seq1 = pF1KB8651.tfa, 1458 bp
seq2 = pF1KB8651/gi568815576r_42771360.tfa (gi568815576r:42771360_43012080), 240721 bp

>pF1KB8651 1458
>gi568815576r:42771360_43012080 (Chr22)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-217  (118468-118624)   100% ->
218-453  (120899-121134)   100% ->
454-609  (123283-123438)   100% ->
610-785  (127520-127695)   100% ->
786-906  (129777-129897)   100% ->
907-1028  (132912-133033)   100% ->
1029-1151  (135071-135193)   100% ->
1152-1348  (135748-135944)   100% ->
1349-1458  (140612-140721)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTCACATATGATGATTCCGTTGGAGTAGAAGTGTCCAGCGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCTGGGAG         GTCGGGAACTACAAGCGGACTGTGAAGCGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCTGGGAGGTA...TAGGTCGGGAACTACAAGCGGACTGTGAAGCGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118499 TCGACGATGGCCACCGCCTGTGCAGCGACCTCATGAACTGCCTGCATGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGCGCGCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118549 CGGGCGCGCATCGAGAAGGCGTATGCGCAGCAGCTCACTGAGTGGGCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAG         GGCCCCAGTACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 118599 GCGCTGGAGGCAGCTCGTGGAGAAAGGTA...CAGGGCCCCAGTACGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120914 CCGTGGAGAAGGCCTGGATGGCCTTCATGTCCGAGGCAGAGAGGGTGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCTGCACCTCGAGGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120964 GAGCTGCACCTCGAGGTGAAGGCCTCACTGATGAACGATGACTTCGAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGATGATGGGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121014 GATCAAGAACTGGCAGAAGGAAGCCTTTCACAAGCAGATGATGGGCGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121064 TCAAGGAGACCAAGGAAGCTGAGGACGGCTTTCGGAAGGCACAGAAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGGGCCAAGAAGCTGAAAGAG         GTAGAAGCAGCAAAGAAAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 121114 TGGGCCAAGAAGCTGAAAGAGGTA...TAGGTAGAAGCAGCAAAGAAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123303 CCACCATGCAGCGTGCAAAGAGGAGAAGCTGGCTATCTCACGAGAAGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123353 ACAGCAAGGCAGACCCATCCCTCAACCCTGAACAGCTCAAGAAATTGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACAAAATAGAAAAGTGCAAGCAAGATGTTCTTAAG         ACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123403 GACAAAATAGAAAAGTGCAAGCAAGATGTTCTTAAGGTA...TAGACCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127525 AGAGAAGTATGAGAAGTCCCTGAAGGAACTCGACCAGGGCACACCCCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127575 ACATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTCGAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGTTCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127625 AAACGCCTTCGCTTCTTCCGGGAGGTTCTGCTGGAGGTTCAGAAGCACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGACCTGTCCAATGTGGCTGG         CTACAAAGCCATTTACCATG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 127675 AGACCTGTCCAATGTGGCTGGGTA...TAGCTACAAAGCCATTTACCATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACCTGGAGCAGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129797 ACCTGGAGCAGAGCATCAGAGCAGCTGATGCAGTGGAGGACCTGAGGTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATGAACTGGCCGCAGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129847 TTCCGAGCCAATCACGGGCCGGGCATGGCCATGAACTGGCCGCAGTTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 G         GAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129897 GGTA...TAGGAGTGGTCCGCAGACCTGAATCGAACCCTCAGCCGGAGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGAAGAAGAAGGCCACTGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132952 AGAAGAAGAAGGCCACTGACGGCGTCACCCTGACGGGCATCAACCAGACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAG         CACCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 133002 GGCGACCAGTCTCTGCCGAGTAAGCCCAGCAGGTG...TAGCACCCTTAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135080 TGTCCCGAGCAACCCCGCCCAGTCTGCGCAGTCACAGTCCAGCTACAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCTTCGAGGATGAGGACGACACGGGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135130 CCTTCGAGGATGAGGACGACACGGGCAGCACCGTCAGTGAGAAGGACGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACTAAGGCCAAAAA         TGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 135180 ACTAAGGCCAAAAAGTT...CAGTGTGAGCAGCTACGAGAAGACCCAGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTATCCCACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135775 CTATCCCACCGACTGGTCAGACGATGAGTCTAACAACCCCTTCTCCTCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CGGATGCCAATGGGGACTCGAATCCATTCGACGACGACGCCACCTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135825 CGGATGCCAATGGGGACTCGAATCCATTCGACGACGACGCCACCTCGGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135875 ACGGAAGTGCGAGTCCGGGCCCTGTATGACTATGAGGGGCAGGAGCATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGAGCTGAGCTTCAAGGCTG         GGGATGAGCTGACCAAGATGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 135925 TGAGCTGAGCTTCAAGGCTGGTA...CAGGGGATGAGCTGACCAAGATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGGACGCTTGGACAACGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140633 AGGACGAGGATGAGCAGGGCTGGTGCAAGGGACGCTTGGACAACGGGCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .
   1420 GTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140683 GTTGGCCTATACCCGGCAAATTATGTGGAGGCGATCCAG