seq1 = pF1KB8684.tfa, 1137 bp
seq2 = pF1KB8684/gi568815594r_4167892.tfa (gi568815594r:4167892_4383742), 215851 bp

>pF1KB8684 1137
>gi568815594r:4167892_4383742 (Chr4)

(complement)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-237  (101846-101960)   100% ->
238-345  (103994-104101)   100% ->
346-429  (104213-104296)   100% ->
430-832  (108974-109376)   100% ->
833-919  (110074-110160)   100% ->
920-1005  (115128-115213)   100% ->
1006-1137  (115720-115851)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTATTTTTTACATGCAATGCATGTGGTGAATCAGTGAAGAAAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTATTTTTTACATGCAATGCATGTGGTGAATCAGTGAAGAAAATACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGGAAAAGCATGTGTCTGTTTGCAGAAACTGTGAATGCCTTTCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGGAAAAGCATGTGTCTGTTTGCAGAAACTGTGAATGCCTTTCTTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGACTGCGGTAAAGATTTCTG         GGGCGATGACTATAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 TTGACTGCGGTAAAGATTTCTGGTA...AAGGGGCGATGACTATAAAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACGTGAAATGCATAAGTGAAGATCAGAAGTATGGTGGCAAAGGCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101865 CACGTGAAATGCATAAGTGAAGATCAGAAGTATGGTGGCAAAGGCTATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGTAAAACCCACAAAGGCGACATCAAACAGCAGGCGTGGATTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101915 AGGTAAAACCCACAAAGGCGACATCAAACAGCAGGCGTGGATTCAGGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    238      AAAATTAGTGAATTAATAAAGAGACCCAATGTCAGCCCCAAAGTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101965 ..TAGAAAATTAGTGAATTAATAAAGAGACCCAATGTCAGCCCCAAAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAGAACTTTTAGAGCAAATTAGTGCTTTTGACAACGTTCCCAGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104039 AGAGAACTTTTAGAGCAAATTAGTGCTTTTGACAACGTTCCCAGGAAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCAAAATTTCAG         AATTGGATGAAGAACAGTTTAAAAGTTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104089 GGCAAAATTTCAGGTA...CAGAATTGGATGAAGAACAGTTTAAAAGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAATGAATCCATTCTGGACCAGGTGTGGAATATCTTTTCTGAAGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104241 ATAATGAATCCATTCTGGACCAGGTGTGGAATATCTTTTCTGAAGCTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACAGC         GAACCAGTCAATAAGGAACAGGATCAACGGCCACT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104291 AACAGCGTA...AAGGAACCAGTCAATAAGGAACAGGATCAACGGCCACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCACCCAGTGGCAAATCCACATGCAGAAATCTCCACCAAGGTTCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109009 CCACCCAGTGGCAAATCCACATGCAGAAATCTCCACCAAGGTTCCAGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAAAGTGAAAGACGCCGTGGAACAGCAAGGGGAGGTGAAGAAGAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109059 CCAAAGTGAAAGACGCCGTGGAACAGCAAGGGGAGGTGAAGAAGAATAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGAGAAAGAAAGGAAGAACGGCAGAAGAAAAGGAAAAGAGAAAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109109 AGAGAAAGAAAGGAAGAACGGCAGAAGAAAAGGAAAAGAGAAAAGAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTAAAGTTAGAAAACCACCAGGAAAACTCAAGGAATCAGAAGCCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109159 ACTAAAGTTAGAAAACCACCAGGAAAACTCAAGGAATCAGAAGCCTAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCGCAAAAAGGGACAGGAGGCTGACCTTGAGGCTGGTGGGGAGGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109209 AGCGCAAAAAGGGACAGGAGGCTGACCTTGAGGCTGGTGGGGAGGAAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCTGAGGCCAATGGCTCTGCAGGGAAGAGGAGCAAGAAGAAGAAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109259 CCTGAGGCCAATGGCTCTGCAGGGAAGAGGAGCAAGAAGAAGAAGCAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CAAGGACAGCGCCAGTGAGGAAGAGGCACGCGTGGGCGCAGGGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109309 CAAGGACAGCGCCAGTGAGGAAGAGGCACGCGTGGGCGCAGGGAAGAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCGGAGGCACTCGGAAG         TTGAAACAGATTCTAAGAAGAAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 109359 AGCGGAGGCACTCGGAAGGTA...TAGTTGAAACAGATTCTAAGAAGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AAGATGAAGCTCCCAGAGCATCCTGAGGGCGGAGAACCAGAAGACGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110097 AAGATGAAGCTCCCAGAGCATCCTGAGGGCGGAGAACCAGAAGACGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGCTCCTGCAAAAG         GTAAATTCAACTGGAAGGGAACTATTA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110147 GGCTCCTGCAAAAGGTA...TAGGTAAATTCAACTGGAAGGGAACTATTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AAGCAATTCTGAAACAGGCCCCAGACAATGAAATAACCATCAAAAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115155 AAGCAATTCTGAAACAGGCCCCAGACAATGAAATAACCATCAAAAAGCTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGGAAAAAG         GTTTTAGCTCAGTACTACACAGTGACAGATGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 115205 AGGAAAAAGGTA...AAGGTTTTAGCTCAGTACTACACAGTGACAGATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCATCACAGATCCGAAGAGGAACTCCTGGTCATCTTTAACAAGAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115752 GCATCACAGATCCGAAGAGGAACTCCTGGTCATCTTTAACAAGAAAATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCAAGAACCCTACCTTTAAGTTATTAAAGGACAAAGTCAAGCTTGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115802 GCAAGAACCCTACCTTTAAGTTATTAAAGGACAAAGTCAAGCTTGTGAAA