seq1 = pF1KB8708.tfa, 1923 bp
seq2 = pF1KB8708/gi568815592r_31710050.tfa (gi568815592r:31710050_31911972), 201923 bp

>pF1KB8708 1923
>gi568815592r:31710050_31911972 (Chr6)

(complement)

1-1923  (100001-101923)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTACTGCCAAGGGAATCGCCATAGGCATCGACCTGGGCACCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTACTGCCAAGGGAATCGCCATAGGCATCGACCTGGGCACCACCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTGTGTGGGGGTGTTCCAGCACGGCAAGGTGGAGATCATCGCCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCTGTGTGGGGGTGTTCCAGCACGGCAAGGTGGAGATCATCGCCAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCAGGGCAACCGCACCACCCCCAGCTACGTGGCCTTCACAGACACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCAGGGCAACCGCACCACCCCCAGCTACGTGGCCTTCACAGACACCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCTCATTGGGGATGCGGCCAAGAACCAGGTAGCAATGAATCCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCTCATTGGGGATGCGGCCAAGAACCAGGTAGCAATGAATCCCCAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACTGTTTTTGATGCTAAACGTCTGATCGGCAGGAAATTTAATGATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACTGTTTTTGATGCTAAACGTCTGATCGGCAGGAAATTTAATGATCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTACAAGCAGATATGAAACTTTGGCCTTTTCAAGTGATTAATGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTACAAGCAGATATGAAACTTTGGCCTTTTCAAGTGATTAATGAAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCAAGCCCAAAGTCCTTGTGTCCTACAAAGGGGAGAATAAAGCTTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCAAGCCCAAAGTCCTTGTGTCCTACAAAGGGGAGAATAAAGCTTTCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCTGAGGAAATCTCTTCGATGGTATTGACTAAGTTGAAGGAGACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCTGAGGAAATCTCTTCGATGGTATTGACTAAGTTGAAGGAGACTGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCCTTTTTGGGCCACCCTGTCACCAATGCAGTGATTACCGTGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGCCTTTTTGGGCCACCCTGTCACCAATGCAGTGATTACCGTGCCAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TATTTCAATGACTCTCAACGTCAGGCTACTAAGGATGCAGGTGTGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TATTTCAATGACTCTCAACGTCAGGCTACTAAGGATGCAGGTGTGATTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGACTTAATGTGCTAAGAATCATCAATGAGCCCACGGCTGCTGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGACTTAATGTGCTAAGAATCATCAATGAGCCCACGGCTGCTGCCATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTATGGTTTAGATAAAGGAGGTCAAGGAGAACGACATGTCCTGATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTATGGTTTAGATAAAGGAGGTCAAGGAGAACGACATGTCCTGATTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATCTGGGTGGAGGCACATTTGATGTGTCAATTCTGACCATAGATGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATCTGGGTGGAGGCACATTTGATGTGTCAATTCTGACCATAGATGATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATTTTTGAGGTAAAGGCCACTGCTGGGGACACTCACCTGGGTGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATTTTTGAGGTAAAGGCCACTGCTGGGGACACTCACCTGGGTGGGGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACTTTGACAACAGGCTTGTGAGCCACTTCGTGGAGGAGTTCAAGAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACTTTGACAACAGGCTTGTGAGCCACTTCGTGGAGGAGTTCAAGAGGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CACAAAAAGGACATCAGCCAGAACAAGCGAGCCGTGAGGCGGCTGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CACAAAAAGGACATCAGCCAGAACAAGCGAGCCGTGAGGCGGCTGCGCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGCCTGCGAGAGGGCCAAGAGGACCCTGTCGTCCAGCACCCAGGCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGCCTGCGAGAGGGCCAAGAGGACCCTGTCGTCCAGCACCCAGGCCAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAGAAATTGATTCACTTTATGAAGGCATTGACTTCTATACATCCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAGAAATTGATTCACTTTATGAAGGCATTGACTTCTATACATCCATCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGAGCTCGATTTGAAGAGTTGTGTGCAGACCTGTTTAGGGGTACCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGAGCTCGATTTGAAGAGTTGTGTGCAGACCTGTTTAGGGGTACCCTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCTGTAGAAAAAGCGCTTCGGGATGCCAAGATGGATAAGGCTAAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCTGTAGAAAAAGCGCTTCGGGATGCCAAGATGGATAAGGCTAAAATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGACATTGTTTTAGTAGGGGGCTCCACCCGCATCCCCAAGGTGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGACATTGTTTTAGTAGGGGGCTCCACCCGCATCCCCAAGGTGCAGCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTGCTTCAGGACTACTTCAATGGACGTGATCTCAACAAGAGCATCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTGCTTCAGGACTACTTCAATGGACGTGATCTCAACAAGAGCATCAACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGATGAGGCCGTAGCATATGGGGCTGCGGTACAAGCAGCCATCCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGATGAGGCCGTAGCATATGGGGCTGCGGTACAAGCAGCCATCCTGATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGGACAAGTCTGAGAAGGTACAGGACCTGCTGCTGCTGGACGTGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGGACAAGTCTGAGAAGGTACAGGACCTGCTGCTGCTGGACGTGGCTCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTGTCCCTGGGGCTGGAGACGGCTGGGGGCGTGATGACTGCCTTGATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
 101201 CTGTCCCTGGGGCTGGAGACGGCTGGGGGCGTGATGACTGCCCTGATAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCGCAACTCCACCATCCCCACCAAGCAGACACAGATTTTCACCACCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCGCAACTCCACCATCCCCACCAAGCAGACACAGATTTTCACCACCTACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTGACAACCAACCCGGGGTGCTGATCCAGGTGTATGAGGGCGAGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTGACAACCAACCCGGGGTGCTGATCCAGGTGTATGAGGGCGAGAGGGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATGACAAAGGACAACAACCTGCTGGGGCGGTTTGACCTGACTGGAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATGACAAAGGACAACAACCTGCTGGGGCGGTTTGACCTGACTGGAATCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TCCAGCACCCAGGGGAGTTCCTCAGATCGAGGTGACGTTTGACATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TCCAGCACCCAGGGGAGTTCCTCAGATCGAGGTGACGTTTGACATTGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCAATGGTATTCTCAATGTCACAGCCATGGACAAGAGCACCGGCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 101451 CCAATGGTATTCTCAATGTCACAGCCACGGACAAGAGCACCGGCAAGGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AACAAGATCACCATCGCCAATGACAAGGGCCGCCTGAGCAAGGAGGAGAT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AACAAGATCACCATCACCAATGACAAGGGCCGCCTGAGCAAGGAGGAGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TGAGCGCATGGTTCTGGATGCTGAGAAATATAAAGCTGAAGATGAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TGAGCGCATGGTTCTGGATGCTGAGAAATATAAAGCTGAAGATGAGGTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGAGGGAGAAAATTGCTGCAAAGAATGCCTTAGAATCCTATGCTTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGAGGGAGAAAATTGCTGCAAAGAATGCCTTAGAATCCTATGCTTTTAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 ATGAAGAGTGTTGTGAGTGATGAAGGTTTGAAGGGCAAGATTAGTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 ATGAAGAGTGTTGTGAGTGATGAAGGTTTGAAGGGCAAGATTAGTGAGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TGATAAAAATAAAATATTGGATAAATGCAACGAGCTCCTTTCGTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TGATAAAAATAAAATATTGGATAAATGCAACGAGCTCCTTTCGTGGCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AGGTCAATCAACTGGCAGAGAAAGATGAGTTTGATCATAAGAGAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGGTCAATCAACTGGCAGAGAAAGATGAGTTTGATCATAAGAGAAAGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TTGGAGCAGATGTGTAACCCTATCATCACAAAACTCTACCAAGGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TTGGAGCAGATGTGTAACCCTATCATCACAAAACTCTACCAAGGAGGATG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CACTGGGCCTGCCTGCGGAACAGGGTATGTGCCTGGAAGGCCTGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CACTGGGCCTGCCTGCGGAACAGGGTATGTGCCTGGAAGGCCTGCCACAG

   1900     .    :    .    :
   1901 GCCCCACAATTGAAGAAGTAGAT
        |||||||||||||||||||||||
 101901 GCCCCACAATTGAAGAAGTAGAT