seq1 = pF1KB8666.tfa, 1086 bp
seq2 = pF1KB8666/gi568815591f_156544497.tfa (gi568815591f:156544497_156776652), 232156 bp

>pF1KB8666 1086
>gi568815591f:156544497_156776652 (Chr7)

14-274  (100001-100261)   100% ->
275-417  (110080-110222)   100% ->
418-450  (113045-113077)   100% ->
451-575  (113632-113756)   100% ->
576-684  (113966-114074)   100% ->
685-852  (131200-131367)   100% ->
853-1086  (131923-132156)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     14 AGGGTCACTCATCTAAGAAAGATAACTTGGCAGTCAATGCAGTTGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGGGTCACTCATCTAAGAAAGATAACTTGGCAGTCAATGCAGTTGCTTTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     64 CAAGATCACATTTTACATGATCTTCAACTTCGAAATCTTTCAGTTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGATCACATTTTACATGATCTTCAACTTCGAAATCTTTCAGTTGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    114 TCATTCTAAGACACAAGTACAAAAGAAAGAGAACAAATCTCTAAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATTCTAAGACACAAGTACAAAAGAAAGAGAACAAATCTCTAAAAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    164 ATACAAAGGCAATAATAGATACTGGACTTAAAAAAACTACACAGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATACAAAGGCAATAATAGATACTGGACTTAAAAAAACTACACAGTGCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    214 AAACTAGAAGACTCAGAAAAAGAATATGTTCTTGATCCCAAACCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAACTAGAAGACTCAGAAAAAGAATATGTTCTTGATCCCAAACCGCCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    264 GTTGACTTTGG         CACAGAAGTTGGGCCTCATTGGGCCTCCAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTGACTTTGGGTA...TAGCACAGAAGTTGGGCCTCATTGGGCCTCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    305 CACCTCCACTGTCATCAGATGAATGGGAGAAGGTGAAACAGCGCTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110110 CACCTCCACTGTCATCAGATGAATGGGAGAAGGTGAAACAGCGCTCTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    355 CTGCAAGGGGACTCCGTGCAACCATGCCCCATCTGTAAAGAAGAATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110160 CTGCAAGGGGACTCCGTGCAACCATGCCCCATCTGTAAAGAAGAATTCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    405 GCTTCGTCCTCAG         GTGCTGCTTTCATGCTCCCATGTGTTCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110210 GCTTCGTCCTCAGGTG...CAGGTGCTGCTTTCATGCTCCCATGTGTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    446 ACAAA         GCATGTCTTCAGGCTTTTGAAAAGTTCACAAATAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113073 ACAAAGTA...CAGGCATGTCTTCAGGCTTTTGAAAAGTTCACAAATAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    487 AAAACCTGTCCTCTCTGTAGAAAGAACCAGTATCAAACCCGAGTGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113668 AAAACCTGTCCTCTCTGTAGAAAGAACCAGTATCAAACCCGAGTGATACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    537 CGATGGGGCCCGCCTGTTCAGAATCAAGTGTGTGACCAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 113718 CGATGGGGCCCGCCTGTTCAGAATCAAGTGTGTGACCAGGTG...TAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    578 TCCAAGCCTACTGGAGAGGATGTGTTGTTAGAAAGTGGTACAGAAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113968 TCCAAGCCTACTGGAGAGGATGTGTTGTTAGAAAGTGGTACAGAAACCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    628 AGGAAAACAGTACCTCCCACAGATGCCAAGTTAAGAAAAAAATTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114018 AGGAAAACAGTACCTCCCACAGATGCCAAGTTAAGAAAAAAATTCTTTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    678 AAAAAAG         TTCACAGAAATCAGCCACCGCATCCTGTGCTCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114068 AAAAAAGGTA...CAGTTCACAGAAATCAGCCACCGCATCCTGTGCTCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    719 ACAACACCAACATTGAAGAGCTCTTTGCAGAAATCGATCAGTGCTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131234 ACAACACCAACATTGAAGAGCTCTTTGCAGAAATCGATCAGTGCTTGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    769 ATAAATCGAAGTGTTCTTCAGCAGTTGGAAGAAAAATGTGGCCATGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131284 ATAAATCGAAGTGTTCTTCAGCAGTTGGAAGAAAAATGTGGCCATGAGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    819 CACAGAAGAGGAATGGGAGAAAATCCAAGTGCAG         GCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 131334 CACAGAAGAGGAATGGGAGAAAATCCAAGTGCAGGTA...CAGGCTCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    860 GCCGGGAGACCCACGAGTGCTCCATCTGCCTGGCCCCTCTCTCCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131930 GCCGGGAGACCCACGAGTGCTCCATCTGCCTGGCCCCTCTCTCCGCTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    910 GGCGGTCAGCGCGTGGGTGCAGGCAGGCGTTCCAGAGAGATGGCCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131980 GGCGGTCAGCGCGTGGGTGCAGGCAGGCGTTCCAGAGAGATGGCCCTCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    960 GTCCTGCTCACATGTGTTCCACCATGCGTGTCTGCTGGCACTAGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132030 GTCCTGCTCACATGTGTTCCACCATGCGTGTCTGCTGGCACTAGAGGAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1010 TCTCCGTGGGAGACAGGCCTCCTTTCCATGCCTGTCCTCTCTGCCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132080 TCTCCGTGGGAGACAGGCCTCCTTTCCATGCCTGTCCTCTCTGCCGCTCC

   1100     .    :    .    :    .
   1060 TGCTACCAGAAGAAGATTCTTGAATGT
        |||||||||||||||||||||||||||
 132130 TGCTACCAGAAGAAGATTCTTGAATGT