seq1 = pF1KB8675.tfa, 1866 bp
seq2 = pF1KB8675/gi568815587f_66158595.tfa (gi568815587f:66158595_66366953), 208359 bp

>pF1KB8675 1866
>gi568815587f:66158595_66366953 (Chr11)

1-228  (100001-100228)   100% ->
229-459  (103148-103378)   100% ->
460-529  (103529-103598)   100% ->
530-752  (104220-104442)   100% ->
753-840  (105066-105153)   100% ->
841-942  (105257-105358)   100% ->
943-1116  (105452-105625)   99% ->
1117-1216  (105751-105850)   100% ->
1217-1266  (106429-106478)   100% ->
1267-1334  (106574-106641)   100% ->
1335-1443  (107061-107169)   100% ->
1444-1602  (107260-107418)   100% ->
1603-1727  (107499-107623)   100% ->
1728-1785  (107839-107896)   100% ->
1786-1866  (108279-108359)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCATGATGGTGTTTCCGCGGGAGGAGAAGCTGAGCCAGGATGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCATGATGGTGTTTCCGCGGGAGGAGAAGCTGAGCCAGGATGAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGCTGGGCACCAAGGCTGTCATCCAGGGACTGGAGACTCTGCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGCTGGGCACCAAGGCTGTCATCCAGGGACTGGAGACTCTGCGTGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCATCGTGCCCTGCTGGCTCCTCTGGTTGCACCTGAGGCCGGCGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCATCGTGCCCTGCTGGCTCCTCTGGTTGCACCTGAGGCCGGCGAAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCTGGCTCGCAGGAGCGCTGCATCCTCCTGCGTCGCTCCCTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCCTGGCTCGCAGGAGCGCTGCATCCTCCTGCGTCGCTCCCTGGAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTGAGCTTGGGCTGGGGGAGGCCCAG         GTGATCTTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100201 CATTGAGCTTGGGCTGGGGGAGGCCCAGGTA...CAGGTGATCTTGGCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGTCGAGCCACCTGGGGGCTGTAGAATCAGAGAAGCAGAAGCTGCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103161 TGTCGAGCCACCTGGGGGCTGTAGAATCAGAGAAGCAGAAGCTGCGGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGGTGCGGCGTCTGGTGCAGGAGAACCAGTGGCTGCGTGAGGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103211 CAGGTGCGGCGTCTGGTGCAGGAGAACCAGTGGCTGCGTGAGGAGCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGGACACAGCAGAAGCTGCAGCGCAGTGAGCAGGCCGTGGCCCAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103261 GGGGACACAGCAGAAGCTGCAGCGCAGTGAGCAGGCCGTGGCCCAGCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGAGGAGAAGCAGCACTTGCTGTTCATGAGCCAGATCCGCAAGTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103311 AGGAGGAGAAGCAGCACTTGCTGTTCATGAGCCAGATCCGCAAGTTGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAGACGCCTCCCCTAAC         GAGGAGAAGGGGGACGTCCCCAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103361 GAAGACGCCTCCCCTAACGTG...CAGGAGGAGAAGGGGGACGTCCCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGACACACTGGATGACCTGTTCCCCAATGAGGATGAGCAGAGCCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103552 AGACACACTGGATGACCTGTTCCCCAATGAGGATGAGCAGAGCCCAGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    530       CCCCTAGCCCAGGAGGAGGGGATGTGTCTGGTCAGCATGGGGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103602 ...CAGCCCCTAGCCCAGGAGGAGGGGATGTGTCTGGTCAGCATGGGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACGAGATCCCGGCCCGGCTCCGCACCCTGCACAACCTGGTGATCCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104264 TACGAGATCCCGGCCCGGCTCCGCACCCTGCACAACCTGGTGATCCAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGCCTCACAGGGCCGCTACGAGGTAGCTGTGCCACTCTGCAAGCAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104314 CGCCTCACAGGGCCGCTACGAGGTAGCTGTGCCACTCTGCAAGCAGGCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCGAAGACCTGGAGAAGACGTCAGGCCACGACCACCCTGACGTTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104364 TCGAAGACCTGGAGAAGACGTCAGGCCACGACCACCCTGACGTTGCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATGCTGAACATCCTGGCACTGGTCTATCG         GGATCAGAACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104414 ATGCTGAACATCCTGGCACTGGTCTATCGGTG...CAGGGATCAGAACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GTACAAGGAGGCTGCCCACCTGCTCAATGATGCTCTGGCCATCCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105078 GTACAAGGAGGCTGCCCACCTGCTCAATGATGCTCTGGCCATCCGGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAACACTGGGCAAGGACCACCCAGCC         GTGGCTGCGACACTA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105128 AAACACTGGGCAAGGACCACCCAGCCGTG...CAGGTGGCTGCGACACTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AACAACCTGGCAGTCCTGTATGGCAAGAGGGGCAAGTACAAGGAGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105272 