seq1 = pF1KB8642.tfa, 3273 bp
seq2 = pF1KB8642/gi568815596r_17565502.tfa (gi568815596r:17565502_17845946), 280445 bp

>pF1KB8642 3273
>gi568815596r:17565502_17845946 (Chr2)

(complement)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-238  (104218-104335)   100% ->
239-344  (107621-107726)   100% ->
345-481  (114070-114206)   100% ->
482-543  (114808-114869)   100% ->
544-624  (119478-119558)   100% ->
625-726  (120589-120690)   100% ->
727-846  (124686-124805)   100% ->
847-945  (124909-125007)   100% ->
946-1092  (127724-127870)   100% ->
1093-1181  (128771-128859)   100% ->
1182-1346  (129042-129206)   100% ->
1347-1525  (129683-129861)   100% ->
1526-1730  (130882-131086)   100% ->
1731-1845  (137194-137308)   100% ->
1846-2006  (138568-138728)   100% ->
2007-2142  (142655-142790)   100% ->
2143-2223  (144038-144118)   100% ->
2224-2394  (145569-145739)   100% ->
2395-2532  (149521-149658)   100% ->
2533-2678  (150650-150795)   100% ->
2679-2804  (162184-162309)   100% ->
2805-2910  (166983-167088)   100% ->
2911-3063  (175372-175524)   100% ->
3064-3161  (179430-179527)   100% ->
3162-3273  (180334-180445)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAAAGAAAGGAAGAAAATTTTTCCTCTCCTAAAAATGCCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAAAAGAAAGGAAGAAAATTTTTCCTCTCCTAAAAATGCCAAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCAAGACAAGAAGAATTGGAGGATTTTGATAAAGATGGTGACGAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCAAGACAAGAAGAATTGGAGGATTTTGATAAAGATGGTGACGAAGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATGTAAAGGTACTACTTTG         ACTGCAGCAGAAGTTGGAATA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 AATGTAAAGGTACTACTTTGGTA...TAGACTGCAGCAGAAGTTGGAATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTGAGAGTATTCACCTAAAAAACTTCATGTGTCATTCAATGCTTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104239 ATTGAGAGTATTCACCTAAAAAACTTCATGTGTCATTCAATGCTTGGACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTTAAGTTTGGTTCTAATGTCAACTTTGTTGTTGGCAACAATGGAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 104289 TTTTAAGTTTGGTTCTAATGTCAACTTTGTTGTTGGCAACAATGGAAGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    239       GTGGGAAGAGTGCAGTACTCACAGCTCTCATAGTCGGTCTTGGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104339 ...TAGGTGGGAAGAGTGCAGTACTCACAGCTCTCATAGTCGGTCTTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAAGAGCAGTTGCTACTAATAGAGGATCCTCTTTAAAAGGTTTTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107665 GGAAGAGCAGTTGCTACTAATAGAGGATCCTCTTTAAAAGGTTTTGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGATGGACAGAA         CTCTGCAGATATCTCAATAACATTGAGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107715 AGATGGACAGAAGTA...CAGCTCTGCAGATATCTCAATAACATTGAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAGAGGAGATGATGCCTTTAAAGCCAGTGTGTATGGTAACTCTATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114099 ACAGAGGAGATGATGCCTTTAAAGCCAGTGTGTATGGTAACTCTATACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATACAGCAACACATCAGCATAGATGGAAGTCGATCTTATAAACTTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114149 ATACAGCAACACATCAGCATAGATGGAAGTCGATCTTATAAACTTAAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCAACAG         GCTCCGTGGTTTCCACGAGGAAAGAAGAGCTGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 114199 TGCAACAGGTT...TAGGCTCCGTGGTTTCCACGAGGAAAGAAGAGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGCAATTCTTGATCATTTTAACATCCAG         GTGGATAATCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114841 