seq1 = pF1KB8663.tfa, 1674 bp
seq2 = pF1KB8663/gi568815581f_30018080.tfa (gi568815581f:30018080_30285671), 267592 bp

>pF1KB8663 1674
>gi568815581f:30018080_30285671 (Chr17)

1-20  (98765-98784)   100% ->
21-114  (100001-100094)   100% ->
115-171  (154463-154519)   100% ->
172-300  (159992-160120)   100% ->
301-508  (161011-161218)   100% ->
509-617  (162829-162937)   100% ->
618-1674  (166536-167592)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGATTCCGGGCAGGCA         GTATGGGCTTATTTTGCCAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  98765 ATGGCGATTCCGGGCAGGCAGTG...CAGGTATGGGCTTATTTTGCCAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAAAACACAGCAGTTGCACCCTGTTTTGCAAAAACCATCAGTGTTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100022 GAAAACACAGCAGTTGCACCCTGTTTTGCAAAAACCATCAGTGTTTGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGATTCTGATGATGATGATGAG         ACCTCTGTGAGTGAAAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100072 ATGATTCTGATGATGATGATGAGGTA...CAGACCTCTGTGAGTGAAAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTTCAGAGGGAAGCTGCTAAGAAGCAGGCCATGAAACAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 154481 CTTCAGAGGGAAGCTGCTAAGAAGCAGGCCATGAAACAGGTA...AAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CAAACTGGAAATCCAGAAGGCCCTTGCAGAAGATGCTACTGTGTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159994 CAAACTGGAAATCCAGAAGGCCCTTGCAGAAGATGCTACTGTGTATGAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATGACAGTATTTATGATGAAATGCAGAAAAAAAAGGAGGAAAATAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160044 ATGACAGTATTTATGATGAAATGCAGAAAAAAAAGGAGGAAAATAATCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAATTGCTTTTGGGGAAAGACAGAAAG         CCCAAGTATATTCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 160094 AAATTGCTTTTGGGGAAAGACAGAAAGGTT...TAGCCCAAGTATATTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CAACTTGCTAAAAGCAGTTGAGATCAGAAAAAAGGAACAGGAAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161025 CAACTTGCTAAAAGCAGTTGAGATCAGAAAAAAGGAACAGGAAAAAAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGGAAAAGAAAATACAGAGAGAACGAGAAATGGAAAAGGGGGAGTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161075 TGGAAAAGAAAATACAGAGAGAACGAGAAATGGAAAAGGGGGAGTTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GATAAAGAAGCATTTGTGACATCTGCATATAAGAAAAAACTGCAAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161125 GATAAAGAAGCATTTGTGACATCTGCATATAAGAAAAAACTGCAAGAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGCTGAAGAAGAAGAAAGAGAAAAGAGGGCTGCTGCACTGGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 161175 AGCTGAAGAAGAAGAAAGAGAAAAGAGGGCTGCTGCACTGGAAGGTA...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    509    CATGTTTGGATGTAACCAAGCAGAAAGATCTCAGTGGATTTTATAGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162826 TAGCATGTTTGGATGTAACCAAGCAGAAAGATCTCAGTGGATTTTATAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACCTATTAAATCAAGCAGTTGGTGAAGAGGAAGTACCTAAATGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162876 CACCTATTAAATCAAGCAGTTGGTGAAGAGGAAGTACCTAAATGCAGCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCGTGAAGCCAG         ATCTGGTATAAAGGAAGAAAAATCAAGGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 162926 TCGTGAAGCCAGGTG...AAGATCTGGTATAAAGGAAGAAAAATCAAGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCTTCTCCAATGAAGTAAGTTCAAAAAACAGAATACCACAAGAGAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166565 GCTTCTCCAATGAAGTAAGTTCAAAAAACAGAATACCACAAGAGAAATGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTCTTCAAACTGATGTGAAAGTAGAGGAAAACCCAGATGCAGACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166615 ATTCTTCAAACTGATGTGAAAGTAGAGGAAAACCCAGATGCAGACAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTTCGATGCTAAGAGCAGTGCGGATGATGAAATAGAAGAAACTAGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166665 