seq1 = pF1KB8724.tfa, 1581 bp
seq2 = pF1KB8724/gi568815576f_20679229.tfa (gi568815576f:20679229_20887063), 207835 bp

>pF1KB8724 1581
>gi568815576f:20679229_20887063 (Chr22)

1-973  (100001-100973)   100% ->
974-1247  (104744-105017)   100% ->
1248-1392  (106776-106920)   100% ->
1393-1581  (107647-107835)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGATGCTGCAGCGGGGTGTGGATCAGCCAGGCCGCCTTTCACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGATGCTGCAGCGGGGTGTGGATCAGCCAGGCCGCCTTTCACTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTGTTTTCCCTCCCAGCTTTAGCTCCGCCAAAATGAAACACTCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTGTTTTCCCTCCCAGCTTTAGCTCCGCCAAAATGAAACACTCATTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGCACTTCTCATTTTCCTCATCATAACATCTGCGTGGGGTGGGAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGCACTTCTCATTTTCCTCATCATAACATCTGCGTGGGGTGGGAGCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCGCTGGATCAGCTAGAGAAAGGAGGGGAAACTGCTCAGTCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCCGCTGGATCAGCTAGAGAAAGGAGGGGAAACTGCTCAGTCTGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCCCAGTGGGAGCAGTTAAATAACAAAAACCTGAGCATGCCTCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCCCAGTGGGAGCAGTTAAATAACAAAAACCTGAGCATGCCTCTTCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGCCGACTTCCACAAGGAAAACACCGTCACCAACGACTGGATTCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGCCGACTTCCACAAGGAAAACACCGTCACCAACGACTGGATTCCAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGGAGGAGGACGACGACTATCTGGACCTGGAGAAGATATTCAGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGGAGGAGGACGACGACTATCTGGACCTGGAGAAGATATTCAGTGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGACGACTACATCGACATCGTCGACAGTCTGTCAGTTTCCCCGACAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGACGACTACATCGACATCGTCGACAGTCTGTCAGTTTCCCCGACAGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGATGTGAGTGCTGGGAACATCCTCCAGCTTTTTCATGGCAAGAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGATGTGAGTGCTGGGAACATCCTCCAGCTTTTTCATGGCAAGAGCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCAGCGTCTTAACATCCTCAACGCCAAGTTCGCTTTCAACCTCTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCAGCGTCTTAACATCCTCAACGCCAAGTTCGCTTTCAACCTCTACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGCTGAAAGACCAGGTCAACACTTTCGATAACATCTTCATAGCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGCTGAAAGACCAGGTCAACACTTTCGATAACATCTTCATAGCACCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGGCATTTCTACTGCGATGGGTATGATTTCCTTAGGTCTGAAGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGGCATTTCTACTGCGATGGGTATGATTTCCTTAGGTCTGAAGGGAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCCATGAACAAGTGCACTCGATTTTGCATTTTAAAGACTTTGTTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCCATGAACAAGTGCACTCGATTTTGCATTTTAAAGACTTTGTTAATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAGCAGCAAGTATGAAATCACGACCATTCATAATCTCTTCCGTAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAGCAGCAAGTATGAAATCACGACCATTCATAATCTCTTCCGTAAGCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTCATCGCCTCTTCAGGAGGAATTTTGGGTACACACTGCGGTCAGTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTCATCGCCTCTTCAGGAGGAATTTTGGGTACACACTGCGGTCAGTCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACCTTTATATCCAGAAGCAGTTTCCAATCCTGCTTGACTTCAAAACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GACCTTTATATCCAGAAGCAGTTTCCAATCCTGCTTGACTTCAAAACTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGTAAGAGAGTATTACTTTGCTGAGGCCCAGATAGCTGACTTCTCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGTAAGAGAGTATTACTTTGCTGAGGCCCAGATAGCTGACTTCTCAGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGCCTTCATATCAAAAACCAACAACCACATCATGAAGCTCACCAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGCCTTCATATCAAAAACCAACAACCACATCATGAAGCTCACCAAGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTCATAAAAGATGCTCTGGAGAATATAGACCCTGCTACCCAGATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTCATAAAAGATGCTCTGGAGAATATAGACCCTGCTACCCAGATGATGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCTCAACTGCATCTACTTCAAAG         GATCCTGGGTGAATAAAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100951 TCTCAACTGCATCTACTTCAAAGGTA...CAGGATCCTGGGTGAATAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TCCCAGTGGAAATGACACACAACCACAACTTCCGGCTGAATGAGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104762 TCCCAGTGGAAATGACACACAACCACAACTTCCGGCTGAATGAGAGAGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTAGTTAAGGTTTCCATGATGCAGACCAAGGGGAACTTCCTCGCAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104812 GTAGTTAAGGTTTCCATGATGCAGACCAAGGGGAACTTCCTCGCAGCAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGACCAGGAGCTGGACTGCGACATCCTCCAGCTGGAATACGTGGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104862 TGACCAGGAGCTGGACTGCGACATCCTCCAGCTGGAATACGTGGGGGGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCAGCATGCTAATTGTGGTCCCACACAAGATGTCTGGGATGAAGACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104912 TCAGCATGCTAATTGTGGTCCCACACAAGATGTCTGGGATGAAGACCCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GAAGCGCAACTGACACCCCGGGTGGTGGAGAGATGGCAAAAAAGCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104962 GAAGCGCAACTGACACCCCGGGTGGTGGAGAGATGGCAAAAAAGCATGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AAACAG         AACTCGAGAAGTGCTTCTGCCGAAATTCAAGCTGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105012 AAACAGGTA...TAGAACTCGAGAAGTGCTTCTGCCGAAATTCAAGCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AGAAGAACTACAATCTAGTGGAGTCCCTGAAGTTGATGGGGATCAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106811 AGAAGAACTACAATCTAGTGGAGTCCCTGAAGTTGATGGGGATCAGGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CTGTTTGACAAAAATGGCAACATGGCAGGCATCTCAGACCAAAGGATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106861 CTGTTTGACAAAAATGGCAACATGGCAGGCATCTCAGACCAAAGGATCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CATCGACCTG         TTCAAGCACCAAGGCACGATCACAGTGAACG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106911 CATCGACCTGGTA...CAGTTCAAGCACCAAGGCACGATCACAGTGAACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AGGAAGGCACCCAAGCCACCACTGTGACCACGGTGGGGTTCATGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107678 AGGAAGGCACCCAAGCCACCACTGTGACCACGGTGGGGTTCATGCCGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 TCCACCCAAGTCCGCTTCACTGTCGACCGCCCCTTTCTTTTCCTCATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107728 TCCACCCAAGTCCGCTTCACTGTCGACCGCCCCTTTCTTTTCCTCATCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CGAGCATCGCACCAGCTGCCTGCTCTTCATGGGAAGAGTGGCCAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107778 CGAGCATCGCACCAGCTGCCTGCTCTTCATGGGAAGAGTGGCCAACCCCA

   1600     .
   1574 GCAGGTCC
        ||||||||
 107828 GCAGGTCC