TTGCAATTCTTGATCATTTTAACATCCAGGTA...GAGGTGGATAATCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTTTCTGTTTTAACACAAGAAATGAGCAAGCAGTTCTTACAGTCTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119490 GTTTCTGTTTTAACACAAGAAATGAGCAAGCAGTTCTTACAGTCTAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAAGGAGACAAATACAAA         TTCTTCATGAAAGCAACGCAAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 119540 TGAAGGAGACAAATACAAAGTA...TAGTTCTTCATGAAAGCAACGCAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTGAACAGATGAAGGAAGATTATTCATACATTATGGAAACGAAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120611 TTGAACAGATGAAGGAAGATTATTCATACATTATGGAAACGAAAGAAAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACAAAGGAGCAGATACATCAAGGAGAAGAG         CGGCTTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120661 ACAAAGGAGCAGATACATCAAGGAGAAGAGGTT...AAGCGGCTTACTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ACTAAAGCGCCAGTGTGTAGAGAAAGAGGAACGTTTTCAAAGTATTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124697 ACTAAAGCGCCAGTGTGTAGAGAAAGAGGAACGTTTTCAAAGTATTGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GTTTAAGTACAATGAAGACTAATTTAGAGTCCTTGAAACATGAAATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124747 GTTTAAGTACAATGAAGACTAATTTAGAGTCCTTGAAACATGAAATGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TGGGCAGTG         GTCAATGAAATTGAAAAACAATTGAATGCCAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 124797 TGGGCAGTGGTA...TAGGTCAATGAAATTGAAAAACAATTGAATGCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAGAGATAATATCAAAATTGGAGAAGATCGTGCTGCTAGACTTGACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124941 CAGAGATAATATCAAAATTGGAGAAGATCGTGCTGCTAGACTTGACAGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AAATGGAAGAACAGCAG         GTCAGACTTAATGAGGCAGAACAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 124991 AAATGGAAGAACAGCAGGTA...AAGGTCAGACTTAATGAGGCAGAACAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAGTACAAGGATATTCAAGACAAACTAGAAAAGATTAGTGAAGAGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127748 AAGTACAAGGATATTCAAGACAAACTAGAAAAGATTAGTGAAGAGACAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGCACGAGCACCAGAATGTATGGCATTGAAAGCAGATGTTGTTGCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127798 TGCACGAGCACCAGAATGTATGGCATTGAAAGCAGATGTTGTTGCTAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AAAGGGCCTATAATGAAGCTGAG         GTTTTATATAACCGATCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 127848 AAAGGGCCTATAATGAAGCTGAGGTG...TAGGTTTTATATAACCGATCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TTAAACGAATATAAAGCATTAAAGAAAGATGATGAGCAGCTTTGTAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128789 TTAAACGAATATAAAGCATTAAAGAAAGATGATGAGCAGCTTTGTAAACG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AATTGAAGAGCTGAAAAAAAG         TACTGACCAATCTTTGGAAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128839 AATTGAAGAGCTGAAAAAAAGGTA...TAGTACTGACCAATCTTTGGAAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CTGAACGGTTGGAAAGACAAAAAAAAATATCTTGGTTAAAAGAGAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129062 CTGAACGGTTGGAAAGACAAAAAAAAATATCTTGGTTAAAAGAGAGAGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AAGGCCTTTCAAAATCAAGAAAATTCAGTCAATCAAGAGATCGAACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129112 AAGGCCTTTCAAAATCAAGAAAATTCAGTCAATCAAGAGATCGAACAGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TCAGCAAGCCATAGAAAAGGACAAAGAAGAACATGGCAAAATTAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 129162 TCAGCAAGCCATAGAAAAGGACAAAGAAGAACATGGCAAAATTAAGTA..

