seq1 = pF1KB8711.tfa, 1446 bp
seq2 = pF1KB8711/gi568815591r_8013926.tfa (gi568815591r:8013926_8332753), 318828 bp

>pF1KB8711 1446
>gi568815591r:8013926_8332753 (Chr7)

(complement)

1-17  (96828-96844)   100% ->
18-180  (100002-100164)   100% ->
181-253  (104081-104153)   100% ->
254-377  (111356-111479)   100% ->
378-576  (114251-114449)   100% ->
577-702  (174102-174227)   100% ->
703-801  (175540-175638)   100% ->
802-899  (188782-188879)   100% ->
900-952  (190937-190989)   100% ->
953-1015  (193707-193769)   100% ->
1016-1057  (193873-193914)   100% ->
1058-1327  (204612-204881)   100% ->
1328-1446  (218710-218828)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGGACACAAATG         TTATCCCTGGGACTTACAGGATCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  96828 ATGTCAGGACACAAATGGTA...CAGTTATCCCTGGGACTTACAGGATCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ATATGCTCAAGATAAGTCAGTTGTAAATAAGATGCAACAGAAATATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100026 ATATGCTCAAGATAAGTCAGTTGTAAATAAGATGCAACAGAAATATTGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGACGAAGCAGGCCTTTATTAAAGCCACAGGGAAGAAGGAAGATGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100076 AGACGAAGCAGGCCTTTATTAAAGCCACAGGGAAGAAGGAAGATGAACAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTGTTGCCTCTGACGCGGACCTGGATGCCAAGCTAGAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100126 GTTGTTGCCTCTGACGCGGACCTGGATGCCAAGCTAGAGGTG...CAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTTTCATTCAATTCAGAGAACCTGTCTGGACTTATCGAAAGCAATTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104083 GTTTCATTCAATTCAGAGAACCTGTCTGGACTTATCGAAAGCAATTGTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTATCAAAAGAGGATATGTT         TCTTGTCTCAAGAAGAAAAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104133 TCTATCAAAAGAGGATATGTTGTA...CAGTCTTGTCTCAAGAAGAAAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAACTGGGAAAATTTCTTCGATCCCAAGGTTTCCAAGATAAAACCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111376 GAACTGGGAAAATTTCTTCGATCCCAAGGTTTCCAAGATAAAACCAGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGAAAGATGATGCAAGCGACAGGAAAGGCCCTCTGCTTTTCTTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111426 AGGAAAGATGATGCAAGCGACAGGAAAGGCCCTCTGCTTTTCTTCCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAAG         GTTGGCCTTACGAAATCCTTTGTGTCGATTTCACCAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111476 AAAGGTG...TAGGTTGGCCTTACGAAATCCTTTGTGTCGATTTCACCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAAGTGGAGACTTTTCGGCATCGGGCCATCTCAGATACTTGGCTGACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114288 GAAGTGGAGACTTTTCGGCATCGGGCCATCTCAGATACTTGGCTGACGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAACCGCATGGAACAGTGCAGGACGGAATATAGAGGAGCACTATTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114338 GAACCGCATGGAACAGTGCAGGACGGAATATAGAGGAGCACTATTATGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGAAGGACGTGTCTCAGGAGCTTGATCCAGACCTCTACAAGCAAATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114388 TGAAGGACGTGTCTCAGGAGCTTGATCCAGACCTCTACAAGCAAATGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGTTCAGGAAG         GTACAAACACAAGTGCGCCTTGCAAAAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 114438 AAGTTCAGGAAGGTA...TAGGTACAAACACAAGTGCGCCTTGCAAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AAACTTTGACAAATTGAAGATGGATGTTTGTCAAAAAGTGGATCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174131 AAACTTTGACAAATTGAAGATGGATGTTTGTCAAAAAGTGGATCTTCTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAGCGAGCAGATGCAATCTCTTGTCTCACATGCTAGCAACATACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 174181 GAGCGAGCAGATGCAATCTCTTGTCTCACATGCTAGCAACATACCAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       ACCACTCTGCTTCATTTTTGGGAGAAAACTTCTCACACTATGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174231 ...CAGACCACTCTGCTTCATTTTTGGGAGAAAACTTCTCACACTATGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGCCATCCATGAGAGTTTCAAAGGTTATCAACCATATGAATTTACTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175584 AGCCATCCATGAGAGTTTCAAAGGTTATCAACCATATGAATTTACTACTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TAAAG         AGCTTACAAGACCCTATGAAAAAATTAGTTGAGAAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175634 TAAAGGTA...AAGAGCTTACAAGACCCTATGAAAAAATTAGTTGAGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAAGAGAAGAAGAAAATCAACCAGCAGGAAAGTACAGATGCAGCCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188818 GAAGAGAAGAAGAAAATCAACCAGCAGGAAAGTACAGATGCAGCCGTGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGAGCCGAGCCA         ATTAATTTCATTAGAGGAAGAAAACCAGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 188868 GGAGCCGAGCCAGTA...AAGATTAATTTCATTAGAGGAAGAAAACCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCAAGGAATCCTCTAGTTTTAAGA         CTGAAGATGGAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 190966 GCAAGGAATCCTCTAGTTTTAAGAGTA...CAGCTGAAGATGGAAAAAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ATTTTATCTGCCTTAGACAAAGGCTCTACACATACTGCATGCTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 193724 ATTTTATCTGCCTTAGACAAAGGCTCTACACATACTGCATGCTCAGGTA.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1016      GACCCATAGATGAACTATTAGACATGAAATCTGAGGAAGGTG   
        ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 193774 ..AAGGACCCATAGATGAACTATTAGACATGAAATCTGAGGAAGGTGGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1058       CTTGCCTGGGACCAGTGGCAGGGACCCCGGAACCTGAAGGTGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193918 ...CAGCTTGCCTGGGACCAGTGGCAGGGACCCCGGAACCTGAAGGTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 GACAAAGATGACCTGCTGCTGTTGAGTGAGATCTTCAATGCTTCCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204656 GACAAAGATGACCTGCTGCTGTTGAGTGAGATCTTCAATGCTTCCTCCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GGAAGAGGGCGAGTTCAGCAAAGAGTGGGCCGCTGTGTTTGGAGACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204706 GGAAGAGGGCGAGTTCAGCAAAGAGTGGGCCGCTGTGTTTGGAGACGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AAGTGAAGGAGCCAGTGCCCACTATGGCCCTGGGAGAGCCAGACCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204756 AAGTGAAGGAGCCAGTGCCCACTATGGCCCTGGGAGAGCCAGACCCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GCCCAGACAGGCTCAGGTTTCCTTCCTTCGCAGCTTTTAGACCAAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204806 GCCCAGACAGGCTCAGGTTTCCTTCCTTCGCAGCTTTTAGACCAAAATAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GAAAGACTTACAGGCCTCGCTACAAG         AACCTGCTAAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 204856 GAAAGACTTACAGGCCTCGCTACAAGGTA...CAGAACCTGCTAAGGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CCTCAGACCTGACTGCCTGGTTCAGCCTCTTCGCTGACCTCGACCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218725 CCTCAGACCTGACTGCCTGGTTCAGCCTCTTCGCTGACCTCGACCCACTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TCAAATCCTGATGCTGTTGGGAAAACCGATAAAGAACACGAATTGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218775 TCAAATCCTGATGCTGTTGGGAAAACCGATAAAGAACACGAATTGCTCAA

   1550 
   1443 TGCA
        ||||
 218825 TGCA