seq1 = pF1KB8683.tfa, 2016 bp
seq2 = pF1KB8683/gi568815581f_41830724.tfa (gi568815581f:41830724_42065480), 234757 bp

>pF1KB8683 2016
>gi568815581f:41830724_42065480 (Chr17)

1-114  (100001-100114)   100% ->
115-246  (104494-104625)   100% ->
247-397  (104876-105026)   100% ->
398-459  (105750-105811)   100% ->
460-625  (106039-106204)   100% ->
626-850  (107834-108058)   100% ->
851-1058  (108242-108449)   100% ->
1059-1145  (114413-114499)   100% ->
1146-1342  (118430-118626)   100% ->
1343-1443  (124494-124594)   100% ->
1444-1528  (130659-130743)   100% ->
1529-2016  (134270-134757)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGACCCCGAAGGCGAGACCTTGCGAAGCACCTTTCCCTCTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGACCCCGAAGGCGAGACCTTGCGAAGCACCTTTCCCTCTTATAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGAAGGCGAGCGGCTCTACCTGTGCGGGGAATTTTCTAAAGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGAAGGCGAGCGGCTCTACCTGTGCGGGGAATTTTCTAAAGCCGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGCTTCAGCAAC         GCTCTTTACCTTCAGGATGGAGACAAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGCTTCAGCAACGTG...CAGGCTCTTTACCTTCAGGATGGAGACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACTGCCTGGTTGCTCGCTCAAAGTGCTTCCTGAAGATGGGAGACTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104521 AACTGCCTGGTTGCTCGCTCAAAGTGCTTCCTGAAGATGGGAGACTTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGATCCCTGAAGGATGCTGAGGCTTCGCTCCAGAGTGACCCAGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104571 GAGATCCCTGAAGGATGCTGAGGCTTCGCTCCAGAGTGACCCAGCTTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTAAG         GGGATTTTGCAAAAGGCTGAGACACTGTACACCATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104621 GTAAGGTG...CAGGGGATTTTGCAAAAGGCTGAGACACTGTACACCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAGACTTTGAGTTTGCCTTGGTATTCTATCATCGAGGCTACAAGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104912 GGAGACTTTGAGTTTGCCTTGGTATTCTATCATCGAGGCTACAAGCTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCCTGATCGGGAATTCAGAGTTGGCATTCAGAAAGCCCAGGAAGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104962 GCCTGATCGGGAATTCAGAGTTGGCATTCAGAAAGCCCAGGAAGCCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAACTCAGTGGGAA         GTCCTTCTTCCATTAAGCTGGAGAAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105012 ACAACTCAGTGGGAAGTG...CAGGTCCTTCTTCCATTAAGCTGGAGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAGGGGACCTCTCCTTCTTAAGCAAGCAGGCTGAG         AATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105776 AAAGGGGACCTCTCCTTCTTAAGCAAGCAGGCTGAGGTA...CAGAATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAAAGCCCAGCAGAAGCCTCAGCCCATGAAACACCTCTTACACCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106044 AAAAGCCCAGCAGAAGCCTCAGCCCATGAAACACCTCTTACACCCCACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGGAGAGCCCAAGTGGAAGGCCTCGCTCAAGAGTGAGAAGACTGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106094 AGGGAGAGCCCAAGTGGAAGGCCTCGCTCAAGAGTGAGAAGACTGTCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGCTTCTGGGGGAGCTCTACGTGGACAAAGAGTATTTGGAGAAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106144 CAGCTTCTGGGGGAGCTCTACGTGGACAAAGAGTATTTGGAGAAGCTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATTGGATGAAG         ACCTGATCAAAGGCACCATGAAGGGCGGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 106194 ATTGGATGAAGGTT...CAGACCTGATCAAAGGCACCATGAAGGGCGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGACTGTGGAGGACCTCATCATGACGGGCATCAACTACCTGGATACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107864 TGACTGTGGAGGACCTCATCATGACGGGCATCAACTACCTGGATACTCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCAACTTCTGGAGGCAGCAGAAGCCGATCTACGCCAGGGAGCGGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107914 AGCAACTTCTGGAGGCAGCAGAAGCCGATCTACGCCAGGGAGCGGGACCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAGCTGATGCAAGAGAAATGGCTGCGGGACCACAAACGCCGTCCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107964 GAAGCTGATGCAAGAGAAATGGCTGCGGGACCACAAACGCCGTCCCTCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGACAGCCCATTACATCCTCAAGAGCCTGGAGGACATTGATATGT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 108014 AGACAGCCCATTACATCCTCAAGAGCCTGGAGGACATTGATATGTGTA..

