seq1 = pF1KB8677.tfa, 1104 bp
seq2 = pF1KB8677/gi568815581r_28248120.tfa (gi568815581r:28248120_28457448), 209329 bp

>pF1KB8677 1104
>gi568815581r:28248120_28457448 (Chr17)

(complement)

1-161  (100001-100161)   100% ->
162-243  (101573-101654)   100% ->
244-341  (102864-102961)   100% ->
342-438  (103658-103754)   100% ->
439-514  (104133-104208)   100% ->
515-622  (104430-104537)   100% ->
623-759  (105649-105785)   100% ->
760-786  (106657-106683)   100% ->
787-912  (106886-107011)   100% ->
913-992  (108287-108366)   100% ->
993-1104  (109218-109329)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCTGTACAGCCCGGCGGGCCCTGGCCGTGGGCAGCCGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCTGTACAGCCCGGCGGGCCCTGGCCGTGGGCAGCCGCTGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCCGGTCGCTGACTGGGGCCCGGTGGCCAAGGCCGCTCTGTGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCCCGGTCGCTGACTGGGGCCCGGTGGCCAAGGCCGCTCTGTGCGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGAGCTGGAGCCTTCTCGCCAGCGTCGACCACGACGACGCGGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGAGCTGGAGCCTTCTCGCCAGCGTCGACCACGACGACGCGGAGGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTCGTCCCG         AAACCGACCAGAGGGCAAAGTGTTGGAGAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCTCGTCCCGGTG...CAGAAACCGACCAGAGGGCAAAGTGTTGGAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTTGGTGTGTTTGAGGTGCCAAAACAGAATGGAAAATATGAGACCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101603 AGTTGGTGTGTTTGAGGTGCCAAAACAGAATGGAAAATATGAGACCGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AG         CTTTTCCTTCATAGCATTTTTGGCTACCGAGGTGTCGTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101653 AGGTG...CAGCTTTTCCTTCATAGCATTTTTGGCTACCGAGGTGTCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGTTTCCCTGGCAGGCCAGACTGTATGACCGGGATGTGGCTTCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102903 CTGTTTCCCTGGCAGGCCAGACTGTATGACCGGGATGTGGCTTCTGCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCCAGAAAA         AGCAGAGAACCCTGCTGGCCATGGCTCCAAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102953 TCCAGAAAAGTA...TAGAGCAGAGAACCCTGCTGGCCATGGCTCCAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGTGAAAGGCAAAACTCACACTTACTATCAGGTGCTGATTGATGCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103690 AGGTGAAAGGCAAAACTCACACTTACTATCAGGTGCTGATTGATGCTCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACTGCCCACATATA         TCTCAGAGATCTCAGACAGAAGCTGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103740 GACTGCCCACATATAGTA...TAGTCTCAGAGATCTCAGACAGAAGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GACCTTCTTGGCTAACCATGATGACAGTCGGGCCCTCTATGCCATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104159 GACCTTCTTGGCTAACCATGATGACAGTCGGGCCCTCTATGCCATCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515          GCTTGGACTATGTCAGCCATGAAGACATCCTCCCCTACACC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104209 GTG...CAGGCTTGGACTATGTCAGCCATGAAGACATCCTCCCCTACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCCACTGATCAGGTTCCCATCCAACATGAACTCTTTGAAAGATTTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104471 TCCACTGATCAGGTTCCCATCCAACATGAACTCTTTGAAAGATTTCTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTATGACCAGACAAAAG         CACCTCCTTTTGTGGCTCGGGAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104521 GTATGACCAGACAAAAGGTA...CAGCACCTCCTTTTGTGGCTCGGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CGCTAAGGGCCTGGCAAGAGAAGAATCACCCCTGGCTGGAGCTCTCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105673 CGCTAAGGGCCTGGCAAGAGAAGAATCACCCCTGGCTGGAGCTCTCCGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTTCATCGGGAAACAACTGAGAACATACGTGTCACTGTCATCCCCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105723 GTTCATCGGGAAACAACTGAGAACATACGTGTCACTGTCATCCCCTTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATGGGCATGAGG         GAAGCCCAGAATTCCCACGTGTACTGG 
        |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||>
 105773 CATGGGCATGAGGGTA...TAGGAAGCCCAGAATTCCCACGTGTACTGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    787         TGGCGCTACTGTATCCGTTTGGAGAACCTTGACAGTGATGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106685 TG...CAGTGGCGCTACTGTATCCGTTTGGAGAACCTTGACAGTGATGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GTACAGCTCCGGGAGCGGCACTGGAGGATATTCAGTCTCTCTGGCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106928 GTACAGCTCCGGGAGCGGCACTGGAGGATATTCAGTCTCTCTGGCACCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGAGACAGTGCGAGGCCGAGGGGTAGTGGGCAGG         GAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 106978 GGAGACAGTGCGAGGCCGAGGGGTAGTGGGCAGGGTG...CAGGAACCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGTTATCCAAGGAGCAGCCTGCGTTCCAGTATAGCAGCCACGTCTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108294 TGTTATCCAAGGAGCAGCCTGCGTTCCAGTATAGCAGCCACGTCTCGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CAGGCTTCCAGTGGGCACATGTG         GGGCACGTTCCGCTTTGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108344 CAGGCTTCCAGTGGGCACATGTGGTG...TAGGGGCACGTTCCGCTTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AAGACCTGATGGCTCCCACTTTGATGTTCGGATTCCTCCCTTCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109236 AAGACCTGATGGCTCCCACTTTGATGTTCGGATTCCTCCCTTCTCCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AAAGCAATAAAGATGAGAAGACACCACCCTCAGGCCTTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109286 AAAGCAATAAAGATGAGAAGACACCACCCTCAGGCCTTCACTGG