seq1 = pF1KB8726.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KB8726/gi568815576f_19031400.tfa (gi568815576f:19031400_19232473), 201074 bp

>pF1KB8726 1074
>gi568815576f:19031400_19232473 (Chr22)

1-1074  (100001-101074)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGATGCCACAGTCCTAAGGAAGAAGGGTTACATCGTAGGCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGATGCCACAGTCCTAAGGAAGAAGGGTTACATCGTAGGCATCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTGGCAAGGGTTCCTACGCAAAAGTCAAATCTGCCTACTCTGAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTTGGCAAGGGTTCCTACGCAAAAGTCAAATCTGCCTACTCTGAGCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGTTCAATGTGGCTGTCAAGATCATCGACCGCAAGAAAACACCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGTTCAATGTGGCTGTCAAGATCATCGACCGCAAGAAAACACCTACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTTTGTGGAGAGATTCCTTCCTCGGGAGATGGACATCCTGGCAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTTTGTGGAGAGATTCCTTCCTCGGGAGATGGACATCCTGGCAACTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCACGGCTCCATCATCAAGACTTACGAGATCTTTGAGACCTCTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCACGGCTCCATCATCAAGACTTACGAGATCTTTGAGACCTCTGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GACGGATCTACATCATCATGGAGCTTGGCGTCCAGGGCGACCTCCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GACGGATCTACATCATCATGGAGCTTGGCGTCCAGGGCGACCTCCTCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCATCAAGTGCCAGGGAGCCCTGCATGAGGACGTGGCACGCAAGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCATCAAGTGCCAGGGAGCCCTGCATGAGGACGTGGCACGCAAGATGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGACAGCTCTCCTCCGCCGTCAAGTACTGCCACGACCTGGACATCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGACAGCTCTCCTCCGCCGTCAAGTACTGCCACGACCTGGACATCGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCGGGACCTCAAGTGCGAGAACCTTCTCCTCGACAAGGACTTCAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCGGGACCTCAAGTGCGAGAACCTTCTCCTCGACAAGGACTTCAACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGCTGTCTGACTTTGGCTTCTCCAAGCGCTGCCTGCGGGACAGCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGCTGTCTGACTTTGGCTTCTCCAAGCGCTGCCTGCGGGACAGCAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGCATCATCCTCAGCAAGACCTTCTGCGGGTCGGCAGCATATGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGCATCATCCTCAGCAAGACCTTCTGCGGGTCGGCAGCATATGCAGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGAGGTGCTGCAGAGCATCCCCTACCAGCCCAAGGTGTATGACATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGAGGTGCTGCAGAGCATCCCCTACCAGCCCAAGGTGTATGACATCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGCCTGGGCGTGATCCTGTACATCATGGTCTGCGGCTCCATGCCCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGCCTGGGCGTGATCCTGTACATCATGGTCTGCGGCTCCATGCCCTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGACTCCGACATCAGGAAGATGCTGCGTATCCAGAAGGAGCACCGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGACTCCGACATCAGGAAGATGCTGCGTATCCAGAAGGAGCACCGTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACTTCCCGCGCTCCAAGAACCTGACCTGCGAGTGCAAGGACCTCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACTTCCCGCGCTCCAAGAACCTGACCTGCGAGTGCAAGGACCTCATCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGCATGCTGCAGCCCGACGTCAGCCAGCGGCTCCACATCGATGAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGCATGCTGCAGCCCGACGTCAGCCAGCGGCTCCACATCGATGAGATCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGCCACTCGTGGCTGCAGCCCCCCAAGCCCAAAGCCACGTCTTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGCCACTCGTGGCTGCAGCCCCCCAAGCCCAAAGCCACGTCTTCTGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTCAAGAGGGAGGGGGAGGGCAAGTACCGCGCTGAGTGCAAACTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTCAAGAGGGAGGGGGAGGGCAAGTACCGCGCTGAGTGCAAACTGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCAAGACAGGCTTGAGGCCCGACCACCGGCCCGACCACAAGCTTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCAAGACAGGCTTGAGGCCCGACCACCGGCCCGACCACAAGCTTGGAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAAACCCAGCACCGGCTGCTGGTGGTGCCCGAGAACGAGAACAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAAACCCAGCACCGGCTGCTGGTGGTGCCCGAGAACGAGAACAGGATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGACAGGCTGGCCGAGACCTCCAGGGCCAAAGACCATCACATCTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGACAGGCTGGCCGAGACCTCCAGGGCCAAAGACCATCACATCTCCGGA

   1050     .    :    .    :
   1051 GCTGAGGTGGGGAAAGCAAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||
 101051 GCTGAGGTGGGGAAAGCAAGCACC