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851     TGCTCACAAGTGGCAGTGCTGAAGGGAGTCTTCAGAAAGCTGAGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108064 .CAGTGCTCACAAGTGGCAGTGCTGAAGGGAGTCTTCAGAAAGCTGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGTGCTGAAGAAGGTACTGGAATGGAACAAGGAAGAGGTACCCAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108288 AGTGCTGAAGAAGGTACTGGAATGGAACAAGGAAGAGGTACCCAACAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATGAACTGGTTGGAAACTTGTATAGCTGCATAGGGAATGCCCAGATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108338 ATGAACTGGTTGGAAACTTGTATAGCTGCATAGGGAATGCCCAGATTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGGGGCAGATGGAGGCAGCCCTGCAGAGCCACAGAAAGGACCTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108388 CTGGGGCAGATGGAGGCAGCCCTGCAGAGCCACAGAAAGGACCTGGAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CGCCAAGGAATA         TGACCTTCCTGATGCAAAATCGAGAGCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 108438 CGCCAAGGAATAGTG...CAGTGACCTTCCTGATGCAAAATCGAGAGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTGACAACATTGGCAGAGTTTTTGCCAGAGTTGGGAAATTCCAGCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114442 TTGACAACATTGGCAGAGTTTTTGCCAGAGTTGGGAAATTCCAGCAAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATTGACAC         GTGGGAAGAAAAGATCCCTCTGGCAAAAACCAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 114492 ATTGACACGTG...CAGGTGGGAAGAAAAGATCCCTCTGGCAAAAACCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCTGGAGAAGACCTGGCTGTTCCACGAGATCGGCCGCTGCTACTTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118463 CCTGGAGAAGACCTGGCTGTTCCACGAGATCGGCCGCTGCTACTTGGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGGACCAGGCCTGGCAGGCCCAGAATTATGGCGAGAAGTCCCAGCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118513 TGGACCAGGCCTGGCAGGCCCAGAATTATGGCGAGAAGTCCCAGCAGTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCCGAGGAGGAAGGGGACATTGAGTGGCAACTGAATGCCAGTGTTCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118563 GCCGAGGAGGAAGGGGACATTGAGTGGCAACTGAATGCCAGTGTTCTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCCCAGGCACAAG         TGAAGCTGAGAGACTTCGAGTCAGCCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 118613 GGCCCAGGCACAAGGTA...CAGTGAAGCTGAGAGACTTCGAGTCAGCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGAACAATTTTGAGAAGGCCCTGGAGAGAGCAAAGCTTGTGCATAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124521 TGAACAATTTTGAGAAGGCCCTGGAGAGAGCAAAGCTTGTGCATAACAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGGCGCAGCAGGCCATCATCAGT         GCCTTGGACGATGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 124571 GAGGCGCAGCAGGCCATCATCAGTGTG...CAGGCCTTGGACGATGCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CAAGGGTATCATCAGAGAACTGAGGAAAACCAACTACGTGGAGAATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130676 CAAGGGTATCATCAGAGAACTGAGGAAAACCAACTACGTGGAGAATCTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AAGAAAAAAGCGAGGGAG         AAGCTTCACTGTATGAAGATAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 130726 AAGAAAAAAGCGAGGGAGGTG...CAGAAGCTTCACTGTATGAAGATAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ATAATAACAAGAGAGAAGGACATGAGGAGAGTGAGAGATGAGCCCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134293 ATAATAACAAGAGAGAAGGACATGAGGAGAGTGAGAGATGAGCCCGAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GGTGGTGAAGCAGTGGGACCATAGTGAGGATGAGAAAGAGACAGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134343 GGTGGTGAAGCAGTGGGACCATAGTGAGGATGAGAAAGAGACAGATGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACGATGAGGCTTTTGGGGAAGCTCTGCAGAGCCCAGCAAGCGGAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134393 ACGATGAGGCTTTTGGGGAAGCTCTGCAGAGCCCAGCAAGCGGAAAGCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AGTGTGGAAGCAGGAAAAGCCAGAAGCGATTTGGGAGCAGTTGCCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134443 AGTGTGGAAGCAGGAAAAGCCAGAAGCGATTTGGGAGCAGTTGCCAAGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCTGTCAGGAGAATTAGGCACAAGATCAGGAGAAACAGGCAGGAAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134493 CCTGTCAGGAGAATTAGGCACAAGATCAGGAGAAACAGGCAGGAAGCTAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TAGAAGCTGGCAGAAGAGAGTCAAGAGAAATTTATAGGAGGCCTTCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134543 TAGAAGCTGGCAGAAGAGAGTCAAGAGAAATTTATAGGAGGCCTTCGGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GAATTAGAGCAAAGACTCTCAGGAGAATTCAGCAGACAGGAACCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134593 GAATTAGAGCAAAGACTCTCAGGAGAATTCAGCAGACAGGAACCAGAAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 ACTAAAGAAACTTTCAGAAGTGGGCAGAAGAGAGCCAGAAGAACTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134643 ACTAAAGAAACTTTCAGAAGTGGGCAGAAGAGAGCCAGAAGAACTGGGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 AAACACAATTTGGAGAAATAGGAGAAACGAAAAAAACAGGAAATGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134693 AAACACAATTTGGAGAAATAGGAGAAACGAAAAAAACAGGAAATGAGATG

   2100     .    :    .
   2002 GAAAAGGAATATGAA
        |||||||||||||||
 134743 GAAAAGGAATATGAA