seq1 = pF1KB8709.tfa, 1215 bp
seq2 = pF1KB8709/gi568815584r_94204421.tfa (gi568815584r:94204421_94414648), 210228 bp

>pF1KB8709 1215
>gi568815584r:94204421_94414648 (Chr14)

(complement)

1-613  (100001-100613)   100% ->
614-884  (104643-104913)   99% ->
885-1032  (108431-108578)   100% ->
1033-1215  (110046-110228)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCACTCCTCCTGTACACCTGTCTTCTCTGGCTGCCCACCAGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCACTCCTCCTGTACACCTGTCTTCTCTGGCTGCCCACCAGCGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGACCGTCCAGGCCATGGATCCTAACGCTGCTTATGTGAACATGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGACCGTCCAGGCCATGGATCCTAACGCTGCTTATGTGAACATGAGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCATCACCGGGGCCTGGCTTCAGCCAACGTTGACTTTGCCTTCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCATCACCGGGGCCTGGCTTCAGCCAACGTTGACTTTGCCTTCAGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATAAGCACCTAGTGGCCTTGAGTCCCAAAAAGAACATTTTCATCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TATAAGCACCTAGTGGCCTTGAGTCCCAAAAAGAACATTTTCATCTCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGAGCATCTCCATGGCCTTAGCTATGCTGTCCCTGGGCACCTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGAGCATCTCCATGGCCTTAGCTATGCTGTCCCTGGGCACCTGTGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACACACGGGCCCAGCTTCTCCAGGGCCTGGGTTTCAACCTCACTGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACACACGGGCCCAGCTTCTCCAGGGCCTGGGTTTCAACCTCACTGAGAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTGAGACTGAGATCCACCAGGGTTTCCAGCACCTGCACCAACTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTGAGACTGAGATCCACCAGGGTTTCCAGCACCTGCACCAACTCTTTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAAGTCAGACACCAGCTTAGAAATGACCATGGGCAATGCCTTGTTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAAGTCAGACACCAGCTTAGAAATGACCATGGGCAATGCCTTGTTTCTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGGCAGCCTGGAGTTGCTGGAGTCATTCTCAGCAGACATCAAGCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGGCAGCCTGGAGTTGCTGGAGTCATTCTCAGCAGACATCAAGCACTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TATGAGTCAGAGGTCTTGGCTATGAATTTCCAGGACTGGGCAACAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TATGAGTCAGAGGTCTTGGCTATGAATTTCCAGGACTGGGCAACAGCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGACAGATCAACAGCTATGTCAAGAATAAGACACAGGGGAAAATTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGACAGATCAACAGCTATGTCAAGAATAAGACACAGGGGAAAATTGTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTGTTTTCAGGGCTGGATAGCCCAGCCATCCTCGTCCTGGTCAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTGTTTTCAGGGCTGGATAGCCCAGCCATCCTCGTCCTGGTCAACTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTTCTTCAAAG         GCACATGGACACAGCCCTTTGACCTGGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTTCTTCAAAGGTA...TAGGCACATGGACACAGCCCTTTGACCTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AAGCACCAGGGAGGAGAACTTCTATGTGGACGAGACAACTGTGGTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104671 AAGCACCAGGGAGGAGAACTTCTATGTGGACGAGACAACTGTGGTGAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCCCATGATGTTGCAGTCGAGCACCATCAGTTACCTTCATGACGCGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 104721 TGCCCATGATGTTGCAGTCGAGCACCATCAGTTACCTTCATGACTCGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTCCCCTGCCAGCTGGTGCAGATGAACTACGTGGGCAATGGGACTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104771 CTCCCCTGCCAGCTGGTGCAGATGAACTACGTGGGCAATGGGACTGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CTTCATCCTTCCGGACAAGGGGAAGATGAACACAGTCATCGCTGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104821 CTTCATCCTTCCGGACAAGGGGAAGATGAACACAGTCATCGCTGCACTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCCGGGACACGATTAACAGGTGGTCCGCAGGCCTGACCAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104871 GCCGGGACACGATTAACAGGTGGTCCGCAGGCCTGACCAGCAGGTA...C

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    885   CCAGGTGGACCTGTACATTCCAAAGGTCACCATCTCTGGAGTCTATGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108429 AGCCAGGTGGACCTGTACATTCCAAAGGTCACCATCTCTGGAGTCTATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCTCGGAGATGTGCTGGAGGAAATGGGCATTGCAGACTTGTTCACCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108479 CCTCGGAGATGTGCTGGAGGAAATGGGCATTGCAGACTTGTTCACCAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGGCAAATTTCTCACGCATCACCCAGGACGCCCAGCTGAAGTCATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108529 AGGCAAATTTCTCACGCATCACCCAGGACGCCCAGCTGAAGTCATCAAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033          GTGGTCCATAAAGCTGTGCTGCAACTCAATGAGGAGGGTGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108579 GTA...CAGGTGGTCCATAAAGCTGTGCTGCAACTCAATGAGGAGGGTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGACACAGCTGGCTCCACTGGGGTCACCCTAAACCTGACGTCCAAGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110087 GGACACAGCTGGCTCCACTGGGGTCACCCTAAACCTGACGTCCAAGCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCATCTTGCGTTTCAACCAGCCCTTCATCATCATGATCTTCGACCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110137 TCATCTTGCGTTTCAACCAGCCCTTCATCATCATGATCTTCGACCACTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 ACCTGGAGCAGCCTTTTCCTGGCGAGGGTTATGAACCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110187 ACCTGGAGCAGCCTTTTCCTGGCGAGGGTTATGAACCCAGTG