seq1 = pF1KB8717.tfa, 1443 bp
seq2 = pF1KB8717/gi568815576f_43823912.tfa (gi568815576f:43823912_44046379), 222468 bp

>pF1KB8717 1443
>gi568815576f:43823912_44046379 (Chr22)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-420  (103024-103256)   100% ->
421-486  (104913-104978)   100% ->
487-696  (108967-109176)   100% ->
697-757  (110695-110755)   100% ->
758-979  (113140-113361)   100% ->
980-1112  (116082-116214)   100% ->
1113-1217  (120780-120884)   100% ->
1218-1443  (122243-122468)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACGACGCAGAGCGCGGCTGGAGCTTGTCCTTCGCGGGCTGCGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACGACGCAGAGCGCGGCTGGAGCTTGTCCTTCGCGGGCTGCGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGCTTCTACCACGTCGGGGCGACCCGCTGCCTGAGCGAGCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGCTTCTACCACGTCGGGGCGACCCGCTGCCTGAGCGAGCACGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCACCTCCTCCGCGACGCGCGCATGTTGTTCGGCGCTTCGGCCGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCACCTCCTCCGCGACGCGCGCATGTTGTTCGGCGCTTCGGCCGGGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGCACTGCGTCGGCGTCCTCTCCGGTATCCCGCTGG         AGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 TTGCACTGCGTCGGCGTCCTCTCCGGTATCCCGCTGGGTG...CAGAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACTCTGCAGGTCCTCTCAGATCTTGTGCGGAAGGCCAGGAGTCGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103028 GACTCTGCAGGTCCTCTCAGATCTTGTGCGGAAGGCCAGGAGTCGGAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGGCATCTTCCATCCATCCTTCAACTTAAGCAAGTTCCTCCGACAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103078 TTGGCATCTTCCATCCATCCTTCAACTTAAGCAAGTTCCTCCGACAGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCTGCAAATGCCTCCCGGCCAATGTCCACCAGCTCATCTCCGGCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103128 CTCTGCAAATGCCTCCCGGCCAATGTCCACCAGCTCATCTCCGGCAAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGGCATCTCTCTTACCAGAGTGTCTGATGGGGAAAACGTTCTGGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103178 AGGCATCTCTCTTACCAGAGTGTCTGATGGGGAAAACGTTCTGGTGTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTTTCGGTCCAAAGACGAAGTCGTGGAT         GCCTTGGTATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103228 ACTTTCGGTCCAAAGACGAAGTCGTGGATGTA...CAGGCCTTGGTATGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCTGCTTCATCCCCTTCTACAGTGGCCTTATCCCTCCTTCCTTCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104925 TCCTGCTTCATCCCCTTCTACAGTGGCCTTATCCCTCCTTCCTTCAGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGTG         CGATATGTGGATGGAGGAGTGAGTGACAACGTACCCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104975 CGTGGTA...AAGCGATATGTGGATGGAGGAGTGAGTGACAACGTACCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCATTGATGCCAAAACAACCATCACCGTGTCCCCCTTCTATGGGGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109004 TCATTGATGCCAAAACAACCATCACCGTGTCCCCCTTCTATGGGGAGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACATCTGCCCTAAAGTCAAGTCCACGAACTTTCTTCATGTGGACATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109054 GACATCTGCCCTAAAGTCAAGTCCACGAACTTTCTTCATGTGGACATCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAAGCTCAGTCTACGCCTCTGCACAGGGAACCTCTACCTTCTCTCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109104 CAAGCTCAGTCTACGCCTCTGCACAGGGAACCTCTACCTTCTCTCGAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTTTTGTCCCCCCGGATCTCAAG         GTGCTGGGAGAGATATGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109154 CTTTTGTCCCCCCGGATCTCAAGGTG...CAGGTGCTGGGAGAGATATGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTTCGAGGATATTTGGATGCATTCAGGTTCTTGGAAGAGAAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110713 CTTCGAGGATATTTGGATGCATTCAGGTTCTTGGAAGAGAAGGGTA...C

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    758   GCATCTGCAACAGGCCCCAGCCAGGCCTGAAGTCATCCTCAGAAGGGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113138 AGGCATCTGCAACAGGCCCCAGCCAGGCCTGAAGTCATCCTCAGAAGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGATCCTGAGGTCGCCATGCCCAGCTGGGCAAACATGAGTCTGGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113188 TGGATCCTGAGGTCGCCATGCCCAGCTGGGCAAACATGAGTCTGGATTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCCCCGGAGTCGGCTGCCTTGGCTGTGAGGCTGGAGGGAGATGAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113238 TCCCCGGAGTCGGCTGCCTTGGCTGTGAGGCTGGAGGGAGATGAGCTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGACCACCTGCGTCTCAGCATCCTGCCCTGGGATGAGAGCATCCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113288 AGACCACCTGCGTCTCAGCATCCTGCCCTGGGATGAGAGCATCCTGGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCCTCTCGCCCAGGCTCGCTACAG         CACTGAGTGAAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 113338 CCCTCTCGCCCAGGCTCGCTACAGGTA...CAGCACTGAGTGAAGAAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AAAGACAAAGGTGGATACATGAGCAAGATTTGCAACTTGCTACCCATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116099 AAAGACAAAGGTGGATACATGAGCAAGATTTGCAACTTGCTACCCATTAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GATAATGTCTTATGTAATGCTGCCCTGTACCCTGCCTGTGGAATCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116149 GATAATGTCTTATGTAATGCTGCCCTGTACCCTGCCTGTGGAATCTGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TTGCGATTGTCCAGAG         ACTGGTGACATGGCTTCCAGATATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 116199 TTGCGATTGTCCAGAGGTG...CAGACTGGTGACATGGCTTCCAGATATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCCGACGATGTCCTGTGGTTGCAGTGGGTGACCTCACAGGTGTTCACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120805 CCCGACGATGTCCTGTGGTTGCAGTGGGTGACCTCACAGGTGTTCACTCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGTGCTGATGTGTCTGCTCCCCGCCTCCAG         GTCCCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120855 AGTGCTGATGTGTCTGCTCCCCGCCTCCAGGTA...CAGGTCCCAAATGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CAGTGAGCAGCCAACAGGCCTCCCCATGCACACCTGAGCAGGACTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122254 CAGTGAGCAGCCAACAGGCCTCCCCATGCACACCTGAGCAGGACTGGCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TGCTGGACTCCCTGCTCCCCCGAGGGCTGTCCAGCAGAGACCAAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 122304 TGCTGGACTCCCTGCTCCCCCAAGGGCTGTCCAGCAGAGACCAAAGCAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCCACCCCGCGGTCCATCCTCAGGTCCAGCCTGAACTTCTTCTTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122354 GGCCACCCCGCGGTCCATCCTCAGGTCCAGCCTGAACTTCTTCTTGGGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ATAAAGTACCTGCTGGTGCTGAGGGGCTCTCCACCTTTCCCAGTTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122404 ATAAAGTACCTGCTGGTGCTGAGGGGCTCTCCACCTTTCCCAGTTTTTCA

   1500     .    :    .
   1429 CTAGAGAAGAGTCTG
        |||||||||||||||
 122454 CTAGAGAAGAGTCTG