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347     GAGAGAAGAATTAGATGTGAAGCATGCACTGAGCTACAATCAGAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129212 .TAGGAGAGAAGAATTAGATGTGAAGCATGCACTGAGCTACAATCAGAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CAACTGAAAGAATTGAAAGATAGTAAAACTGATCGACTCAAAAGATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129729 CAACTGAAAGAATTGAAAGATAGTAAAACTGATCGACTCAAAAGATTTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CCCTAATGTTCCAGCTCTTCTTGAAGCCATAGATGATGCTTATAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129779 CCCTAATGTTCCAGCTCTTCTTGAAGCCATAGATGATGCTTATAGACAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GACATTTTACCTATAAACCTGTAGGCCCTTTAG         GAGCTTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129829 GACATTTTACCTATAAACCTGTAGGCCCTTTAGGTA...TAGGAGCTTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ATTCATCTTCGGGACCCAGAACTTGCTTTGGCTATTGAATCTTGCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130890 ATTCATCTTCGGGACCCAGAACTTGCTTTGGCTATTGAATCTTGCTTAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 AGGGCTTCTGCAGGCCTATTGTTGCCATAATCATGCTGATGAAAGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130940 AGGGCTTCTGCAGGCCTATTGTTGCCATAATCATGCTGATGAAAGGGTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TTCAGGCACTCATGAAAAGGTTTTATTTACCAGGGACCTCACGGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130990 TTCAGGCACTCATGAAAAGGTTTTATTTACCAGGGACCTCACGGCCACCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ATAATAGTTTCTGAGTTTCGGAATGAGATATATGATGTAAGACACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 131040 ATAATAGTTTCTGAGTTTCGGAATGAGATATATGATGTAAGACACAGGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1731       AGCTGCTTATCATCCAGACTTTCCAACAGTTCTGACAGCTTTAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131090 ...TAGAGCTGCTTATCATCCAGACTTTCCAACAGTTCTGACAGCTTTAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AAATAGATAATGCGGTTGTGGCAAATAGCCTAATTGACATGAGAGGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137238 AAATAGATAATGCGGTTGTGGCAAATAGCCTAATTGACATGAGAGGCATA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GAGACAGTGCTACTAATCAAA         AATAATTCTGTAGCTCGTGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 137288 GAGACAGTGCTACTAATCAAAGTA...TAGAATAATTCTGTAGCTCGTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 AGTAATGCAGTCCCAAAAGCCACCCAAAAATTGTAGAGAAGCTTTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138588 AGTAATGCAGTCCCAAAAGCCACCCAAAAATTGTAGAGAAGCTTTTACTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CTGATGGTGATCAAGTTTTTGCAGGACGTTATTATTCATCTGAAAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138638 CTGATGGTGATCAAGTTTTTGCAGGACGTTATTATTCATCTGAAAATACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AGACCTAAGTTCCTAAGCAGAGATGTGGATTCTGAAATAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 138688 AGACCTAAGTTCCTAAGCAGAGATGTGGATTCTGAAATAAGGTT...AAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TGACTTGGAGAATGAGGTTGAAAATAAGACGGCCCAGATATTAAATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142655 TGACTTGGAGAATGAGGTTGAAAATAAGACGGCCCAGATATTAAATCTTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 AGCAACATTTATCTGCCCTTGAAAAAGATATTAAACACAATGAGGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142705 AGCAACATTTATCTGCCCTTGAAAAAGATATTAAACACAATGAGGAACTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CTTAAAAGGTGCCAACTACATTATAAAGAACTAAAG         ATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 142755 CTTAAAAGGTGCCAACTACATTATAAAGAACTAAAGGTA...TAGATGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AATAAGAAAAAATATTTCTGAAATTCGGGAACTTGAGAACATAGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144043 AATAAGAAAAAATATTTCTGAAATTCGGGAACTTGAGAACATAGAAGAAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 ACCAGTCTGTAGATATTGCAACTTTG         GAAGATGAAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 144093 ACCAGTCTGTAGATATTGCAACTTTGGTA...CAGGAAGATGAAGCTCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GAAAATAAAAGCAAAATGAAAATGGTTGAGGAACATATGGAGCAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145584 GAAAATAAAAGCAAAATGAAAATGGTTGAGGAACATATGGAGCAACAAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 AGAAAATATGGAGCATCTTAAAAGTCTGAAAATAGAAGCAGAAAATAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145634 