCCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCGCGCAGTGCCTGGGGTACTACGGCTACAGCAAG         TTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 CTTCGCGCAGTGCCTGGGGTACTACGGCTACAGCAAGGTG...CAGTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAATAATAATAACTATATGAATATGGCTGAGGCGAACAATGCGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178154 GAAATAATAATAACTATATGAATATGGCTGAGGCGAACAATGCGTTCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGCCAGTGAG         CAGACATTCCACACACCAAGCCTTGGGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 178204 GCTGCCAGTGAGGTA...TAGCAGACATTCCACACACCAAGCCTTGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGAGGAATTCGAAATTCCACCAATCACGCCTCCTCCAGAGTCAGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182565 CGAGGAATTCGAAATTCCACCAATCACGCCTCCTCCAGAGTCAGACCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCTAGGCATGCCGGATGTACTGCTACCCTTTCAAGCCCTCAGCGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182615 CCCTAGGCATGCCGGATGTACTGCTACCCTTTCAAGCCCTCAGCGATCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGCCTTCCCAGGGAAGTGAATTCACACCCCAGTTTCCCCCTCAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182665 TTGCCTTCCCAGGGAAGTGAATTCACACCCCAGTTTCCCCCTCAAAGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGACCTCCCTTCCATTACAATCTCAAGAAATCTCGTGGAACAAGATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182715 GGACCTCCCTTCCATTACAATCTCAAGAAATCTCGTGGAACAAGATGGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCTTCATAGCAGTGGGTTGCATATG         GATCAGAGCCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 182765 TGCTTCATAGCAGTGGGTTGCATATGGTA...TAGGATCAGAGCCACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAAGTGTCCCAGTACCGGCAGGATCCCTCCCTGATCATGCGGTCCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196193 CAAGTGTCCCAGTACCGGCAGGATCCCTCCCTGATCATGCGGTCCATCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCACATGACCGATGCTGCGCGTTCTGGGGTCATGCCTCCTGCCCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196243 CCACATGACCGATGCTGCGCGTTCTGGGGTCATGCCTCCTGCCCAGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCACCATCAACCAGTCTCAGCTCAGCGCCCAGTTGGGGTTGAATTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196293 CCACCATCAACCAGTCTCAGCTCAGCGCCCAGTTGGGGTTGAATTTGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGTGCCAGTATGCCTCACACATCTCCTTCACCTCCAGCAAGCAAATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196343 GGTGCCAGTATGCCTCACACATCTCCTTCACCTCCAGCAAGCAAATCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACTCCCTCCCCTTCCAGCTCCATCAATGAAGAGGATGCTGATGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196393 CACTCCCTCCCCTTCCAGCTCCATCAATGAAGAGGATGCTGATGAAGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACAGA         GCCATTGGAGAGAAAAGAGCTGCTCCAGACTCTGGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196443 ACAGAGTA...CAGGCCATTGGAGAGAAAAGAGCTGCTCCAGACTCTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAGAAGCCCAAGACTCCAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGATCCCAATGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200539 AAGAAGCCCAAGACTCCAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGATCCCAATGAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ACAGAAGCCAGTGTCAGCATATGCCCTGTTTTTCAGAGACACACAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200589 ACAGAAGCCAGTGTCAGCATATGCCCTGTTTTTCAGAGACACACAGGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CAATTAAAGGTCAAAACCCCAATGCAACCTTTGGAGAGGTCTCAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200639 CAATTAAAGGTCAAAACCCCAATGCAACCTTTGGAGAGGTCTCAAAAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTAGCATCTATGTGGGACAGCCTTGGAGAAGAACAAAAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 200689 GTAGCATCTATGTGGGACAGCCTTGGAGAAGAACAAAAGCAGGTG...TA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    907  GTATATAAAAGGAAAACAGAAGCTGCCAAAAAAGAATACCTGAAGGCCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202367 GGTATATAAAAGGAAAACAGAAGCTGCCAAAAAAGAATACCTGAAGGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGCGGCATACAGGGCCAGCCTCGTTTCTAAG         GCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 202417 TGGCGGCATACAGGGCCAGCCTCGTTTCTAAGGTA...CAGGCTGCTGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGTCAGCAGAAGCCCAGACCATCCGTTCTGTTCAGCAGACCCTGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206765 GAGTCAGCAGAAGCCCAGACCATCCGTTCTGTTCAGCAGACCCTGGCGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GACCAATCTAACATCCTCTCTCCTTCTCAACACTCCACTGTCTCAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206815 GACCAATCTAACATCCTCTCTCCTTCTCAACACTCCACTGTCTCAACATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GAACAGTGTCAGCATCACCTCAGACTCTCCAGCAATCCCTCCCTAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206865 GAACAGTGTCAGCATCACCTCAGACTCTCCAGCAATCCCTCCCTAGGTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATCGCTCCCAAACCCTTAACCATGAGACTCCCCATGAACCAGATTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206915 ATCGCTCCCAAACCCTTAACCATGAGACTCCCCATGAACCAGATTGTCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 ATCAGTCACCATTGCAGCCAACATGCCCTCGAACATTGGGGCTCCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206965 ATCAGTCACCATTGCAGCCAACATGCCCTCGAACATTGGGGCTCCACTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TAAGCTCCATGGGAACGACCATGGTTGGCTCAGCACCCTCCACCCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207015 TAAGCTCCATGGGAACGACCATGGTTGGCTCAGCACCCTCCACCCAAGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AGTCCTTCGGTGCAAACCCAGCAGCATCAGATGCAATTGCAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207065 AGTCCTTCGGTGCAAACCCAGCAGCATCAGATGCAATTGCAGCAGCAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GCAGCAGCAACAACAACAGATGCAACAGATGCAGCAGCAGCAACTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207115 GCAGCAGCAACAACAACAGATGCAACAGATGCAGCAGCAGCAACTCCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 AGCACCAAATGCATCAGCAAATCCAGCAGCAGATGCAGCAGCAGCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207165 AGCACCAAATGCATCAGCAAATCCAGCAGCAGATGCAGCAGCAGCATTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CAGCACCACATGCAGCAGCACCTGCAGCAGCAGCAGCAGCATCTCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207215 CAGCACCACATGCAGCAGCACCTGCAGCAGCAGCAGCAGCATCTCCAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GCAAATTAATCAACAGCAGCTGCAGCAGCAGCTGCAGCAGCGCCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207265 GCAAATTAATCAACAGCAGCTGCAGCAGCAGCTGCAGCAGCGCCTCCAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 TGCAGCAGCTGCAACACATGCAGCACCAGTCTCAGCCTTCTCCTCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207315 TGCAGCAGCTGCAACACATGCAGCACCAGTCTCAGCCTTCTCCTCGGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CACTCCCCCGTCGCCTCTCAGATAACATCCCCCATCCCTGCCATCGGGAG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207365 CACTCCCCTGTCGCCTCTCAGATAACATCCCCCATCCCTGCCATCGGGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CCCCCAGCCAGCCTCTCAGCAGCACCAGTCGCAAATACAGTCTCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207415 CCCCCAGCCAGCCTCTCAGCAGCACCAGTCGCAAATACAGTCTCAGACAC

   1750     .    :    .    :    .    :
   1697 AGACTCAAGTATTATCGCAGGTCAGTATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 207465 AGACTCAAGTATTATCGCAGGTCAGTATTTTC