seq1 = pF1KB8645.tfa, 798 bp
seq2 = pF1KB8645/gi568815576f_35446810.tfa (gi568815576f:35446810_35652029), 205220 bp

>pF1KB8645 798
>gi568815576f:35446810_35652029 (Chr22)

1-271  (100001-100271)   100% ->
272-798  (104694-105220)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAAGACTTTGTCCAGCGGGAACTGCACGCTCAGTGTGCCCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAAGACTTTGTCCAGCGGGAACTGCACGCTCAGTGTGCCCGCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACTCATACCGCATGGTGGTGCTGGGTGCCTCTCGGGTGGGCAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAACTCATACCGCATGGTGGTGCTGGGTGCCTCTCGGGTGGGCAAGAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATCGTGTCTCGCTTCCTCAATGGCCGCTTTGAGGACCAGTACACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATCGTGTCTCGCTTCCTCAATGGCCGCTTTGAGGACCAGTACACACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCATCGAGGACTTCCACCGTAAGGTATACAACATCCGCGGCGACATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCATCGAGGACTTCCACCGTAAGGTATACAACATCCGCGGCGACATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGCTCGACATCCTGGATACCTCTGGCAACCACCCCTTCCCCGCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGCTCGACATCCTGGATACCTCTGGCAACCACCCCTTCCCCGCCATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGGCTGTCCATCCTCACAG         GGGATGTCTTCATCCTGGTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100251 GCAGGCTGTCCATCCTCACAGGTG...CAGGGGATGTCTTCATCCTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCAGCCTGGATAACCGGGAGTCCTTCGATGAGGTCAAGCGCCTTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104714 TTCAGCCTGGATAACCGGGAGTCCTTCGATGAGGTCAAGCGCCTTCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCAGATCCTGGAGGTCAAGTCCTGCCTGAAGAACAAGACCAAGGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104764 GCAGATCCTGGAGGTCAAGTCCTGCCTGAAGAACAAGACCAAGGAGGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGGAGCTGCCCATGGTCATCTGTGGCAACAAGAACGACCACGGCGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104814 CGGAGCTGCCCATGGTCATCTGTGGCAACAAGAACGACCACGGCGAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCCGCCAGGTGCCCACCACCGAGGCCGAGCTGCTGGTGTCGGGCGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104864 TGCCGCCAGGTGCCCACCACCGAGGCCGAGCTGCTGGTGTCGGGCGACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAACTGCGCCTACTTCGAGGTGTCGGCCAAGAAGAACACCAACGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104914 GAACTGCGCCTACTTCGAGGTGTCGGCCAAGAAGAACACCAACGTGGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGATGTTCTACGTGCTCTTCAGCATGGCCAAGCTGCCACACGAGATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104964 AGATGTTCTACGTGCTCTTCAGCATGGCCAAGCTGCCACACGAGATGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCCGCCCTGCATCGCAAGATCTCCGTGCAGTACGGTGACGCCTTCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105014 CCCGCCCTGCATCGCAAGATCTCCGTGCAGTACGGTGACGCCTTCCACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAGGCCCTTCTGCATGCGCCGCGTCAAGGAGATGGACGCCTATGGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105064 CAGGCCCTTCTGCATGCGCCGCGTCAAGGAGATGGACGCCTATGGCATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCTCGCCCTTCGCCCGCCGCCCCAGCGTCAACAGTGACCTCAAGTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105114 TCTCGCCCTTCGCCCGCCGCCCCAGCGTCAACAGTGACCTCAAGTACATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAGGCCAAGGTCCTTCGGGAAGGCCAGGCCCGTGAGAGGGACAAGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105164 AAGGCCAAGGTCCTTCGGGAAGGCCAGGCCCGTGAGAGGGACAAGTGCAC

    800     .
    792 CATCCAG
        |||||||
 105214 CATCCAG