seq1 = pF1KB8678.tfa, 1128 bp
seq2 = pF1KB8678/gi568815588r_102380866.tfa (gi568815588r:102380866_102602647), 221782 bp

>pF1KB8678 1128
>gi568815588r:102380866_102602647 (Chr10)

(complement)

1-48  (100001-100048)   100% ->
49-113  (112035-112099)   100% ->
114-189  (113510-113585)   100% ->
190-315  (114373-114498)   100% ->
316-440  (116915-117039)   100% ->
441-657  (118272-118488)   100% ->
658-750  (119545-119637)   100% ->
751-925  (120473-120647)   100% ->
926-987  (120750-120811)   100% ->
988-1028  (121476-121516)   100% ->
1029-1128  (121683-121782)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTCCTACGATGTGATCGCCAACCAGCCTGTCGTGATCGACAAC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100001 ATGGAGTCCTACGATGTGATCGCCAACCAGCCTGTCGTGATCGACAACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49        GGATCCGGTGTGATTAAAGCTGGTTTTGCTGGTGATCAGATCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 G...CAGGGATCCGGTGTGATTAAAGCTGGTTTTGCTGGTGATCAGATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAAATACTGCTTTCCAAACTA         TGTGGGCCGACCCAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 112078 CCAAATACTGCTTTCCAAACTAGTA...TAGTGTGGGCCGACCCAAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTTCGTGTCATGGCAGGAGCCCTTGAAGGCGACATCTTCATTGGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113529 GTTCGTGTCATGGCAGGAGCCCTTGAAGGCGACATCTTCATTGGCCCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGCTGAG         GAGCACCGAGGGCTGCTTTCAATCCGCTATCCCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113579 AGCTGAGGTA...CAGGAGCACCGAGGGCTGCTTTCAATCCGCTATCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGGAGCATGGCATCGTCAAGGATTGGAACGACATGGAACGCATTTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114407 TGGAGCATGGCATCGTCAAGGATTGGAACGACATGGAACGCATTTGGCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TATGTCTATTCTAAGGACCAGCTGCAGACTTTCTCAGAGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 114457 TATGTCTATTCTAAGGACCAGCTGCAGACTTTCTCAGAGGAGGTG...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    316  CATCCTGTGCTCCTGACTGAGGCGCCTTTAAACCCACGAAAAAACCGGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116914 GCATCCTGTGCTCCTGACTGAGGCGCCTTTAAACCCACGAAAAAACCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AACGAGCTGCCGAAGTTTTCTTCGAGACCTTCAATGTGCCCGCTCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116964 AACGAGCTGCCGAAGTTTTCTTCGAGACCTTCAATGTGCCCGCTCTTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCTCCATGCAAGCTGTACTCAGCCT         TTACGCTACAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 117014 ATCTCCATGCAAGCTGTACTCAGCCTGTG...CAGTTACGCTACAGGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GACCACAGGGGTGGTGCTGGATTCTGGGGATGGAGTCACCCATGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118287 GACCACAGGGGTGGTGCTGGATTCTGGGGATGGAGTCACCCATGCTGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCATCTATGAGGGCTTTGCCATGCCCCACTCCATCATGCGCATCGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118337 CCATCTATGAGGGCTTTGCCATGCCCCACTCCATCATGCGCATCGACATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCGGGCCGGGACGTCTCTCGCTTCCTGCGCCTCTACCTGCGTAAGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118387 GCGGGCCGGGACGTCTCTCGCTTCCTGCGCCTCTACCTGCGTAAGGAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTACGACTTCCACTCATCCTCTGAGTTTGAGATTGTCAAGGCCATAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118437 CTACGACTTCCACTCATCCTCTGAGTTTGAGATTGTCAAGGCCATAAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AA         AGAGCCTGTTACCTATCCATAAACCCCCAAAAGGATGAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118487 AAGTA...CAGAGAGCCTGTTACCTATCCATAAACCCCCAAAAGGATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACGCTAGAGACAGAGAAAGCTCAGTACTACCTGCCTGATGGCAGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119584 ACGCTAGAGACAGAGAAAGCTCAGTACTACCTGCCTGATGGCAGCACCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAG         ATTGGTCCTTCCCGATTCCGGGCCCCTGAGTTGCTCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119634 TGAGGTA...CAGATTGGTCCTTCCCGATTCCGGGCCCCTGAGTTGCTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCAGGCCAGATTTGATTGGAGAGGAGAGTGAAGGCATCCACGAGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120510 TCAGGCCAGATTTGATTGGAGAGGAGAGTGAAGGCATCCACGAGGTCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTGTTCGCCATTCAGAAGTCAGACATGGACCTGCGGCGCACGCTTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120560 GTGTTCGCCATTCAGAAGTCAGACATGGACCTGCGGCGCACGCTTTTCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TAACATTGTCCTCTCAGGAGGCTCTACCCTGTTCAAAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 120610 TAACATTGTCCTCTCAGGAGGCTCTACCCTGTTCAAAGGTT...CAGGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTGGTGACAGGCTCCTGAGTGAAGTGAAGAAACTAGCTCCAAAAGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120753 TTGGTGACAGGCTCCTGAGTGAAGTGAAGAAACTAGCTCCAAAAGATGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAGATCAGG         ATATCTGCACCTCAGGAGAGACTGTATTCCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120803 AAGATCAGGGTA...CAGATATCTGCACCTCAGGAGAGACTGTATTCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GTGGATTGG         GGGCTCCATCCTTGCCTCCCTGGACACCTTTA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121508 GTGGATTGGGTG...CAGGGGCTCCATCCTTGCCTCCCTGGACACCTTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGAAGATGTGGGTCTCCAAAAAGGAATATGAGGAAGACGGTGCCCGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121715 AGAAGATGTGGGTCTCCAAAAAGGAATATGAGGAAGACGGTGCCCGATCC

   1200     .    :    .
   1111 ATCCACAGAAAAACCTTC
        ||||||||||||||||||
 121765 ATCCACAGAAAAACCTTC