seq1 = pF1KB8681.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KB8681/gi568815589r_128021148.tfa (gi568815589r:128021148_128227717), 206570 bp

>pF1KB8681 1131
>gi568815589r:128021148_128227717 (Chr9)

(complement)

1-279  (100001-100279)   100% ->
280-477  (102277-102474)   100% ->
478-536  (103168-103226)   100% ->
537-686  (103867-104016)   100% ->
687-887  (104584-104784)   100% ->
888-1005  (105239-105356)   100% ->
1006-1131  (106445-106570)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCGGCTGCGCGGGTGGTGCGGGCGCTGTGGCCTGGTGGGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCGGCTGCGCGGGTGGTGCGGGCGCTGTGGCCTGGTGGGTGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGGCCTGGAGGCTGGGAGGCCGCCCCCAGCCGCTGCTACCCACGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGGCCTGGAGGCTGGGAGGCCGCCCCCAGCCGCTGCTACCCACGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCGGGCTGGCTTCGCGGGGGCGGCGGGCGGCCCGAGCCCCGTGGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCGGGCTGGCTTCGCGGGGGCGGCGGGCGGCCCGAGCCCCGTGGCTGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTCGTAAGGGGAGCCCGCGGCTGCTGGGAGCTGCGGCGCTGGCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTCGTAAGGGGAGCCCGCGGCTGCTGGGAGCTGCGGCGCTGGCCCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGAGCCCTGGGGCTGTACCACACGGCGCGGTGGCACCTGCGCGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGAGCCCTGGGGCTGTACCACACGGCGCGGTGGCACCTGCGCGCCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCCACGCAGAGCGCTCAGCCGCGCAG         CTCTCCCTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100251 ACCTCCACGCAGAGCGCTCAGCCGCGCAGGTA...CAGCTCTCCCTGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCCGCCTGCAGCTGACCCTGTACCAGTACAAGACGTGTCCCTTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102289 AGCCGCCTGCAGCTGACCCTGTACCAGTACAAGACGTGTCCCTTCTGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGGTCCGAGCCTTCCTCGACTTCCATGCCCTGCCCTACCAGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102339 CAAGGTCCGAGCCTTCCTCGACTTCCATGCCCTGCCCTACCAGGTGGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGTGAACCCTGTGCGCAGGGCTGAGATCAAGTTCTCCTCCTACAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102389 AGGTGAACCCTGTGCGCAGGGCTGAGATCAAGTTCTCCTCCTACAGAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGCCCATCCTGGTGGCCCAGGAAGGAGAAAGCTCG         CAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102439 GTGCCCATCCTGGTGGCCCAGGAAGGAGAAAGCTCGGTG...CAGCAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACTAAATGACTCCTCTGTCATCATCAGCGCCCTCAAGACCTACCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103173 ACTAAATGACTCCTCTGTCATCATCAGCGCCCTCAAGACCTACCTGGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CGGG         GCAGCCCCTGGAAGAGATCATCACCTACTACCCAGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103223 CGGGGTA...AAGGCAGCCCCTGGAAGAGATCATCACCTACTACCCAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATGAAGGCTGTGAACGAGCAGGGCAAGGAGGTGACCGAGTTCGGCAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103904 ATGAAGGCTGTGAACGAGCAGGGCAAGGAGGTGACCGAGTTCGGCAATAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTACTGGCTCATGCTCAACGAGAAGGAGGCCCAGCAAGTGTATGGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103954 GTACTGGCTCATGCTCAACGAGAAGGAGGCCCAGCAAGTGTATGGTGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGAGGCCAGGAC         GGAGGAGATGAAGTGGCGGCAGTGGGCG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104004 AGGAGGCCAGGACGTG...CAGGGAGGAGATGAAGTGGCGGCAGTGGGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACGACTGGCTGGTGCACCTGATCTCCCCCAATGTGTACCGCACGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104612 GACGACTGGCTGGTGCACCTGATCTCCCCCAATGTGTACCGCACGCCCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGAGGCTCTGGCGTCCTTTGACTACATTGTCCGCGAGGGCAAGTTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104662 CGAGGCTCTGGCGTCCTTTGACTACATTGTCCGCGAGGGCAAGTTCGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCGTGGAGGGTGCCGTGGCCAAGTACATGGGTGCAGCGGCCATGTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104712 CCGTGGAGGGTGCCGTGGCCAAGTACATGGGTGCAGCGGCCATGTACCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATCAGCAAGCGACTCAAGAGCAG         GCACCGCCTCCAGGACAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104762 ATCAGCAAGCGACTCAAGAGCAGGCA...CAGGCACCGCCTCCAGGACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CGTGCGCGAGGACCTCTATGAGGCTGCTGACAAGTGGGTGGCTGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105257 CGTGCGCGAGGACCTCTATGAGGCTGCTGACAAGTGGGTGGCTGCTGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCAAGGACCGGCCCTTCATGGGGGGCCAGAAGCCGAATCTCGCTGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105307 GCAAGGACCGGCCCTTCATGGGGGGCCAGAAGCCGAATCTCGCTGATTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006          GCGGTGTATGGCGTGCTGCGTGTGATGGAGGGGCTGGATGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105357 GTG...CAGGCGGTGTATGGCGTGCTGCGTGTGATGGAGGGGCTGGATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ATTCGATGACCTGATGCAGCACACGCACATCCAGCCCTGGTACCTGCGGG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106486 GTTCGATGACCTGATGCAGCACACGCACATCCAGCCCTGGTACCTGCGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1097 TGGAGAGGGCCATCACCGAGGCCTCCCCAGCGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106536 TGGAGAGGGCCATCACCGAGGCCTCCCCAGCGCAC