seq1 = pF1KB8632.tfa, 2514 bp
seq2 = pF1KB8632/gi568815575f_102614870.tfa (gi568815575f:102614870_102817383), 202514 bp

>pF1KB8632 2514
>gi568815575f:102614870_102817383 (ChrX)

1-2514  (100001-102514)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGGGGCAGAGATTGAGCCTAGTGCCCAGGCCAAGCCTGAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGGGGCAGAGATTGAGCCTAGTGCCCAGGCCAAGCCTGAAAAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGGGGAAGAGGTTATCGCTGGGCCTGAGAGAGAGAATGATGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGGGGAAGAGGTTATCGCTGGGCCTGAGAGAGAGAATGATGTCCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGGTCAGACCCAAGGTTAGGACCCAGGCAACTACTGGGGCAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGGTCAGACCCAAGGTTAGGACCCAGGCAACTACTGGGGCAAGGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAACTGAGACCAAGTCTGTGCCTGCGGCAAGGCCCAAAACTGAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAACTGAGACCAAGTCTGTGCCTGCGGCAAGGCCCAAAACTGAGGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCAATGTCTGGGGCAAGGCCCAAAACTGAGGTCCAAGTAATGGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCAATGTCTGGGGCAAGGCCCAAAACTGAGGTCCAAGTAATGGGTGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAAGACCCAAAACGGAGGCTCAAGGAATCACAGGGGCCAGGCCCAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAAGACCCAAAACGGAGGCTCAAGGAATCACAGGGGCCAGGCCCAAAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGCCAGGGCAGTAGGTGGCGCTCGTTCTAAAACTGATGCCAAGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATGCCAGGGCAGTAGGTGGCGCTCGTTCTAAAACTGATGCCAAGGCAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCTGGAGCAAGGCCCAAGGATGAGGCCCAGGCATGGGCCCAGAGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCTGGAGCAAGGCCCAAGGATGAGGCCCAGGCATGGGCCCAGAGTGAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGGGACTGAAGCAGTGTCACAGGCAGAAGGAGTGTCCCAGACTAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGGGACTGAAGCAGTGTCACAGGCAGAAGGAGTGTCCCAGACTAATGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTTGCTTGGCCACTGGCCACTGCTGAGTCTGGATCAGTTACTAAATCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTTGCTTGGCCACTGGCCACTGCTGAGTCTGGATCAGTTACTAAATCTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGCCTGTCTATGGATAGAGAACTAGTCAATGTGGATGCTGAAACCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGCCTGTCTATGGATAGAGAACTAGTCAATGTGGATGCTGAAACCTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGGCACCCAGGGTCAGAAAGGAATCCAGCCCTGGTTTGGACCAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGGCACCCAGGGTCAGAAAGGAATCCAGCCCTGGTTTGGACCAGGGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGACTAATATGGGGTCTTGGTGCTATTCCAGGCCCAGGGCCAGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGACTAATATGGGGTCTTGGTGCTATTCCAGGCCCAGGGCCAGAGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCCTCTAATGAGTCTGGGTTCTGGTCAGCAGATGAGACCTCTACAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCCTCTAATGAGTCTGGGTTCTGGTCAGCAGATGAGACCTCTACAGCGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTTCTTTCTGGACTGGAGAAGAGACAAGTGTCAGATCATGGCCCAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTTCTTTCTGGACTGGAGAAGAGACAAGTGTCAGATCATGGCCCAGGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAGTCCAATACCAGGTCCAGGCACAGGGCTAAACATCAGACTAATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAGTCCAATACCAGGTCCAGGCACAGGGCTAAACATCAGACTAATCCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCCAGGCCCAGATCCAAGCAAGAAGCCTATGTTGATTCCTGGTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCCAGGCCCAGATCCAAGCAAGAAGCCTATGTTGATTCCTGGTCTGGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGAGGATGAGGCCAGCAACCCATTCTCCTTCTGGGTTGGAGAAAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGAGGATGAGGCCAGCAACCCATTCTCCTTCTGGGTTGGAGAAAATACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AATAACTTGTTCAGGCCCAGAGTCAGGGAGGAGGCAAATATCAGGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AATAACTTGTTCAGGCCCAGAGTCAGGGAGGAGGCAAATATCAGGTCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCTCAGGACAAATAGAGAAGATTGTTTTGAATCTGAGTCTGAAGATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCTCAGGACAAATAGAGAAGATTGTTTTGAATCTGAGTCTGAAGATGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTATAAGCAGTCCTGGGTTTTGCCTGGAGAAGAGGCCAATAGTAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTATAAGCAGTCCTGGGTTTTGCCTGGAGAAGAGGCCAATAGTAGATTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGGCACAGAGACAAAGAAGATCCTAATACTGCCTTGAAACTCAGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGGCACAGAGACAAAGAAGATCCTAATACTGCCTTGAAACTCAGGGCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAAAGATGTTGACAGTGATAGGGTCAAACAAGAACCCAGGTTTGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAAAGATGTTGACAGTGATAGGGTCAAACAAGAACCCAGGTTTGAGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAGTCATTATTGGGTCCTGGTTCTGGGCAGAAAAAGAGGCCAGTTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAGTCATTATTGGGTCCTGGTTCTGGGCAGAAAAAGAGGCCAGTTTGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGTGGAGCTTCAGCAATCTGTGAATCTGAGCCAGGAACTGAGGAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGTGGAGCTTCAGCAATCTGTGAATCTGAGCCAGGAACTGAGGAGGGGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CATTGGCGGATCCGCGTACTGGGCTGAGGAAAAGTCCAGTTTGGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CATTGGCGGATCCGCGTACTGGGCTGAGGAAAAGTCCAGTTTGGGGGCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGGCCAGAGAAGAGGCCAAGCCGGAGTCTGAAGAAGAGGCCATATTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TGGCCAGAGAAGAGGCCAAGCCGGAGTCTGAAGAAGAGGCCATATTTGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCCTGGTTCTGGGACAGAGATGAGGCCTGCTTTGACCTAAATCCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCCTGGTTCTGGGACAGAGATGAGGCCTGCTTTGACCTAAATCCCTGTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGTGTACAAGGTCAGTGATAGGTTCAGAGATGCAGCTGAGGAGCTTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGTGTACAAGGTCAGTGATAGGTTCAGAGATGCAGCTGAGGAGCTTAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CATCCTCCAGGCCCCAAACCTGGGACGAGGTCACTGTTGAATTCAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CATCCTCCAGGCCCCAAACCTGGGACGAGGTCACTGTTGAATTCAAACCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GGTCTTTTTCATGGGGTTGGCTTCCGATCCACAAGCCCCTTTGGAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GGTCTTTTTCATGGGGTTGGCTTCCGATCCACAAGCCCCTTTGGAATTCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CGAAGAGGCTTCTGAAATGCTTGAGGCAAAGCCCAAGAACCTGGAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CGAAGAGGCTTCTGAAATGCTTGAGGCAAAGCCCAAGAACCTGGAACTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GCCCAGAAGGAGAAGAGCAGGAATCTTTGCTTCAGCCTGATCAGCCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GCCCAGAAGGAGAAGAGCAGGAATCTTTGCTTCAGCCTGATCAGCCTAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CCTGAGTTCACATTTCAGTATGATCCTTCCTACCGGTCAGTCCGGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CCTGAGTTCACATTTCAGTATGATCCTTCCTACCGGTCAGTCCGGGAAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TCGAGAGCATCTTAGGGCCAGGGAGAGTGCAGAGTCTGAGAGTTGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TCGAGAGCATCTTAGGGCCAGGGAGAGTGCAGAGTCTGAGAGTTGGTCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GCAGCTGCATACAATGTGAGCTGAAAATTGGTTCTGAAGAGTTTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GCAGCTGCATACAATGTGAGCTGAAAATTGGTTCTGAAGAGTTTGAAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TTCCTTTTATTAATGGACAAAATTCGGGATCCTTTTATTCATGAAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TTCCTTTTATTAATGGACAAAATTCGGGATCCTTTTATTCATGAAATATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TAAAATTGCAATGGGTATGAGAAGTGCTTCTCAATTTACCCGAGATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TAAAATTGCAATGGGTATGAGAAGTGCTTCTCAATTTACCCGAGATTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TTCGAGATTCAGGTGTTGTCTCACTTATTGAAACCTTGCTTAATTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TTCGAGATTCAGGTGTTGTCTCACTTATTGAAACCTTGCTTAATTATCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TCCTCTAGAGTTAGGACAAGTTTTTTGGAAAATATGATTCACATGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TCCTCTAGAGTTAGGACAAGTTTTTTGGAAAATATGATTCACATGGCTCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 ACCTTATCCAAATCTAAACATGATTGAGACATTCATATGTCAAGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 ACCTTATCCAAATCTAAACATGATTGAGACATTCATATGTCAAGTGTGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AGGAAACCCTTGCACATAGTGTGGATTCCCTTGAGCAGCTGACTGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AGGAAACCCTTGCACATAGTGTGGATTCCCTTGAGCAGCTGACTGGAATA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 AGGATGCTTAGACACCTCACTATGACTATTGACTATCACACACTGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 AGGATGCTTAGACACCTCACTATGACTATTGACTATCACACACTGATTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CAACTATATGTCCGGGTTTCTCTCCTTATTAACCACAGCCAATGCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CAACTATATGTCCGGGTTTCTCTCCTTATTAACCACAGCCAATGCGAGAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 CGAAGTTTCACGTTCTGAAAATGCTATTGAATTTGTCTGAAAATCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 CGAAGTTTCACGTTCTGAAAATGCTATTGAATTTGTCTGAAAATCCTGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 GTGGCAAAAAAACTATTCAGTGCCAAAGCTCTTTCAATATTTGTGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 GTGGCAAAAAAACTATTCAGTGCCAAAGCTCTTTCAATATTTGTGGGTCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 CTTTAACATAGAAGAGACAAATGATAATATTCAAATTGTTATTAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CTTTAACATAGAAGAGACAAATGATAATATTCAAATTGTTATTAAAATGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 TTCAGAATATCAGTAACATTATAAAAAGTGGAAAGATGTCCTTAATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 TTCAGAATATCAGTAACATTATAAAAAGTGGAAAGATGTCCTTAATTGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 GATGATTTCAGTCTTGAGCCGCTTATTTCTGCATTTCGTGAATTTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 GATGATTTCAGTCTTGAGCCGCTTATTTCTGCATTTCGTGAATTTGAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 GTTAGCTAAGCAACTACAAGCCCAAATAGACAACCAAAATGATCCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 GTTAGCTAAGCAACTACAAGCCCAAATAGACAACCAAAATGATCCTGAGG

   2500     .    :
   2501 TGGGACAACAAAGT
        ||||||||||||||
 102501 TGGGACAACAAAGT