AACAACCTGGCAGTCCTGTATGGCAAGAGGGGCAAGTACAAGGAGGCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCCATTGTGCAAGCGGGCACTGGAGATCCGGGAGAAG         GTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105322 GCCATTGTGCAAGCGGGCACTGGAGATCCGGGAGAAGGTG...CAGGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGGGCAAGTTTCGCCCAGATGTGGCCAAGCAGCTCAGCAACCTGGCCCTG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105456 TGGGCAAGTTTCACCCAGATGTGGCCAAGCAGCTCAGCAACCTGGCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGTGCCAGAACCAGGGCAAAGCTGAGGAGGTGGAATATTACTATCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105506 CTGTGCCAGAACCAGGGCAAAGCTGAGGAGGTGGAATATTACTATCGGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGCACTGGAGATCTATGCTACACGCCTCGGGCCCGATGACCCCAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105556 GGCACTGGAGATCTATGCTACACGCCTCGGGCCCGATGACCCCAATGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCAAGACCAAGAACAACCTG         GCTTCCTGCTACCTGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105606 CCAAGACCAAGAACAACCTGGTA...CAGGCTTCCTGCTACCTGAAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGCAAGTACCAGGATGCGGAGACCTTGTACAAGGAGATCCTCACCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105772 GGCAAGTACCAGGATGCGGAGACCTTGTACAAGGAGATCCTCACCCGCGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCATGAGAAAGAGTTTGGCTCTGTCAATG         GGGACAACAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 105822 TCATGAGAAAGAGTTTGGCTCTGTCAATGGTG...CAGGGGACAACAAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCATCTGGATGCACGCAGAGGAGCGGGAGGAAAGCAAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106441 CCATCTGGATGCACGCAGAGGAGCGGGAGGAAAGCAAGGTA...CAGGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AAGCGCCGGGACAGCGCCCCCTATGGGGAATACGGCAGCTGGTACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106577 AAGCGCCGGGACAGCGCCCCCTATGGGGAATACGGCAGCTGGTACAAGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CTGTAAAGTAGACAG         CCCCACAGTCAACACCACCCTGCGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106627 CTGTAAAGTAGACAGGTG...CAGCCCCACAGTCAACACCACCCTGCGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GCTTGGGGGCCCTATACCGGCGCCAGGGCAAGCTGGAAGCCGCGCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107087 GCTTGGGGGCCCTATACCGGCGCCAGGGCAAGCTGGAAGCCGCGCACACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTAGAGGACTGTGCCAGCCGTAACCGCAAGCAG         GGTTTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107137 CTAGAGGACTGTGCCAGCCGTAACCGCAAGCAGGTG...CAGGGTTTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCCCGCAAGCCAGACCAAGGTGGTAGAACTGCTGAAAGATGGCAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107268 CCCCGCAAGCCAGACCAAGGTGGTAGAACTGCTGAAAGATGGCAGTGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GGCGGGGAGACCGCCGCAGCAGCCGAGACATGGCTGGGGGTGCCGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107318 GGCGGGGAGACCGCCGCAGCAGCCGAGACATGGCTGGGGGTGCCGGGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CGGTCTGAGTCTGACCTCGAGGACGTGGGACCTACAGCTGAGTGGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107368 CGGTCTGAGTCTGACCTCGAGGACGTGGGACCTACAGCTGAGTGGAATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 G         GATGGCAGTGGCTCCTTGAGGCGCAGCGGTTCCTTTGGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107418 GGTG...CAGGATGGCAGTGGCTCCTTGAGGCGCAGCGGTTCCTTTGGGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AACTCCGGGATGCCCTGAGGCGCAGCAGTGAGATGCTGGTAAAGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107539 AACTCCGGGATGCCCTGAGGCGCAGCAGTGAGATGCTGGTAAAGAAGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CAGGGGGGCACCCCCCAGGAGCCCCCTAACCCCAG         GATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 107589 CAGGGGGGCACCCCCCAGGAGCCCCCTAACCCCAGGTG...CAGGATGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCGGGCCAGTTCCCTCAACTTCCTCAACAAGAGCGTGGAAGAGCCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107845 GCGGGCCAGTTCCCTCAACTTCCTCAACAAGAGCGTGGAAGAGCCGACCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AG         CCTGGAGGCACAGGTCTCTCTGACAGCCGCACTCTCAGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107895 AGGTA...CAGCCTGGAGGCACAGGTCTCTCTGACAGCCGCACTCTCAGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TCCAGCTCCATGGACCTCTCCCGACGAAGCTCCCTGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108318 TCCAGCTCCATGGACCTCTCCCGACGAAGCTCCCTGGTGGGC