seq1 = pF1KB8698.tfa, 1755 bp
seq2 = pF1KB8698/gi568815590f_63075329.tfa (gi568815590f:63075329_63287746), 212418 bp

>pF1KB8698 1755
>gi568815590f:63075329_63287746 (Chr8)

1-24  (93550-93573)   100% ->
25-49  (94059-94083)   100% ->
50-135  (100003-100088)   98% ->
136-1734  (110819-112417)   99% ->
1735-1755  (134355-134375)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGCCACTAGCGTGGATCAG         AGACCTAAAGGGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  93550 ATGTCAGCCACTAGCGTGGATCAGGTG...CAGAGACCTAAAGGGCAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AAATAAAG         TTTCAGTACAAAACGGTTCGATTCATCAAAAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
  94076 AAATAAAGGTG...TAGTTTCAGTACAAAACGGTTCGATTCATCAAAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 ATGCTGTAAATGATGACGATTTTGAGCCATACTTAAGTAGCCAGACAAAT
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100036 ATGCTGTAAATGATGATGATTTTGAGCCATACTTAAGTAGCCAGACAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CAG         AGTAACAGCTATCCACCAATGTCAGATCCATACATGCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100086 CAGGTA...CAGAGTAACAGCTATCCACCAATGTCAGATCCATACATGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 TAGTTACTATGCTCCATCCATTGGATTTCCATATTCCCTTGGGGAAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 110857 TAGTTACTATGCTCCATCCATTGGATTTCCATATTCTCTTGGGGAAGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CGTGGTCCACAGCTGGAGACCAGCCTATGCCATATCTGACAACCTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110907 CGTGGTCCACAGCTGGAGACCAGCCTATGCCATATCTGACAACCTATGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CAAATGAGTAATGGAGAACATCACTATATACCAGATGGTGTATTTAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110957 CAAATGAGTAATGGAGAACATCACTATATACCAGATGGTGTATTTAGTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACCTGGGGCATTAGGAAATACCCCTCCATTTCTTGGTCAACATGGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111007 ACCTGGGGCATTAGGAAATACCCCTCCATTTCTTGGTCAACATGGATTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACTTTTTTCCTGGTAATGCTGATTTCTCTACATGGGGGACACGTGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 111057 ACTTTTTTCCTGGTAATGCTGATTTCTCTACATGGGGGACAAGTGGATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGGGACAATCAACACAAAGTTCTGCTTATAGTAGCAGTTATGGCTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111107 CAGGGACAATCAACACAAAGTTCTGCTTATAGTAGCAGTTATGGCTATCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACCTAGTTCTCTTGGGAGAGCTATTACTGATGGACAGGCTGGATTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111157 ACCTAGTTCTCTTGGGAGAGCTATTACTGATGGACAGGCTGGATTTGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGATACTTTGAGTAAGGTGCCTGGCATTAGCAGTATTGAGCAAGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111207 ATGATACTTTGAGTAAGGTGCCTGGCATTAGCAGTATTGAGCAAGGCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTGGACTGAAAATTGGTGGTGACCTGACAGCTGCAGTGACAAAAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111257 ACTGGACTGAAAATTGGTGGTGACCTGACAGCTGCAGTGACAAAAACTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGGTACAGCTTTGAGCAGCAGTGGTATGACTAGCATTGCAACCAATAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111307 AGGTACAGCTTTGAGCAGCAGTGGTATGACTAGCATTGCAACCAATAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCCCCCAGTTAGCAGTGCAGCACCTAAACCAACCTCCTGGGCTGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111357 TGCCCCCAGTTAGCAGTGCAGCACCTAAACCAACCTCCTGGGCTGCCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCCAGAAAGCCTGCCAAACCTCAACCGAAACTTAAACCCAAGGGCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111407 GCCAGAAAGCCTGCCAAACCTCAACCGAAACTTAAACCCAAGGGCAATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGGAATTGGGGGTTCTGCTGTACCACCACCTCCTATAAAACACAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111457 