CTTCGATGCTAAGAGCAGTGCGGATGATGAAATAGAAGAAACTAGAGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACTGCAGAAGGGAAAAGGTCATAGAGACCCCTGAGAATGACTTCAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166715 ACTGCAGAAGGGAAAAGGTCATAGAGACCCCTGAGAATGACTTCAAGCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CACAGGAGTCAAAACCACTCTCGGTCACCTAGTGAAGAAAGAGGGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166765 CACAGGAGTCAAAACCACTCTCGGTCACCTAGTGAAGAAAGAGGGCACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TACCAGGCACCACACGAAAGGATCACGAACGTCGAGAGGACATGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166815 TACCAGGCACCACACGAAAGGATCACGAACGTCGAGAGGACATGAGAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GGGAAGATCAGCACCAGCAGAAGCAATCCAGAGACCAAGAGAACCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166865 GGGAAGATCAGCACCAGCAGAAGCAATCCAGAGACCAAGAGAACCATTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ACTGACCGTGATTACCGGAAAGAAAGGGATTCTCATAGGCACAGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166915 ACTGACCGTGATTACCGGAAAGAAAGGGATTCTCATAGGCACAGAGAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAGTCATAGAGATTCCCATTGGAAGAGGCATGAACAGGAAGATAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166965 CAGTCATAGAGATTCCCATTGGAAGAGGCATGAACAGGAAGATAAACCAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GGGCGAGGGACCAAAGAGAAAGAAGTGACAGAGTATGGAAAAGGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167015 GGGCGAGGGACCAAAGAGAAAGAAGTGACAGAGTATGGAAAAGGGAGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GATAGGGAGAAATATTCCCAAAGAGAACAAGAAAGAGATAGACAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167065 GATAGGGAGAAATATTCCCAAAGAGAACAAGAAAGAGATAGACAACAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGATCAGAACCGACCCAGTGAGAAAGGAGAGAAGGAAGAGAAAAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167115 TGATCAGAACCGACCCAGTGAGAAAGGAGAGAAGGAAGAGAAAAGCAAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CAAAGGAAGAGCATATGAAAGTAAGGAAGGAAAGATATGAAAATAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167165 CAAAGGAAGAGCATATGAAAGTAAGGAAGGAAAGATATGAAAATAATGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AAATACAGAGATAGAGAAAAACGAGAGGTAGGTGTTCAGTCTTCAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167215 AAATACAGAGATAGAGAAAAACGAGAGGTAGGTGTTCAGTCTTCAGAAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 AAATCAAGACAGAAAGGAAAGCAGCCCAAATTCTAGGGCAAAGGATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167265 AAATCAAGACAGAAAGGAAAGCAGCCCAAATTCTAGGGCAAAGGATAAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TTCTTGACCAAGAAAGATCCAACAAAATGAGAAACATGGCAAAGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167315 TTCTTGACCAAGAAAGATCCAACAAAATGAGAAACATGGCAAAGGACAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GAAAGAAACCAAGAGAAACCCTCTAATTCTGAATCATCACTGGGAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167365 GAAAGAAACCAAGAGAAACCCTCTAATTCTGAATCATCACTGGGAGCAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 ACACAGACTCACAGAGGAAGGGCAAGAGAAGGGTAAAGAACAAGAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167415 ACACAGACTCACAGAGGAAGGGCAAGAGAAGGGTAAAGAACAAGAGAGAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CACCTGAGGCAGTGAGCAAGTTTGCAAAGCGGAACAATGAAGAAACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167465 CACCTGAGGCAGTGAGCAAGTTTGCAAAGCGGAACAATGAAGAAACTGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 ATGTCAGCTAGAGACAGGTACTTGGCCAGGCAGATGGCGCGGGTTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167515 ATGTCAGCTAGAGACAGGTACTTGGCCAGGCAGATGGCGCGGGTTAATGC

   1700     .    :    .    :    .
   1647 AAAGACCTATATTGAGAAAGAAGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 167565 AAAGACCTATATTGAGAAAGAAGATGAT