AGAAAATATGGAGCATCTTAAAAGTCTGAAAATAGAAGCAGAAAATAAGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 ATGATGCAATTAAATTCAAAATTAATCAACTATCGGAGCTAGCAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145684 ATGATGCAATTAAATTCAAAATTAATCAACTATCGGAGCTAGCAGACCCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 CTTAAG         GATGAATTAAACCTTGCTGATTCTGAAGTGGATAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145734 CTTAAGGTA...CAGGATGAATTAAACCTTGCTGATTCTGAAGTGGATAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 CCAAAAACGAGGGAAACGACATTATGAAGAAAAACAAAAAGAACACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149556 CCAAAAACGAGGGAAACGACATTATGAAGAAAAACAAAAAGAACACTTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 ATACCTTAAATAAAAAGAAACGAGAACTGGATATGAAAGAGAAAGAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149606 ATACCTTAAATAAAAAGAAACGAGAACTGGATATGAAAGAGAAAGAACTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GAG         GAGAAAATGTCACAAGCAAGACAAATCTGCCCAGAGCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149656 GAGGTT...TAGGAGAAAATGTCACAAGCAAGACAAATCTGCCCAGAGCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 TATAGAAGTAGAAAAATCTGCATCAATTCTGGACAAAGAAATTAATCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150688 TATAGAAGTAGAAAAATCTGCATCAATTCTGGACAAAGAAATTAATCGAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 TAAGGCAGAAGATACAGGCAGAACATGCTAGTCATGGAGATCGAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150738 TAAGGCAGAAGATACAGGCAGAACATGCTAGTCATGGAGATCGAGAGGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 ATAATGAG         GCAGTACCAAGAAGCAAGAGAGACCTATCTTGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 150788 ATAATGAGGTA...TAGGCAGTACCAAGAAGCAAGAGAGACCTATCTTGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 TCTGGATAGTAAAGTGAGGACTTTAAAAAAGTTTATTAAATTACTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162217 TCTGGATAGTAAAGTGAGGACTTTAAAAAAGTTTATTAAATTACTGGGAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 AAATCATGGAGCACAGATTCAAGACATATCAACAATTTAGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 162267 AAATCATGGAGCACAGATTCAAGACATATCAACAATTTAGAAGGTA...A

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2805   GTGTTTGACTTTACGATGCAAATTATACTTTGACAACTTACTATCTCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166981 AGGTGTTTGACTTTACGATGCAAATTATACTTTGACAACTTACTATCTCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 GCGGGCCTATTGTGGAAAAATGAATTTTGACCACAAGAATGAAACTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167031 GCGGGCCTATTGTGGAAAAATGAATTTTGACCACAAGAATGAAACTCTAA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 GTATATCA         GTTCAGCCTGGAGAAGGAAATAAAGCTGCTTTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 167081 GTATATCAGTA...AAGGTTCAGCCTGGAGAAGGAAATAAAGCTGCTTTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2944 AATGACATGAGAGCCTTGTCTGGAGGTGAACGTTCTTTCTCCACAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175405 AATGACATGAGAGCCTTGTCTGGAGGTGAACGTTCTTTCTCCACAGTGTG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 TTTTATTCTTTCCCTGTGGTCCATCGCAGAATCTCCTTTCAGATGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175455 TTTTATTCTTTCCCTGTGGTCCATCGCAGAATCTCCTTTCAGATGCCTGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 ATGAATTTGATGTCTACATG         GATATGGTTAATAGGAGAATT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 175505 ATGAATTTGATGTCTACATGGTA...CAGGATATGGTTAATAGGAGAATT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3085 GCCATGGACTTGATACTGAAGATGGCAGATTCCCAGCGTTTTAGACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179451 GCCATGGACTTGATACTGAAGATGGCAGATTCCCAGCGTTTTAGACAGTT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 TATCTTGCTCACACCTCAAAGCATGAG         TTCACTTCCATCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 179501 TATCTTGCTCACACCTCAAAGCATGAGGTA...TAGTTCACTTCCATCCA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3176 GTAAACTGATAAGAATTCTCCGAATGTCTGATCCTGAAAGAGGACAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180348 GTAAACTGATAAGAATTCTCCGAATGTCTGATCCTGAAAGAGGACAAACT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3226 ACATTGCCTTTCAGACCTGTGACTCAAGAAGAAGATGATGACCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180398 ACATTGCCTTTCAGACCTGTGACTCAAGAAGAAGATGATGACCAAAGG