GGGAATTGGGGGTTCTGCTGTACCACCACCTCCTATAAAACACAACATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATATTGGAACTTGGGATGAAAAAGGGTCAGTGGTAAAGGCTCCACCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111507 ATATTGGAACTTGGGATGAAAAAGGGTCAGTGGTAAAGGCTCCACCAACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAACCAGTTCTGCCTCCTCAAACTATAATCCAGCAGCCTCAGCCATTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111557 CAACCAGTTCTGCCTCCTCAAACTATAATCCAGCAGCCTCAGCCATTAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TCAACCACCACCATTGGTGCAAAGCCAACTGCCTCAACAGCAGCCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111607 TCAACCACCACCATTGGTGCAAAGCCAACTGCCTCAACAGCAGCCTCAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CACCACAACCACAGCAGCAACAAGGACCTCAGCCACAGGCCCAGCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111657 CACCACAACCACAGCAGCAACAAGGACCTCAGCCACAGGCCCAGCCTCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CAAGTGCAGCCTCAACAGCAGCAGCTGCAGAATCGCTGGGTAGCTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111707 CAAGTGCAGCCTCAACAGCAGCAGCTGCAGAATCGCTGGGTAGCTCCTCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TAACAGGGGAGCAGGCTTCAACCAGAACAATGGAGCGGGCAGTGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111757 TAACAGGGGAGCAGGCTTCAACCAGAACAATGGAGCGGGCAGTGAAAACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TTGGTTTAGGTGTTGTATCTGTCAGTGCTTCACCTTCTAGTGTAGAAGTG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 111807 TTGGTTTAGGTGTTGTACCTGTCAGTGCTTCACCTTCTAGTGTAGAAGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CATCCCGTGCTGGAAAAGCTAAAGGCCATAAACAACTATAATCCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111857 CATCCCGTGCTGGAAAAGCTAAAGGCCATAAACAACTATAATCCCAAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTTTGATTGGAATCTGAAGAATGGACGTGTGTTTATAATTAAAAGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111907 CTTTGATTGGAATCTGAAGAATGGACGTGTGTTTATAATTAAAAGCTACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CTGAGGATGACATACATCGTTCCATTAAATACTCTATCTGGTGTAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111957 CTGAGGATGACATACATCGTTCCATTAAATACTCTATCTGGTGTAGTACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GAGCATGGTAATAAGCGTTTGGATGCAGCTTACCGTTCCCTGAATGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112007 GAGCATGGTAATAAGCGTTTGGATGCAGCTTACCGTTCCCTGAATGGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 AGGCCCACTCTATTTACTCTTCAGTGTGAATGGCAGTGGACATTTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112057 AGGCCCACTCTATTTACTCTTCAGTGTGAATGGCAGTGGACATTTTTGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GAGTGGCTGAAATGAAGTCTGTTGTGGACTATAATGCGTATGCTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112107 GAGTGGCTGAAATGAAGTCTGTTGTGGACTATAATGCGTATGCTGGTGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 TGGTCTCAGGATAAGTGGAAGGGCAAATTTGAAGTTAAATGGATCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112157 TGGTCTCAGGATAAGTGGAAGGGCAAATTTGAAGTTAAATGGATCTTTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CAAAGATGTTCCCAATAACCAATTACGGCATATTCGCTTAGAAAATAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112207 CAAAGATGTTCCCAATAACCAATTACGGCATATTCGCTTAGAAAATAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 ACAACAAACCGGTTACCAATTCAAGGGACACTCAAGAGGTACCCCTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112257 ACAACAAACCGGTTACCAATTCAAGGGACACTCAAGAGGTACCCCTAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 AAAGCTAAGCAAGTGCTTAAAATAATTGCTACTTTCAAGCATACCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112307 AAAGCTAAGCAAGTGCTTAAAATAATTGCTACTTTCAAGCATACCACCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 AATCTTTGATGACTTTGCACATTATGAAAAGCGTCAAGAAGAGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112357 AATCTTTGATGACTTTGCACATTATGAAAAGCGTCAAGAAGAGGAGGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 CCATGCGTAGG         GAGAGAAATAGAAACAAACAA
        |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 112407 CCATGCGTAGGGTA...CAGGAGAGAAATAGAAACAAACAA