seq1 = pF1KB8646.tfa, 717 bp
seq2 = pF1KB8646/gi568815576r_44396840.tfa (gi568815576r:44396840_44597556), 200717 bp

>pF1KB8646 717
>gi568815576r:44396840_44597556 (Chr22)

(complement)

1-717  (100001-100717)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCAGCCGCAGACGTCCAAAGCTGAAAGCCCAGCCTTGGCAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCAGCCGCAGACGTCCAAAGCTGAAAGCCCAGCCTTGGCAGCGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCGAATGCCCAGATGGATGACGTTATTGACACCCTGACCTCCCTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCGAATGCCCAGATGGATGACGTTATTGACACCCTGACCTCCCTGCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCAACTCGGCGCTGAGGCGGGAGGCTTCCACCCTGCGGGCGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACCAACTCGGCGCTGAGGCGGGAGGCTTCCACCCTGCGGGCGGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAATCTCACCAACATGCTGGAGAGCGTGATGGCAGAGCTGACCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAATCTCACCAACATGCTGGAGAGCGTGATGGCAGAGCTGACCTTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGCACCAGGGCGCGGATCCCGGGGGCTCTGCAGATCACCCCGCCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGCACCAGGGCGCGGATCCCGGGGGCTCTGCAGATCACCCCGCCCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTCAATTACTTCAAACGGGACTCGACCCATGACCACACCTCCAACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTCAATTACTTCAAACGGGACTCGACCCATGACCACACCTCCAACCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCCGAGCCCTTTTCCGGGGACCCAGGCCGGTTGGCGGGGTTCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCCCGAGCCCTTTTCCGGGGACCCAGGCCGGTTGGCGGGGTTCCTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGATGGACAGATTCATGATCTTCCAGGCCTCCCGCTTCCCGGGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGATGGACAGATTCATGATCTTCCAGGCCTCCCGCTTCCCGGGTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGAGCGTGTGGCCTTCCTTGTGTCTCGACTGACTGGGGAGGCGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGAGCGTGTGGCCTTCCTTGTGTCTCGACTGACTGGGGAGGCGGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGGGCTATCCCCCACATGCAACCTGACAGCCCCTTGCGCAACAACTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGGGCTATCCCCCACATGCAACCTGACAGCCCCTTGCGCAACAACTATCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGGTTCCTGGCAGAGTTGCGGAGAACCTACAAGTCTCCGCTCCGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGGTTCCTGGCAGAGTTGCGGAGAACCTACAAGTCTCCGCTCCGGCATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGCGGCGCGCCCAAATCAGGAAGACTTCTGCCTCTAATAGGGCTGTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGCGGCGCGCCCAAATCAGGAAGACTTCTGCCTCTAATAGGGCTGTGCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGAGGCAGATGCTCTGCCGCCAGCTGGCCTCTGCGGGCACGGGGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGAGGCAGATGCTCTGCCGCCAGCTGGCCTCTGCGGGCACGGGGCCTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCCAGTGCATCCAGCTTCCAACGGGACTAGTCCAGCGCCAGCCCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCAGTGCATCCAGCTTCCAACGGGACTAGTCCAGCGCCAGCCCTGCCTG

    700     .    :    .
    701 CCCGAGCACGGAATCTT
        |||||||||||||||||
 100701 CCCGAGCACGGAATCTT